[發(fā)明專利]一種與北京鴨抗DHAV-3性狀相關(guān)的分子標(biāo)記及其應(yīng)用

有效

• 申請?zhí)枺?/td>: 201911394107.8
• 申請日: 2019-12-30
• 公開（公告）號: CN110923337B
• 公開（公告）日: 2022-06-14
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 侯水生;梁素蕓;郭占寶;唐靜;胡健;邢光楠;王笑言;張?jiān)粕?/a>
• 申請（專利權(quán)）人: 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京畜牧獸醫(yī)研究所
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888
• 代理公司: 北京紀(jì)凱知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11245
• 代理人: 秦夢楠

本發(fā)明公開了一種與北京鴨抗DHAV?3性狀相關(guān)的分子標(biāo)記及其應(yīng)用。本發(fā)明提供了特異SNP，基于特異SNP的基因型可以實(shí)現(xiàn)對抗DHAV?3性狀進(jìn)行選擇，GG基因型鴨的抗DHAV?3感染能力優(yōu)于AA或AG基因型鴨，特異SNP所在基因的表達(dá)水平可以作為檢測DHAV?3的敏感指標(biāo)，基因表達(dá)量低的個(gè)體抗病力高于表達(dá)量高的個(gè)體。本發(fā)明可以實(shí)現(xiàn)鴨個(gè)體/群體對DHAV?3抗性性狀的評估，可以實(shí)現(xiàn)對抗DHAV?3性狀進(jìn)行早期選擇，可以通過分子標(biāo)記輔助育種實(shí)現(xiàn)抗性/敏感性鴨群體基因型的快速純化，能夠節(jié)省生產(chǎn)成本并加快遺傳進(jìn)展，更好地服務(wù)于鴨的育種，具有很大的經(jīng)濟(jì)應(yīng)用價(jià)值和科研價(jià)值。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及生物技術(shù)領(lǐng)域，具體涉及一種與北京鴨抗DHAV-3性狀相關(guān)的分子標(biāo)記及其應(yīng)用。

背景技術(shù)

鴨是中國特色水禽，飼養(yǎng)量占全世界的80％，為人類提供了肉、蛋、絨等產(chǎn)品，且抗病力較強(qiáng)，是研究天然免疫機(jī)制的很好模型。傳染病是制約北京鴨產(chǎn)業(yè)發(fā)展的關(guān)鍵因素。2017年，世界鴨肉產(chǎn)量約446萬噸，占禽肉產(chǎn)量的3.7％，在雞肉和火雞肉之后位居第三。在亞洲、北歐和中歐，鴨肉主要來源于北京鴨。

DHAV-3所致的鴨病毒性肝炎(Duck viral hepatitis,DVH)已成為危害我國養(yǎng)鴨業(yè)的重要疾病之一，如不加以控制，死亡率可達(dá)90％以上。DVH的傳播速度很快，且呈急性發(fā)生，病程很短，注射抗體制品往往不能達(dá)到預(yù)期的治療效果，為防控DVH，從2014年起，中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京畜牧獸醫(yī)研究所水禽營養(yǎng)與育種創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)針對近年來在亞洲養(yǎng)鴨業(yè)流行最為廣泛的DHAV-3開展了抗病育種工作，并鑒定出對DHAV-3具有抗性的北京鴨新品系(Z8R系)。迄今為止，已創(chuàng)建了第4世代抗性品系(Z8R4)，這為進(jìn)一步研究北京抗DHAV-3感染的分子機(jī)制提供了良好的研究素材。

高通量時(shí)代的到來，使定位基因變異從以候選基因、單一性狀為主的微觀研究方式向以物種進(jìn)化構(gòu)架內(nèi)的全基因組水平的宏觀研究轉(zhuǎn)變，完成了從抽樣到整體的升華。通過全基因組關(guān)聯(lián)分析可獲得與目標(biāo)性狀緊密聯(lián)系的分子標(biāo)記，為后續(xù)研究提供前提。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明的目的是提供一種與北京鴨抗DHAV-3性狀相關(guān)的分子標(biāo)記及其應(yīng)用。

第一方面，本發(fā)明首先保護(hù)用于檢測特異SNP的物質(zhì)在如下任一中的應(yīng)用：

(A1)鑒定或輔助鑒定待測鴨DHAV-3抗性；

(A2)制備用于鑒定或輔助鑒定待測鴨DHAV-3抗性的產(chǎn)品；

所述特異SNP為如下(B1)或(B2)：

(B1)鴨基因組第2號染色體的第43395216位核苷酸；

(B2)鴨基因組中序列表的序列1中自5’端第358位核苷酸。

所述用于檢測特異SNP的物質(zhì)為引物對甲或含有所述引物對甲的試劑盒；

所述引物對甲由上游引物和下游引物組成；

所述上游引物為如下(a1)或(a2)：

(a1)序列2所示的DNA分子；

(a2)將序列2經(jīng)過一個(gè)或幾個(gè)核苷酸的取代且與序列2具有相同功能的DNA分子；

所述下游引物為如下(a3)或(a4)：

(a3)序列3所示的DNA分子；

(a4)將序列3經(jīng)過一個(gè)或幾個(gè)核苷酸的取代且與序列3具有相同功能的DNA分子。

第二方面，本發(fā)明保護(hù)一種鑒定或輔助鑒定待測鴨DHAV-3抗性的方法，包括如下步驟：檢測待測鴨的基因組DNA中基于特異SNP位點(diǎn)的基因型為GG基因型、AA基因型還是AG基因型；GG基因型鴨的DHAV-3抗性在大于AA基因型鴨或AG基因型鴨；