[發明專利]細胞分割方法、裝置及計算機可讀存儲介質

有效

• 申請號: 202010061644.7
• 申請日: 2020-01-19
• 公開（公告）號: CN111275727B
• 公開（公告）日: 2021-09-07
• 發明（設計）人: 束劼;張永梅;高齊陽
• 申請（專利權）人: 北方工業大學
• 主分類號: G06T7/136
• 分類號: G06T7/136;G06T7/90
• 代理公司: 北京北匯律師事務所 11711
• 代理人: 李英杰

1.一種細胞分割方法，其特征在于，所述方法包括：

獲取原始圖像；

對所述原始圖像進行處理，得到圖像I_gray；

獲取所述原始圖像中細胞核的半徑估計值r；

獲取所述圖像I_gray對應的全局閾值T_g；

采用所述全局閾值T_g對所述圖像I_gray進行二值化處理，并對二值化以后的圖像提取邊緣像素點，獲得包含邊緣像素點的圖像I_edge；

以所述圖像I_gray為掩模，以所述圖像I_edge中的所述邊緣像素點為中心，半徑估計值r的2倍為邊長的正方形區域內計算局部閾值T_l；

對所述正方形區域內的像素點進行篩選，篩選的公式如下：

其中，f(p)是在正方形區域內的像素點的值，I(p)是I_gray圖像中的像素點值，T_l是所述局部閾值T_l，T_g是所述全局閾值T_g，otherwise是否則，篩選后的圖像為I_local；

對圖像I_local使用Isodata的自動閾值獲取方法獲取所述圖像I_local對應的全局閾值T_g2；

采用所述全局閾值T_g2對所述圖像I_local進行二值化處理，得到所述圖像I_CLT；

采用LoG算法對所述圖像I_gray進行處理，得到圖像I_LoG；

對所述圖像I_CLT和所述圖像I_LoG進行融合運算得到圖像I_fuse；

對所述圖像I_fuse進行細胞分割得到細胞核分割圖像。

2.根據權利要求1所述的細胞分割方法，其特征在于，對所述圖像I_CLT和所述圖像I_LoG進行融合運算得到所述圖像I_fuse包括：

對所述圖像I_CLT和所述圖像I_LoG進行或運算。

3.根據權利要求1所述的細胞分割方法，其特征在于，對所述圖像I_fuse進行細胞分割得到細胞核分割圖像包括：

獲取所述原始圖像中細胞核的半徑估計值r；

獲取所述原始圖像中的噪聲顆粒大小S_noise＝r×r/4；

獲取所述原始圖像中的超像素種子點的大小S_superseed＝r；

對所述圖像I_fuse使用基于最終腐蝕點的分水嶺算法進行拆分，從拆分后的顆粒中刪除小于所述噪聲顆粒大小S_noise的顆粒得到圖像I_watershed；

獲取所述圖像I_watershed中所述顆粒的中心點，對所述中心點進行膨脹，膨脹的大小限制為S_superseed個像素點，獲取超像素種子點；

對所述圖像I_watershed進行距離轉換得到圖像I_dis；

對圖像I_gray使用重建的開運算和重建的閉運算，獲得圖像I_m；

基于所述圖像I_m、所述圖像I_dis、所述超像素種子點進行一遍超像素分割得到細胞核分割圖像。