[發明專利]腫瘤成分標注方法、裝置、設備及存儲介質

在審

• 申請號: 201911390660.4
• 申請日: 2019-12-30
• 公開（公告）號: CN111180048A
• 公開（公告）日: 2020-05-19
• 發明（設計）人: 于觀貞;陳穎;高云姝;王進祥;趙亮;劉家琪;吳湛
• 申請（專利權）人: 上海研境醫療科技有限公司;于觀貞;陳穎;高云姝
• 主分類號: G16H30/20
• 分類號: G16H30/20;G16H30/40;G06T7/33
• 代理公司: 廣州嘉權專利商標事務所有限公司 44205
• 代理人: 洪銘福

本發明公開了一種腫瘤成分標注方法、裝置、設備及存儲介質，方法包括：獲取第一病理影像，所述第一病理影像為病理切片進行HE染色后進行數字化掃描的影像；獲取第二病理影像，所述第二病理影像為將所述病理切片進行HE褪色后進行免疫組化染色再進行數字化掃描的影像；在第二病理影像中提取預設顏色閾值范圍內的像素，并標記為腫瘤成分；將所述第一病理影像和所述第二病理影像進行圖像配準。本發明可自動在病理影像中標記腫瘤成分，無需手工標注，標注速度快、精度高。

技術領域

本發明涉及圖像處理領域，尤其是涉及一種腫瘤成分標注方法、裝置、設備及存儲介質。

背景技術

數字病理切片是將整個載玻片全信息、全方位快速掃描，使傳統物質化的載玻片變成新一代數字化病理切片。

病理切片中標注腫瘤成分(包括腫瘤細胞、腫瘤微環境和異質性腫瘤細胞等)主要通過特殊染色或者測序進行，將病理切片掃描成數字化切片后通過肉眼識別出經染色的腫瘤成分十分繁瑣，工作量大且易產生錯誤。

發明內容

本發明旨在至少解決現有技術中存在的技術問題之一。為此，本發明提出一種腫瘤成分標注方法，自動標注腫瘤成分，無需手工操作，能夠有效提高病理影響標注的速度和精度。

第一方面，本發明的一個實施例提供了一種腫瘤成分標注方法：包括：

獲取第一病理影像，所述第一病理影像為病理切片進行HE染色后進行數字化掃描的影像；

獲取第二病理影像，所述第二病理影像為將所述病理切片進行HE褪色后進行免疫組化染色再進行數字化掃描的影像；

在第二病理影像中提取預設顏色閾值范圍內的像素，并標記為腫瘤成分；

將所述第一病理影像和所述第二病理影像進行圖像配準。

本發明實施例的一種腫瘤成分標注方法至少具有如下有益效果：可自動在病理影像中標記腫瘤成分，無需手工標注，標注速度快、精度高。

根據本發明的另一些實施例的腫瘤成分標注方法，所述在第二病理影像中提取預設顏色閾值范圍內的像素，并標記為腫瘤成分包括；

將所述第二病理影像轉化為HSV編碼的中間圖像；

將所述中間圖像分成若干圖塊；

在所述圖塊中提取閾值范圍內的像素，并標記為腫瘤成分得到標記圖塊；

將所述標記圖塊拼接成完整圖像。

進一步地，所述第一次染色包括HE染色。

進一步地，所述第二次染色為分子生物學染色，包括免疫組化染色或免疫熒光染色或多重免疫組化染色或基因測序染色。

進一步地，所述將所述第一病理影像和所述第二病理影像進行圖像配準包括：

將所述第一病理影像和所述第二病理影像進行二值化處理得到第一影像和第二影像；

在所述第一影像和所述第二影像中定位匹配特征點；

建立配準矩陣。

進一步地，所述將所述第一病理影像和所述第二病理影像進行二值化處理得到第一影像和第二影像包括：

采用預設閾值分別對所述第一病理影像和所述第二病理影像進行二值化處理；

計算所述第一病理影像和所述第二病理影像二值化結果的差異值；

若所述差異值大于預設值，則調整所述第二病理影像的閾值，對所述第二病理影像進行二值化處理，直至所述第一病理影像和所述第二病理影像二值化結果的差異值小于預設值。