[發明專利]在多核苷酸鏈上編碼數據的方法

在審

• 申請號: 201980080696.4
• 申請日: 2019-12-20
• 公開（公告）號: CN113167784A
• 公開（公告）日: 2021-07-23
• 發明（設計）人: 克萊夫·加文·布朗;安德魯·約翰·赫倫;詹姆斯·愛德華·格拉哈姆
• 申請（專利權）人: 牛津納米孔科技公司
• 主分類號: G01N33/487
• 分類號: G01N33/487;G16B30/20;B82Y10/00;G11C13/00;C12Q1/6869
• 代理公司: 北京同立鈞成知識產權代理有限公司 11205
• 代理人: 楊貝貝;臧建明

1.一種在多核苷酸鏈上編碼數據的方法，其包含：

(A)使所述多核苷酸鏈相對于納米反應器移動；和

(B)當所述多核苷酸鏈的部分移動通過所述納米反應器時選擇性修飾所述部分；

其中在所述多核苷酸鏈上的選擇性修飾的模式在鏈上編碼數據。

2.根據權利要求1所述的方法，其中所述多核苷酸鏈的選擇性修飾的所述部分為所述多核苷酸鏈的序列部分。

3.根據權利要求1或權利要求2所述的方法，其中選擇性修飾所述多核苷酸鏈的部分不更改所述多核苷酸鏈的總長度。

4.根據權利要求1至3中任一項所述的方法，其中選擇性修飾所述多核苷酸鏈的部分不包含向所述多核苷酸鏈中添加單體單元或從所述多核苷酸鏈中去除所述單體單元。

5.根據前述權利要求中任一項所述的方法，其中所述多核苷酸鏈的選擇性修飾的所述部分對應于由此編碼的數據單元。

6.根據前述權利要求中任一項所述的方法，其中在所述納米反應器中所述多核苷酸鏈的選擇性修飾的所述部分包含：

-1至約1000個核苷酸；或

-1至約100個核苷酸；或

-1至約10個核苷酸。

7.根據前述權利要求中任一項所述的方法，其包含當所述多核苷酸鏈的約10¹至約10⁹個部分移動通過所述納米反應器時選擇性修飾所述部分。

8.根據前述權利要求中任一項所述的方法，其包含相對于所述納米反應器連續移動所述多核苷酸鏈，同時當所述多核苷酸鏈的所述部分移動通過所述納米反應器時選擇性修飾所述部分。

9.根據權利要求6所述的方法，其包含相對于所述納米反應器以恒定速率移動所述多核苷酸鏈，并且當所述多核苷酸鏈移動通過所述納米反應器時以規則或不規則的頻率向所述多核苷酸鏈施加反應條件。

10.根據權利要求6所述的方法，其包含相對于所述納米反應器以可變速率移動所述多核苷酸鏈，并且當所述多核苷酸鏈移動通過所述納米反應器時以規則或不規則的頻率向所述多核苷酸鏈施加反應條件。

11.根據權利要求1至5中任一項所述的方法，其包含中斷所述多核苷酸鏈相對于所述納米反應器的移動，同時當所述多核苷酸鏈的所述部分移動通過所述納米反應器時選擇性修飾所述部分。

12.根據前述權利要求中任一項所述的方法，其中選擇性修飾所述多核苷酸鏈的部分包含選擇性控制在所述多核苷酸鏈的每個部分內修飾的核苷酸的數量。

13.根據前述權利要求中任一項所述的方法，其中選擇性修飾所述多核苷酸鏈的部分包含選擇性控制對在所述多核苷酸鏈的每個部分內修飾的所述核苷酸進行的所述修飾的程度。

14.根據前述權利要求中任一項所述的方法，其中所述納米反應器包含納米孔。

15.根據權利要求12所述的方法，其中所述納米反應器包含所述納米孔的內部體積或所述納米孔的所述內部體積的一部分。

16.根據前述權利要求中任一項所述的方法，其中所述納米反應器包含圍繞納米孔的納米體積。

17.根據權利要求14所述的方法，其中所述納米體積包含從所述納米孔的一個或多個開口延伸至約30nm的體積。