[發明專利]一個與小麥產量相關的SNP位點及其應用

有效

• 申請號: 202010047777.9
• 申請日: 2020-01-16
• 公開（公告）號: CN111187852B
• 公開（公告）日: 2021-09-21
• 發明（設計）人: 張相岐;衛波;鐘永達;張琦;范仁春;王獻平
• 申請（專利權）人: 中國科學院遺傳與發育生物學研究所
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12N15/11
• 代理公司: 北京紀凱知識產權代理有限公司 11245
• 代理人: 關暢

本發明公開了一個與小麥產量相關的SNP位點及其應用。本發明公開的SNP位點為小麥基因組上位于3A染色體上的第549903090位的SNP位點C549903090G，即序列表中序列3自5’端起第415位核苷酸；所述C549903090G位點為C/G多態。本發明又基于該SNP位點開發了CAPS分子標記，并提供了一種鑒定待測小麥產量相關性狀的方法。本發明通過大量小麥材料進行實驗驗證發現：基因型為GG的待測小麥品種的產量和/或千粒重和/或穗粒數和/或小穗粒數和/或小穗數顯著高于基因型為CC的待測小麥品種的產量和/或千粒重和/或穗粒數和/或小穗粒數和/或小穗數。本發明對小麥分子標記輔助育種具有重要意義。

技術領域

本發明涉及生物技術領域，具體涉及一個與小麥產量相關的SNP位點及其應用。

背景技術

小麥是世界上主要的糧食作物之一，全世界35-40％的人口以小麥為主糧，因此，小麥產量直接關系到全世界的糧食安全。小麥總產量由播種面積和單位面積產量兩個因素構成。在當前耕地面積有限的情況下，提高單位面積產量是提高小麥總產的唯一途徑。

小麥單產由單位面積穗數、穗粒數和千粒重三個因素構成，協同提高上述三個因素對于提高小麥單位面積產量具有重要意義。因此挖掘與小麥產量性狀相關的優異等位變異，并且開發相應的功能標記對小麥分子標記輔助高產育種具有重要意義。

發明內容

本發明的第一個目的是提供檢測小麥基因組中位于3A染色體上的C549903090GSNP位點的多態性或基因型的物質的新用途。

本發明提供了檢測小麥基因組中位于3A染色體上的C549903090G SNP位點的多態性或基因型的物質在如下1)-6)中任一種中的應用：

1)鑒定或輔助鑒定小麥產量；

2)制備鑒定或輔助鑒定小麥產量的產品；

3)鑒定或輔助鑒定小麥千粒重和/或穗粒數和/或小穗粒數和/或小穗數；

4)制備鑒定或輔助鑒定小麥千粒重和/或穗粒數和/或小穗粒數和/或小穗數的產品；

5)小麥育種；

6)制備小麥育種的產品；

所述C549903090G SNP位點為序列表中序列3自5’端起第415位核苷酸；所述C549903090G SNP位點為C/G多態。

上述應用中，所述C549903090G SNP位點的基因型為CC或GG。

所述檢測小麥基因組中位于3A染色體上的C549903090G SNP位點的多態性或基因型的物質包括引物對和限制性內切酶Bgl II；

所述引物對由引物F和引物R組成；

所述引物F為如下a1)或a2)：

a1)序列表中序列1所示的單鏈DNA分子；

a2)將序列1經過一個或幾個核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且與序列1具有相同功能的單鏈DNA分子；

所述引物R為如下b1)或b2)：

b1)序列表中序列2所示的單鏈DNA分子；

b2)將序列2經過一個或幾個核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且與序列2具有相同功能的單鏈DNA分子。

本發明的第二個目的是提供一種鑒定或輔助鑒定小麥產量和/或千粒重和/或穗粒數和/或小穗粒數和/或小穗數的產品。

本發明提供的鑒定或輔助鑒定小麥產量和/或千粒重和/或穗粒數和/或小穗粒數和/或小穗數的產品包括上述檢測小麥基因組中位于3A染色體上的C549903090G SNP位點的多態性或基因型的物質。