[發明專利]用于鑒別新陸中系列棉花品種的多態性分子標記及其應用

有效

• 申請號: 202010046584.1
• 申請日: 2020-01-16
• 公開（公告）號: CN111041126B
• 公開（公告）日: 2022-05-03
• 發明（設計）人: 薛飛;李婧慧;金彥龍;孫杰;劉峰;張新宇;王靜
• 申請（專利權）人: 石河子大學
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12N15/11
• 代理公司: 合肥中谷知識產權代理事務所(普通合伙) 34146
• 代理人: 洪玲

本發明涉及一種用于鑒別新陸中系列棉花品種的多態性分子標記及其應用，屬于分子檢測技術領域，該發明利用篩選的29對多態性鑒別引物，實現了80種新陸中系列棉花品種的指紋圖譜構建和分子鑒定，該29對引物具有多態性高、穩定性好、操作簡單、準確性高、通用性好等優點；本發明僅需19對核心引物即可鑒別80種新陸中系列棉花品種。

技術領域

本發明屬于分子檢測技術領域，尤其涉及一種用于鑒別新陸中系列棉花品種的多態性分子標記及應用。

背景技術

棉花是富含纖維的重要經濟作物，新疆是我國棉花的主要產區，以50％左右的種植面積貢獻了近3/4的產量，在保障我國棉花生產安全中占有舉足輕重的地位。近年來，隨著棉花產業的快速發展，棉花種子市場“多、亂、混、雜”的現象日益嚴重，棉花品種同質化、品種套牌等問題突出，嚴重影響棉花產業的健康發展。此外，骨干親本的反復利用及轉基因技術在棉花育種中的應用導致品種間遺傳差異越來越小，僅依據傳統形態學手段鑒定品種的純度和真實性耗時長、成本高、時效性差，且易受環境因素影響，難以滿足品種鑒定需求。因此，加強檢測技術創新，為種子質量鑒定提供高效技術手段極為必要。

分子標記技術的飛速發展成為品種鑒定和種子純度真實性檢測的新選擇，以分子標記技術為基礎的DNA指紋圖譜，不僅可以鑒別棉花品種的真假，還可以分析棉花種質資源遺傳多樣性及親緣關系等。目前關于新疆陸地棉品種指紋圖譜的研究大多針對特早熟和早熟棉花品種，早中熟陸地棉品種的指紋圖譜構建還有待完善。本發明選用80個新陸中棉花品種材料，利用SSR和InDel分子標記構建其指紋圖譜，為今后棉花品種DNA指紋鑒定提供技術支持。

SSR(Simple Sequence Repeats，簡單重復序列)標記是指：均勻分布于真核生物基因組中的簡單重復序列，由2-6個核苷酸的串聯重復片段構成，由于重復單位的重復次數在個體間呈高度變異性并且數量豐富。InDel(Insertion-Deletion，插入缺失)標記是指：兩種親本中在全基因組中存在差異，相對另一個親本而言，其中一個親本的基因組中有一定數量的核苷酸插入或缺失，從而根據基因組中插入缺失位點，設計一些擴增這些插入缺失位點的PCR引物。

發明內容

本發明的目的就在于為了解決上述問題，而提供一種用于鑒別新陸中系列棉花品種的多態性分子標記及應用，以構建獲得能夠鑒別新陸中系列棉花品種的DNA指紋圖譜，為新陸中系列棉花品種的分子檢測和育種提供新的實用標記和方法。

本發明通過以下技術方案來實現上述目的：

本發明提供了一種鑒別新陸中系列棉花品種的多態性分子標記，所述多態性分子標記為由29對多態性鑒別引物中的一種或多種的組合引物組成，所述29對多態性鑒別引物的序列如下所示：

作為本發明進一步的優化方案，所述新陸中系列棉花品種為新陸中1-12、14-22、25-30、32-50、54-69、71-88號品種，對應的多態性分子標記為多態性標記特征引物或多態性標記組合引物，具體為：

鑒別新陸中1號品種的多態性標記組合引物為W01、HAU2786、NAU1233；

鑒別新陸中2號品種的多態性標記特征引物為DPL0757；

鑒別新陸中3號品種的多態性標記組合引物為HAU0732、W01；

鑒別新陸中4號品種的多態性標記特征引物為NAU1221；NAU1042；NAU1269；

鑒別新陸中5號品種的多態性標記組合引物為HAU0732、W01；HAU0732、JESPR0101；

鑒別新陸中6號品種的多態性標記組合引物為BNL3442、HAU2786；BNL3442、W01；

鑒別新陸中7號品種的多態性標記組合引物為JESPR0101、DPL0542；