[發明專利]一種與雜交黃顙魚“黃優1號”耐低氧性狀相關的SNP分子標記及其應用

在審

• 申請號: 202010036854.0
• 申請日: 2020-01-14
• 公開（公告）號: CN111187843A
• 公開（公告）日: 2020-05-22
• 發明（設計）人: 尹紹武;王宏玉;王濤;張凱;暨杰;武兆文
• 申請（專利權）人: 南京師范大學
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;C12N15/11
• 代理公司: 南京蘇高專利商標事務所(普通合伙) 32204
• 代理人: 鄭立發

1.一種與雜交黃顙魚“黃優1號”耐低氧性狀相關的SNP分子標記，其特征在于，所述SNP分子標記的序列如SEQ ID NO:1所示，所述SNP分子標記位于所述SEQ ID NO：1所示序列的第495位，堿基為T或A。

2.根據權利要求1所述的與雜交黃顙魚“黃優1號”耐低氧性狀相關的SNP分子標記，其特征在于，SNP位點的TT基因型個體耐低氧能力顯著高于AA基因型個體。

3.一種用于檢測權利要求1或2所述的SNP分子標記的引物對，其特征在于，包括正向引物、反向引物，所述引物對的核苷酸序列分別如下所示：

正向引物：5’-TGAAGAGTCCGAGCGATT-3’，如SEQ ID NO:2所示。

反向引物：5’-ACTGCGAGGAGGATGAAC-3’，如SEQ ID NO:3所示。

4.一種用于檢測權利要求1或2所述的SNP分子標記的試劑盒，其特征在于，包含權利要求3所述的引物對。

5.權利要求1或2所述的SNP分子標記、權利要求3所述的引物對或權利要求4所述的試劑盒在雜交黃顙魚“黃優1號”輔助耐低氧苗種篩選中的應用。

6.一種檢測雜交黃顙魚“黃優1號”耐低氧性狀的方法，其特征在于，包括通過對待測雜交黃顙魚“黃優1號”進行權利要求1或2所述的SNP分子標記的檢測，確定所述待測雜交黃顙魚“黃優1號”的耐低氧能力。

7.根據權利要求6所述的檢測雜交黃顙魚“黃優1號”耐低氧性狀的方法，其特征在于，包括提取待測雜交黃顙魚“黃優1號”的基因組DNA，利用權利要求3所述的引物對或權利要求4所述的試劑盒進行PCR擴增，檢測其SNP位點的基因型是TT、TA還是AA，最后進行不同基因型與雜交黃顙魚“黃優1號”耐低氧性狀的相關性分析，所述耐低氧能力為低氧條件下存活的時間。

8.根據權利要求7所述的檢測雜交黃顙魚“黃優1號”耐低氧性狀的方法，其特征在于，所述SNP位點的TT基因型個體耐低氧能力顯著高于AA基因型個體。