[發明專利]一種異地協同計算應用管理調度算法

在審

• 申請號: 202010056017.4
• 申請日: 2020-01-16
• 公開（公告）號: CN111240823A
• 公開（公告）日: 2020-06-05
• 發明（設計）人: 王海;黃國富;曲麗君;孫曉婷
• 申請（專利權）人: 青島農業大學
• 主分類號: G06F9/48
• 分類號: G06F9/48;G16B50/00
• 代理公司: 北京匯捷知識產權代理事務所(普通合伙) 11531
• 代理人: 馬金華

本發明公開了一種異地協同計算應用管理調度算法，位于不同地點的集群任務調度模塊從任務管理端讀取任務文件并加以分析，使用先進先出和短作業優先相結合的特殊算法，自動提取出標靶蛋白和小分子配體文件加載到Docking窗口中的靶點蛋白和配體文件相應選擇區域進行對接操作，一個對接流程結束后，自動將計算結果上傳到管理控制端并在任務調度文件中進行標記，然后重新向任務調度模塊申請下一次任務。本發明的有益效果是為科研人員提供海洋藥用生物資源的計算服務，提高藥品合成效率和質量，縮短藥品研制周期，降低生產成本。

技術領域

本發明屬于高性能計算HPC技術領域，涉及一種異地協同計算應用管理調度算法。

背景技術

異地協同計算因具有異地計算資源協同管理、高效便捷等特點，可為藥物設計提供新的思路，也為先導化合物的優化和生物學驗證提供了計算基礎，這對加快推進我國的海洋農業藥物研究有著重要的意義和迫切的需求。

發明內容

本發明的目的在于提供一種異地協同計算應用管理調度算法，本發明的有益效果是為科研人員提供海洋藥用生物資源的計算服務，提高藥品合成效率和質量，縮短藥品研制周期，降低生產成本。

本發明所采用的技術方案是位于不同地點的集群任務調度模塊從任務管理端讀取任務文件并加以分析，使用先進先出和短作業優先相結合的特殊算法，自動提取出標靶蛋白和小分子配體文件加載到Docking窗口中的靶點蛋白和配體文件相應選擇區域進行對接操作，一個對接流程結束后，自動將計算結果上傳到管理控制端并在任務調度文件中進行標記，然后重新向任務調度模塊申請下一次任務。

附圖說明

圖1是算法流程示意圖。

具體實施方式

下面結合具體實施方式對本發明進行詳細說明。

本發明異地協同計算應用管理調度算法如圖1所示，要實現分子對接的有序運行，任務調度模塊起著關鍵作用。位于不同地點的集群任務調度模塊從任務管理端讀取任務文件并加以分析，使用先進先出和短作業優先相結合的特殊算法，自動提取出標靶蛋白和小分子配體文件加載到“Docking”窗口中的靶點蛋白和配體文件相應選擇區域進行對接操作。一個對接流程結束后，自動將計算結果上傳到管理控制端并在任務調度文件中進行標記，然后重新向任務調度模塊申請下一次任務。整個過程Sybyl-X軟件的運行一直處于腳本程序的監控之下，軟件的所有交互操作均由腳本程序自動控制完成。

以上所述僅是對本發明的較佳實施方式而已，并非對本發明作任何形式上的限制，凡是依據本發明的技術實質對以上實施方式所做的任何簡單修改，等同變化與修飾，均屬于本發明技術方案的范圍內。