[發明專利]一種與北京鴨抗DHAV-3性狀相關的分子標記及其應用

有效

• 申請號: 201911394107.8
• 申請日: 2019-12-30
• 公開（公告）號: CN110923337B
• 公開（公告）日: 2022-06-14
• 發明（設計）人: 侯水生;梁素蕓;郭占寶;唐靜;胡健;邢光楠;王笑言;張云生
• 申請（專利權）人: 中國農業科學院北京畜牧獸醫研究所
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888
• 代理公司: 北京紀凱知識產權代理有限公司 11245
• 代理人: 秦夢楠

本發明公開了一種與北京鴨抗DHAV?3性狀相關的分子標記及其應用。本發明提供了特異SNP，基于特異SNP的基因型可以實現對抗DHAV?3性狀進行選擇，GG基因型鴨的抗DHAV?3感染能力優于AA或AG基因型鴨，特異SNP所在基因的表達水平可以作為檢測DHAV?3的敏感指標，基因表達量低的個體抗病力高于表達量高的個體。本發明可以實現鴨個體/群體對DHAV?3抗性性狀的評估，可以實現對抗DHAV?3性狀進行早期選擇，可以通過分子標記輔助育種實現抗性/敏感性鴨群體基因型的快速純化，能夠節省生產成本并加快遺傳進展，更好地服務于鴨的育種，具有很大的經濟應用價值和科研價值。

技術領域

本發明涉及生物技術領域，具體涉及一種與北京鴨抗DHAV-3性狀相關的分子標記及其應用。

背景技術

鴨是中國特色水禽，飼養量占全世界的80％，為人類提供了肉、蛋、絨等產品，且抗病力較強，是研究天然免疫機制的很好模型。傳染病是制約北京鴨產業發展的關鍵因素。2017年，世界鴨肉產量約446萬噸，占禽肉產量的3.7％，在雞肉和火雞肉之后位居第三。在亞洲、北歐和中歐，鴨肉主要來源于北京鴨。

DHAV-3所致的鴨病毒性肝炎(Duck viral hepatitis,DVH)已成為危害我國養鴨業的重要疾病之一，如不加以控制，死亡率可達90％以上。DVH的傳播速度很快，且呈急性發生，病程很短，注射抗體制品往往不能達到預期的治療效果，為防控DVH，從2014年起，中國農業科學院北京畜牧獸醫研究所水禽營養與育種創新團隊針對近年來在亞洲養鴨業流行最為廣泛的DHAV-3開展了抗病育種工作，并鑒定出對DHAV-3具有抗性的北京鴨新品系(Z8R系)。迄今為止，已創建了第4世代抗性品系(Z8R4)，這為進一步研究北京抗DHAV-3感染的分子機制提供了良好的研究素材。

高通量時代的到來，使定位基因變異從以候選基因、單一性狀為主的微觀研究方式向以物種進化構架內的全基因組水平的宏觀研究轉變，完成了從抽樣到整體的升華。通過全基因組關聯分析可獲得與目標性狀緊密聯系的分子標記，為后續研究提供前提。

發明內容

本發明的目的是提供一種與北京鴨抗DHAV-3性狀相關的分子標記及其應用。

第一方面，本發明首先保護用于檢測特異SNP的物質在如下任一中的應用：

(A1)鑒定或輔助鑒定待測鴨DHAV-3抗性；

(A2)制備用于鑒定或輔助鑒定待測鴨DHAV-3抗性的產品；

所述特異SNP為如下(B1)或(B2)：

(B1)鴨基因組第2號染色體的第43395216位核苷酸；

(B2)鴨基因組中序列表的序列1中自5’端第358位核苷酸。

所述用于檢測特異SNP的物質為引物對甲或含有所述引物對甲的試劑盒；

所述引物對甲由上游引物和下游引物組成；

所述上游引物為如下(a1)或(a2)：

(a1)序列2所示的DNA分子；

(a2)將序列2經過一個或幾個核苷酸的取代且與序列2具有相同功能的DNA分子；

所述下游引物為如下(a3)或(a4)：

(a3)序列3所示的DNA分子；

(a4)將序列3經過一個或幾個核苷酸的取代且與序列3具有相同功能的DNA分子。

第二方面，本發明保護一種鑒定或輔助鑒定待測鴨DHAV-3抗性的方法，包括如下步驟：檢測待測鴨的基因組DNA中基于特異SNP位點的基因型為GG基因型、AA基因型還是AG基因型；GG基因型鴨的DHAV-3抗性在大于AA基因型鴨或AG基因型鴨；