[發(fā)明專利]檢測Botryosphaeria fabicerciana的LAMP引物及試劑盒

有效

• 申請?zhí)枺?/td>: 202010019763.6
• 申請日: 2020-01-08
• 公開（公告）號: CN111020057B
• 公開（公告）日: 2022-07-05
• 發(fā)明（設計）人: 張英;王宇
• 申請（專利權）人: 北京林業(yè)大學
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12Q1/6844;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/645
• 代理公司: 北京市京大律師事務所 11321
• 代理人: 李洪群

1.用于檢測藍莓莖潰瘍病病菌Botryosphaeria fabicerciana的LAMP引物組，其特征在于，所述LAMP引物組為：

外側正向引物F3：5’-AAGATCGACCGCCGTACC-3’；

外側反向引物B3：5’-CGACAGTTTGCCTTGGAAAC-3’；

內側正向引物FIP：5’-CGCACATGGGCTTAGAGGGAATCCCCAAGTTCATCAAGTCCG-3’；

內側反向引物BIP：5’-TACCCCCCTCTTGGCCGTTTACGATGATCAAGGGTGGAAG-3’。

2.含有權利要求1所述LAMP引物組的檢測試劑或試劑盒。

3.藍莓莖潰瘍病病菌Botryosphaeria fabicerciana檢測試劑盒，其特征在于，所述試劑盒包含權利要求1所述LAMP引物組，還包含dNTPs、BstDNA聚合酶、反應緩沖液、標準陽性模板中的至少一種。

4.權利要求1所述LAMP引物組、權利要求2所述檢測試劑或試劑盒，或權利要求3所述檢測試劑盒在檢測藍莓莖潰瘍病病菌Botryosphaeria fabicerciana中的應用。

5.藍莓莖潰瘍病病菌Botryosphaeria fabicerciana檢測方法，其特征在于，包括以下步驟：

1)提取待測樣品中的DNA；

2)以步驟1)中提取的DNA為模板，利用權利要求1所述LAMP引物組進行LAMP擴增反應；

3)擴增結果判定。

6.根據(jù)權利要求5所述的方法，其特征在于，步驟2)所用反應體系為：

ddH₂O補足至25μl；

其中，所述反應體系中引物FIP和BIP按等量加入，引物F3和B3按等量加入，且引物FIP、BIP與引物F3、B3的總質量比為8:1。

7.根據(jù)權利要求5所述的方法，其特征在于，步驟2)所用反應條件為：61～65℃ 50～90分鐘。

8.根據(jù)權利要求5-7任一項所述的方法，其特征在于，步驟3)采用如下①～③中的任一種方法進行擴增結果判定：

①熒光染色法：向擴增產物中加入染料SYBR Green Ⅰ，進行顯色反應，若反應體系由橙色變?yōu)榫G色，表明待測樣品中含有藍莓莖潰瘍病病菌Botryosphaeria fabicerciana；或者，在擴增反應前向反應體系中加入鈣黃綠素，擴增反應結束后，在紫外燈照射下反應體系顯示熒光綠色，表明待測樣品中含有藍莓莖潰瘍病病菌Botryosphaeria fabicerciana；或者，在擴增反應前向反應體系中加入羥基萘酚藍，擴增反應結束后，若反應體系由紫色變?yōu)樘焖{色，表明待測樣品中含有藍莓莖潰瘍病病菌Botryosphaeria fabicerciana；

②瓊脂糖凝膠電泳法：若擴增產物在瓊脂糖凝膠上呈現(xiàn)特征性梯狀條帶，表明待測樣品中含有藍莓莖潰瘍病病菌Botryosphaeria fabicerciana；

③焦磷酸鎂濁度檢測法：通過肉眼觀察反應后的渾濁情況來判斷是否發(fā)生了LAMP擴增反應，或利用濁度儀檢測其在400nm處的吸光度，實現(xiàn)實時定量檢測。