[發明專利]人類免疫缺陷病毒1型耐藥基因型檢測法及試劑盒有效
| 申請號: | 202010049859.7 | 申請日: | 2020-01-17 |
| 公開(公告)號: | CN111074004B | 公開(公告)日: | 2023-02-10 |
| 發明(設計)人: | 周素娟 | 申請(專利權)人: | 復旦大學 |
| 主分類號: | C12Q1/70 | 分類號: | C12Q1/70;C12Q1/6869;C12N15/11;C12R1/93 |
| 代理公司: | 上海科盛知識產權代理有限公司 31225 | 代理人: | 褚明偉 |
| 地址: | 200433 *** | 國省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 人類 免疫 缺陷 病毒 耐藥 基因型 檢測 試劑盒 | ||
1.用于檢測人類免疫缺陷病毒1型耐藥基因型的引物組,其特征在于,由引物A1、A2、A3、A4、B1、B2、B3、B4、C1、C2、C3、C4組成,
A1的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示;
A2的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示;
A3的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示;
A4的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示;
B1的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示;
B2的核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示;
B3的核苷酸序列如SEQ ID NO.7所示;
B4 的核苷酸序列如SEQ ID NO.8所示;
C1 的核苷酸序列如SEQ ID NO.9所示;
C2 的核苷酸序列如SEQ ID NO.10所示;
C3 的核苷酸序列如SEQ ID NO.11所示;
C4 的核苷酸序列如SEQ ID NO.12所示;
SEQ ID NO.1~12所示的核苷酸序列中的R為A/G,Y為C/T,B為G/T/C ,K 為G/T ,W為A/T,N為A/T/C/G;
其中,在常用的in-house基因型耐藥檢測HXB2株的pol基因擴增區域2243-3326nt之間設計引物分三段A區、B區、C區進行擴增,A區為2245-2583nt,B區為2615 -2951nt,C區為2880-3326nt,A1和A2、B1和B2、C1和C2分別為A區、B區、C區的巢式PCR第1輪的上下游引物,A3和A4、B3和B4、C3和C4分別為A區、B區、C區的巢式PCR第2輪的上下游引物,同時A3和A4、B3和B4、C3和C4也分別是A區、B區、C區的測序引物。
2.根據權利要求1所述用于檢測人類免疫缺陷病毒1型耐藥基因型的引物組,其特征在于,所述引物組能夠檢測的HIV-1亞型選自CRF01_AE、CRF07_BC、CRF08_BC、CRF_5501B、CRF_57BC、CRF_62_BC、 CRF_65cpx、CRF79_0107 、CRF_85_BC、CRF86_BC、CRF80_0107、CRF100_01C或CRF101_01B。
3.權利要求1或2所述用于檢測人類免疫缺陷病毒1型耐藥基因型的引物組的應用,其特征在于,所述引物組在制備HIV-1耐藥檢測試劑盒中的應用。
4.一種高效檢測人類免疫缺陷病毒1型耐藥基因型的試劑盒,其特征在于,所述試劑盒包括權利要求1或2所述用于檢測人類免疫缺陷病毒1型耐藥基因型的引物組。
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