[發明專利]測序數據存儲方法、裝置、設備及計算機可讀存儲介質

有效

• 申請號: 202010062157.2
• 申請日: 2020-01-20
• 公開（公告）號: CN111261227B
• 公開（公告）日: 2022-06-17
• 發明（設計）人: 崔坤磊;劉羽;張敏;楊振宇;于占樂;李龍翔;王倩
• 申請（專利權）人: 蘇州浪潮智能科技有限公司
• 主分類號: G16B30/00
• 分類號: G16B30/00;G16B50/00
• 代理公司: 北京集佳知識產權代理有限公司 11227
• 代理人: 侯珊

本發明公開了一種測序數據存儲方法，該方法包括以下步驟：對接收到的測序處理項目請求進行解析，得到待測序處理項目中各分業務的業務處理順序信息；分別獲取各分業務對應的測序下機數據；按照業務處理順序信息分別將各分業務對應的測序下機數據發送到對應的第一級存儲或第二級存儲中進行處理操作，輸出處理結果；將各處理結果和對應的各測序下機數據發送到第三級存儲；其中，第一級存儲的性能高于第二級存儲，且第二級存儲的性能高于第三級存儲。應用本發明實施例所提供的技術方案，較大地提升了測序數據的處理效率。本發明還公開了一種測序數據存儲裝置、設備及存儲介質，具有相應技術效果。

技術領域

本發明涉及存儲技術領域，特別是涉及一種測序數據存儲方法、裝置、設備及計算機可讀存儲介質。

背景技術

測序即測定DNA、RNA序列的技術，一般叫做基因測序技術。具體來講，是指用雙脫氧鏈末端終止法或化學降解法分析特定序列片段的堿基，并最終獲得片段的堿基序列信息。測序數據處理泛指從測序儀得到測序數據后，對測序數據的一系列存儲、管理、分析等所有操作步驟。具體有測序數據的存儲、數據過濾與質量控制、序列比對、序列組裝、排序、去重復、突變檢測、結構變異檢測、基因注釋等操作步驟。

新一代測序的發展和推廣應用使生物序列數據增長迅速。研究人員將深入分析各種基因組數據的特點，針對性地研究高效數據壓縮和傳輸的方法，研究新型的數據存儲系統構架。研究在壓縮空間上進行數據處理的方法，將存儲、壓縮和處理、應用結合起來考慮，發展適應超大規模基因組數據的搜索方法。探索新的軟硬件模型和可能的新型體系結構，探索新的計算服務模型在測序數據存儲、傳輸和處理上的應用。現有的對測序數據的存儲是對測序數據進行統一存儲，影響測序數據的處理效率。

綜上所述，如何有效地解決對測序數據的存儲是對測序數據進行統一存儲，影響測序數據的處理效率的問題，是目前本領域技術人員急需解決的問題。

發明內容

本發明的目的是提供一種測序數據存儲方法，該方法較大地提升了測序數據的處理效率；本發明的另一目的是提供一種測序數據存儲裝置、設備及計算機可讀存儲介質。

為解決上述技術問題，本發明提供如下技術方案：

一種測序數據存儲方法，包括：

對接收到的測序處理項目請求進行解析，得到待測序處理項目中各分業務的業務處理順序信息；

分別獲取各所述分業務對應的測序下機數據；

按照所述業務處理順序信息分別將各所述分業務對應的測序下機數據發送到對應的第一級存儲或第二級存儲中進行處理操作，輸出處理結果；

將各所述處理結果和對應的各所述測序下機數據發送到第三級存儲；

其中，所述第一級存儲的性能高于所述第二級存儲，且所述第二級存儲的性能高于所述第三級存儲。

在本發明的一種具體實施方式中，按照所述業務處理順序信息分別將各所述分業務對應的測序下機數據發送到對應的第一級存儲或第二級存儲中進行處理操作，包括：

分別獲取各所述分業務的業務屬性信息；

根據各所述業務屬性信息分別判斷各所述分業務的處理操作是否需進行數據索引；

若是，則按照所述業務處理順序信息，分別將需進行數據索引的各所述分業務對應的預先發送到所述第二級存儲的測序下機數據調整到所述第一級存儲的數據處理分區中進行處理操作；其中，所述第一級存儲的數據存儲分區中預存有包含參考基因組數據和數據庫數據的待索引數據；

若否，則按照所述業務處理順序信息，分別將不需進行數據索引的各所述分業務對應的測序下機數據發送到所述第二級存儲中進行處理操作。

在本發明的一種具體實施方式中，將各所述處理結果發送到第三級存儲，包括：