[發明專利]檢測Botryosphaeria sinensia的LAMP引物及試劑盒有效
| 申請號: | 202010019764.0 | 申請日: | 2020-01-08 |
| 公開(公告)號: | CN111041123B | 公開(公告)日: | 2022-07-08 |
| 發明(設計)人: | 張英;王宇 | 申請(專利權)人: | 北京林業大學 |
| 主分類號: | C12Q1/6895 | 分類號: | C12Q1/6895;C12Q1/6844;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/645 |
| 代理公司: | 北京市京大律師事務所 11321 | 代理人: | 李洪群 |
| 地址: | 100083 *** | 國省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 檢測 botryosphaeria sinensia lamp 引物 試劑盒 | ||
1.用于檢測藍莓莖潰瘍病病菌Botryosphaeria sinensia的LAMP引物組,其特征在于,所述LAMP引物組為:
外側正向引物F3:5’-AAGATCGACCGCCGTACC-3’;
外側反向引物B3:5’-GCGACAGTTTGCCTTGGAA-3’;
內側正向引物FIP:5’-CACATGGGCTTGGAGGGAATCATCCCCAAGTTCATCAAGTCCG-3’;
內側反向引物BIP:5’-CTCTTGGCCGTTTCGCCGTAGCACGATGAAGTTCGGAG-3’。
2.含有權利要求1所述LAMP引物組的檢測試劑或試劑盒。
3.藍莓莖潰瘍病病菌Botryosphaeria sinensia檢測試劑盒,其特征在于,所述試劑盒包含權利要求1所述LAMP引物組,還包含dNTPs、BstDNA聚合酶、反應緩沖液、標準陽性模板中的至少一種。
4.權利要求1所述LAMP引物組、權利要求2所述檢測試劑或試劑盒,或權利要求3所述檢測試劑盒在檢測藍莓莖潰瘍病病菌Botryosphaeria sinensia中的應用。
5.藍莓莖潰瘍病病菌Botryosphaeria sinensia檢測方法,其特征在于,包括以下步驟:
1)提取待測樣品中的DNA;
2)以步驟1)中提取的DNA為模板,利用權利要求1所述LAMP引物組進行LAMP擴增反應;
3)擴增結果判定。
6.根據權利要求5所述的方法,其特征在于,步驟2)所用反應體系為:
其中,所述反應體系中引物FIP和BIP按等量加入,引物F3和B3按等量加入,且引物FIP、BIP與引物F3、B3的總質量比為8:1。
7.根據權利要求5所述的方法,其特征在于,步驟2)所用反應條件為:61~65℃ 50~90分鐘。
8.根據權利要求5-7任一項所述的方法,其特征在于,步驟3)采用如下①~③中的任一種方法進行擴增結果判定:
①熒光染色法:向擴增產物中加入染料SYBR GreenⅠ,進行顯色反應,若反應體系由橙色變為綠色,表明待測樣品中含有藍莓莖潰瘍病病菌Botryosphaeria sinensia;或者,在擴增反應前向反應體系中加入鈣黃綠素,擴增反應結束后,在紫外燈照射下反應體系顯示熒光綠色,表明待測樣品中含有藍莓莖潰瘍病病菌Botryosphaeria sinensia;或者,在擴增反應前向反應體系中加入羥基萘酚藍,擴增反應結束后,若反應體系由紫色變為天藍色,表明待測樣品中含有藍莓莖潰瘍病病菌Botryosphaeria sinensia;
②瓊脂糖凝膠電泳法:若擴增產物在瓊脂糖凝膠上呈現特征性梯狀條帶,表明待測樣品中含有藍莓莖潰瘍病病菌Botryosphaeria sinensia;
③焦磷酸鎂濁度檢測法:通過肉眼觀察反應后的渾濁情況來判斷是否發生了LAMP擴增反應,或利用濁度儀檢測其在400nm處的吸光度,實現實時定量檢測。
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