[發(fā)明專利]分析前基底處理的系統(tǒng)和方法

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• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 201980041176.2
• 申請(qǐng)日: 2019-06-21
• 公開（公告）號(hào): CN112534237A
• 公開（公告）日: 2021-03-19
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 楊金龍;袁謝安玫;李振威;加百列·耶穌·塞繆爾·佩拉斯·莫拉萊達(dá);喬納森·M·卡塞爾
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 基美健有限公司
• 主分類號(hào): G01N1/28
• 分類號(hào): G01N1/28;G01N1/06;G01N33/483;G01N1/04
• 代理公司: 中科專利商標(biāo)代理有限責(zé)任公司 11021
• 代理人: 柴云峰;張瑩

1.一種處理用于生物學(xué)測(cè)定的生物學(xué)樣品的方法，包括(a)在足以實(shí)現(xiàn)使生物樣品中的成分至少部分地轉(zhuǎn)移到接觸介質(zhì)的條件下，使生物樣品與包含顆粒物質(zhì)和壓縮氣體的接觸介質(zhì)接觸；和(b)從所述生物樣品中除去接觸介質(zhì)。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其中，對(duì)所述生物樣品進(jìn)行處理以分析一種或更多種診斷目的分析物。

3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其中，所述生物樣品包括穿孔活檢樣本、針狀活檢樣本、新鮮組織、組織培養(yǎng)物、冷凍組織樣本、經(jīng)中性福爾馬林處理的組織、器官、細(xì)胞器、福爾馬林固定的石蠟包埋(FFPE)組織、乙醇固定的石蠟包埋(EFPE)組織、蘇木精和曙紅(HE)染色的組織或戊二醛固定的組織。

4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，包括使所述生物樣品中的目標(biāo)區(qū)域(ROI)、非目標(biāo)區(qū)域(RONI)或所有區(qū)域與所述接觸介質(zhì)接觸；優(yōu)選地，使目標(biāo)區(qū)域(ROI)與所述接觸介質(zhì)接觸。

5.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其中所述生物樣品包括至少一種診斷目的分析物，所述分析物選自基因組DNA(gDNA)、甲基化DNA、特定甲基化DNA、信使RNA(mRNA)、片段化DNA、片段化RNA、片段化mRNA、線粒體DNA(mtDNA)、葉綠體DNA(ctDNA)、病毒RNA或病毒DNA、微小RNA、核糖體RNA、原位PCR產(chǎn)物、polyAmRNA、RNA/DNA雜合體、脂質(zhì)、碳水化合物、蛋白質(zhì)、糖蛋白、脂蛋白、磷蛋白、蛋白質(zhì)的特定磷酸化或乙酰化變體、或病毒外殼蛋白；優(yōu)選選自mRNA、gDNA、病毒DNA或病毒RNA的核酸。

6.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其中，所述噴砂介質(zhì)中的顆粒物質(zhì)包括氧化鋁；二氧化硅；金屬基顆粒；磁性或鐵磁性顆粒或其組合。

7.根據(jù)權(quán)利要求6中任一項(xiàng)所述的方法，其中，所述顆粒物質(zhì)能夠結(jié)合生物樣品中的分析物或非分析物；優(yōu)選地，顆粒物質(zhì)能夠通過選自離子相互作用、極性-非極性相互作用、疏水相互作用、范德華相互作用、化學(xué)偶聯(lián)、介電或兩性離子相互作用或其組合的相互作用結(jié)合分析物。

8.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其中，所述接觸介質(zhì)包括選自壓縮的氦、氬、氙、氮、二氧化碳或其組合的壓縮氣體。

9.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其中，所述生物樣品被安裝在基底上，例如基底選自玻璃、硅、聚-L-賴氨酸包被的材料、硝化纖維素、聚苯乙烯、環(huán)烯烴共聚物(COC)、環(huán)烯烴聚合物(COP)、聚丙烯、聚乙烯，和/或聚碳酸酯。

10.根據(jù)權(quán)利要求9所述的方法，其中，所述生物樣品包括核酸分析物，并且所述接觸介質(zhì)包括包含二氧化硅的顆粒物質(zhì)。

11.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，還包括顯微切割，例如激光顯微切割。

12.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其中，通過以下方式從所述生物樣品中除去所述接觸介質(zhì)：真空處理、壓差或梯度、重力、傳輸介質(zhì)(例如，液體或氣溶膠或氣體)、或選自磁場(chǎng)或電場(chǎng)的傳遞介質(zhì)。

13.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，包括：(a)使生物樣品中的非目標(biāo)區(qū)域(RONI)與接觸介質(zhì)選擇性接觸，其中選擇性接觸優(yōu)選包括使生物樣品中的目標(biāo)區(qū)域(ROI)保持不接觸；(b)使生物樣品中的目標(biāo)區(qū)域(ROI)與接觸介質(zhì)選擇性接觸，其中所述選擇性接觸優(yōu)選包括使生物樣品中的非目標(biāo)區(qū)域(RONI)保持不接觸；或(c)使生物樣品中的ROI和RONI都與接觸介質(zhì)接觸。

14.根據(jù)權(quán)利要求13所述的方法，包括：收集所述接觸介質(zhì)中的顆粒物質(zhì)；(c)任選地制備用于分析的顆粒物質(zhì)；(d)進(jìn)一步任選地分析顆粒物質(zhì)。