[發(fā)明專利]稻瘟病抗性基因Pib的功能特異性分子標(biāo)記及其檢測方法與應(yīng)用

在審

• 申請?zhí)枺?/td>: 202010032359.2
• 申請日: 2020-01-13
• 公開（公告）號(hào): CN111218521A
• 公開（公告）日: 2020-06-02
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 楊德衛(wèi);唐定中;李生平
• 申請（專利權(quán)）人: 福建農(nóng)林大學(xué)
• 主分類號(hào): C12Q1/6895
• 分類號(hào): C12Q1/6895;C12N15/11
• 代理公司: 福州科揚(yáng)專利事務(wù)所 35001
• 代理人: 何小星

1.稻瘟病抗性基因Pib的功能特異性分子標(biāo)記，其特征在于：稻瘟病抗性基因Pib功能特異性分子標(biāo)記為Pib-InDel；所述Pib-InDel是通過引物對SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2從攜帶有稻瘟病抗性基因Pib的水稻品種的基因組DNA中擴(kuò)增出來得到與稻瘟病抗性基因Pib呈特異性帶型的分子標(biāo)記；其中，

SEQ ID NO.1：5’-TATGAGACTGCCTGGGAGGAA-3’；

SEQ ID NO.2：5’-TCCATTATAATATAGGATAGT-3’。

2.如權(quán)利要求1所述的稻瘟病抗性基因Pib的功能特異性分子標(biāo)記，其特征在于：所述攜帶有稻瘟病抗性基因Pib的水稻品種為水稻抗病品種IR24。

3.如權(quán)利要求2所述的稻瘟病抗性基因Pib的功能特異性分子標(biāo)記，其特征在于：所述稻瘟病抗性基因Pib包括部分編碼NBS-LRR類蛋白的基因片段SEQ ID NO.3：

TATGAGACTGCCTGGGAGGAAGAGGTACAGGAAGCAAGGCGCAAGGGAGGTGAACTGAAGAGGAAAATCCGAGAACAGCTTGCTCGGAATCCAAACCAACCCATCATTACCTGAGCTCCTTTGGAGTTACTTTGCCGTGCTCCATACTATCCTACAAGTGAGATCCTCTGCAGTACTGCATGCTCACTGACATGTGGACCCGAGGGGCTGTGGGGCCCACATGTCAGTGAGCAGTACTGTGCAGTACTGCAGAGGACCTGCATCCACTATCCTATATTATAATGGA。

4.權(quán)利要求1至3任一項(xiàng)所述的稻瘟病抗病基因Pib的功能特異性分子的檢測方法，其特征在于，具體包含以下步驟：

A1、從公共數(shù)據(jù)庫中下載得到的Pib及其同源的基因組序列以及測序品種日本晴和9311相對應(yīng)區(qū)域的基因組序列，針對Pib位點(diǎn)進(jìn)行序列比對，篩查Pib特異的、能區(qū)別于該位點(diǎn)其他稻瘟病等位抗性基因的插入/缺失InDel位點(diǎn)；

A2、利用步驟(1)獲得的InDel位點(diǎn)信息，在所述InDel位點(diǎn)處設(shè)計(jì)基因特異性引物；

A3、以攜帶有稻瘟病抗性基因Pib的稻瘟病抗性品種的總DNA為模板，進(jìn)行PCR擴(kuò)增，所獲得的PCR產(chǎn)物即為稻瘟病抗性基因Pib基因特異性分子標(biāo)記Pib-InDel。

5.權(quán)利要求1至3任一項(xiàng)所述的稻瘟病抗病基因Pib的功能特異性分子在鑒別水稻品種稻瘟病抗性基因的應(yīng)用。

6.如權(quán)利要求5所述的稻瘟病抗病基因Pib的功能特異性分子在鑒別水稻品種稻瘟病抗性基因的應(yīng)用，其特征在于，具體包含以下步驟：

B1、擴(kuò)增：利用SEQ ID NO.1所示的引物F1和SEQ ID NO.2所示的引物R1對待檢測的水稻品種的基因組進(jìn)行PCR；

B2、檢測：利用瓊脂糖電泳檢測，若檢測到分子量大小為286bp的核苷酸片段，則待檢測的水稻品種攜帶有稻瘟病抗性基因Pib；若沒有檢測到分子量大小為286bp的核苷酸片段，則待檢測的水稻品種不攜帶稻瘟病抗性基因Pib。

7.一種鑒別水稻品種稻瘟病抗性的試劑盒，其特征在于：核酸序列如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示的引物對。