[發明專利]包含雜聚物的流動池

有效

• 申請號: 201980042078.0
• 申請日: 2019-12-19
• 公開（公告）號: CN112673034B
• 公開（公告）日: 2023-03-28
• 發明（設計）人: 韋恩·N·喬治;盧多維克·文森特;安德魯·A·布朗;馬蒂厄·萊薩德-瓦伊格
• 申請（專利權）人: 伊魯米那股份有限公司;伊魯米納劍橋有限公司
• 主分類號: C08F220/56
• 分類號: C08F220/56;C12Q1/6874;C08F220/20;C08F220/60;C08F230/06;B01L3/00
• 代理公司: 北京安信方達知識產權代理有限公司 11262
• 代理人: 牟靜芳;鄭霞

流動池包括支撐物和附接至支撐物的雜聚物。雜聚物包括包含與附接至引物的官能團反應的附接基團的丙烯酰胺單體和包含刺激響應性官能團的單體。包含刺激響應性官能團的單體可以是pH響應性的、溫度響應性的、糖響應性的、親核體響應性的和/或鹽響應性的。

相關申請的交叉引用

本申請要求于2019年1月14日提交的美國臨時申請序列號62/792,250的權益，該美國臨時申請的內容通過引用以其整體并入本文。

背景

生物陣列是用于檢測和分析分子的多種工具之一，所述分子包括脫氧核糖核酸(DNA)和核糖核酸(RNA)。在這些應用中，陣列被設計成包括用于在人類和其他生物體的基因中存在的核苷酸序列的探針。例如，在某些應用中，單獨的DNA探針和RNA探針可以附接在陣列支撐物上的呈幾何網格(或隨機)的位置處。例如來自人或生物體的測試樣品可以暴露于網格，使得互補片段在陣列中的單獨位點處與探針雜交。然后可以通過將特定頻率的光在位點上掃描以通過片段所雜交的位點的熒光識別出樣品中存在哪些片段來檢查陣列。

生物陣列可以用于基因測序。一般來說，基因測序涉及確定在一段遺傳物質(諸如DNA或RNA的片段)中的核苷酸或核酸的順序。越來越長的堿基對序列正在被分析，并且得到的序列信息可以用于多種生物信息學方法中，以將片段邏輯地擬合在一起，以便可靠地確定片段所衍生自的廣泛長度的遺傳物質的序列。已經開發了自動化的基于計算機的特征片段的檢查，并且已經被用于基因組作圖、基因及其功能的識別、某些狀況和疾病狀態的風險評估等。除了這些應用之外，生物陣列還可以用于檢測和評估寬范圍的分子、分子家族、基因表達水平、單核苷酸多態性和基因分型。

概述

本文公開的一個方面是一種可切換雜聚物(switchable heteropolymer)，該可切換雜聚物包括：包含刺激響應性官能團(stimuli-responsive functional group)的多于一種單體，其中刺激響應性官能團選自由以下組成的組：pH響應性官能團、溫度響應性官能團、糖響應性官能團、親核體響應性官能團和鹽響應性官能團。

刺激響應性官能團當暴露于預定的刺激時能夠經歷修飾，其中修飾改變可切換雜聚物的極性和/或構象。

在一些方面中，可切換雜聚物還包括接枝至其的引物。

在一些方面中，刺激響應性官能團不是疊氮基基團。

在一些方面中，可切換雜聚物包括兩種或更多種不同的刺激響應性單體，該刺激響應性單體響應于相同或不同的刺激。

在一些方面中，可切換雜聚物是包含多于一種任選地含有疊氮基基團的丙烯酰胺單體的共聚物。在這些方面的一個方面中，丙烯酰胺單體是疊氮基乙酰胺基戊基丙烯酰胺單體或者是疊氮基乙酰胺基戊基丙烯酰胺單體和第二丙烯酰胺單體的組合。

在一些方面中，可切換雜聚物包括任選地包含疊氮基基團的糖單體(sugarmonomer)。

在一些方面中，pH響應性官能團選自由以下組成的組：被保護為縮醛、半縮醛或縮酮的羥基、1,2-二醇、1,3-二醇，叔丁氧基羰基氨基基團，9H-芴-9-基甲氧羰基氨基基團，氨基基團，羧酸酯/鹽基團，羧酸基團，磺酸酯/鹽基團和磺酸基團。

在其他方面中，糖響應性官能團(saccharide-responsive functional group)包括硼酸基團。

在還其他方面中，親核體響應性官能團具有以下結構：

其中：(a)Y是SO₂并且Y’是CH₂；或者(b)Y和Y’兩者均是C(O)。

在又另外的方面中，鹽響應性官能團是表現出反聚電解質(antipolyelectrolyte)行為的兩性離子官能團。