[發明專利]石蒜屬植物熒光EST-SSR分子標記及其應用有效
| 申請號: | 202010013682.5 | 申請日: | 2020-01-07 |
| 公開(公告)號: | CN111118194B | 公開(公告)日: | 2022-04-08 |
| 發明(設計)人: | 李青竹;蔡友銘;張永春;楊柳燕;許俊旭;孫翊;李心;周曉慧;王楨 | 申請(專利權)人: | 上海市農業科學院 |
| 主分類號: | C12Q1/6895 | 分類號: | C12Q1/6895;C12Q1/686;C12N15/11 |
| 代理公司: | 北京高沃律師事務所 11569 | 代理人: | 瞿曉晶 |
| 地址: | 201106 *** | 國省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 石蒜 植物 熒光 est ssr 分子 標記 及其 應用 | ||
1.一種檢測石蒜屬植物熒光EST-SSR分子標記來鑒別石蒜種的方法,所述方法包括進行PCR反應,PCR反應后,采用毛細管電泳法進行熒光檢測;所述PCR的引物為如SEQ ID NO.5所示核苷酸序列5’端標記HEX的正向引物QZ209 F和如SEQ ID NO.6所示核苷酸序列的反向引物QZ209 R;所述石蒜種為12個,包括長筒石蒜、黃長筒石蒜、中國石蒜、石蒜、玫瑰石蒜、紅藍石蒜、湖北石蒜、乳白石蒜、陜西石蒜、換錦花、香石蒜和短蕊石蒜。
2.一種檢測一組石蒜屬植物熒光EST-SSR分子標記來鑒別石蒜種的方法,所述方法包括進行PCR反應,PCR反應后,采用毛細管電泳法進行檢測;所述PCR的引物由:
如SEQ ID NO.5所示核苷酸序列5’端標記HEX的正向引物QZ209 F和如SEQ ID NO.6所示核苷酸序列的反向引物QZ209 R;
如SEQ ID NO.7所示核苷酸序列5’端標記HEX的正向引物QZ155 F和如SEQ ID NO.8所示核苷酸序列的反向引物QZ155 R;
如SEQ ID NO.9所示核苷酸序列5’端標記FAM的正向引物QZ175 F和如SEQ ID NO.10所示核苷酸序列的反向引物QZ175 R;
和如SEQ ID NO.11所示核苷酸序列5’端標記HEX的正向引物QZ171 F和如SEQ IDNO.12所示核苷酸序列的反向引物QZ171 R組成;
所述石蒜種為16個,包括長筒石蒜、黃長筒石蒜、忽地笑、中國石蒜、石蒜、玫瑰石蒜、紅藍石蒜、湖北石蒜、稻草石蒜、粉稻草石蒜、乳白石蒜、陜西石蒜、換錦花、鹿蔥、香石蒜和短蕊石蒜。
3.根據權利要求1或2所述的方法,其特征在于,所述鑒別的PCR反應體系每25μL包括:基因組DNA 1~5μL,3~4 pmol正向引物和反向引物各0.5μL,10 mM dNTP 0.5μL,10×PCRBuffer 2.5μL,25 mM MgCl2 2μL,5UμL-1 Taq 酶0.2μL,加ddH2O補足25μL;
PCR程序為:95℃預變性3 min;95℃變性30 s,55~60℃退火30 s,72℃延伸30 s,10個循環;95℃變性30 s,58℃退火30 s,72℃延伸30 s,10個循環;72℃延伸6 min,4℃保存。
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