[發(fā)明專利]一種多重熔解曲線的軟件分析方法

在審

• 申請?zhí)枺?/td>: 201911371056.7
• 申請日: 2019-12-26
• 公開（公告）號: CN111145835A
• 公開（公告）日: 2020-05-12
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 苗保剛;李政;羅淑芬;孫瑤;李明;彭年才
• 申請（專利權(quán)）人: 蘇州天隆生物科技有限公司
• 主分類號: G16B50/00
• 分類號: G16B50/00
• 代理公司: 蘇州集律知識產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所(普通合伙) 32269
• 代理人: 安紀(jì)平

本發(fā)明揭示了一種多重熔解曲線的軟件分析方法，包括：獲取或接收包括多條多重熔解曲線的數(shù)據(jù)集；對所述數(shù)據(jù)集中的每條多重熔解曲線進(jìn)行校正，獲得歸一化的多重熔解曲線；根據(jù)歸一化的多重熔解曲線，計算得到目標(biāo)峰；對歸一化的目標(biāo)峰進(jìn)行聚類分析，確定目標(biāo)基因的類別。本發(fā)明實現(xiàn)自動對多重熔解曲線進(jìn)行分析及判定，且消除儀器間孔位的溫度差、光路不一致、樣本含量不一致、試劑含量不一致等的影響。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及軟件分析方法領(lǐng)域，尤其是涉及一種多重熔解曲線的軟件分析方法。

背景技術(shù)

熔解曲線(Melting Curve)是顯示DNA雙鏈結(jié)構(gòu)的熔解程度隨溫度升高而變化的曲線，不同的DNA雙鏈由于堿基序列、片段長度與GC含量的不同，其熔解溫度T_m(總DNA雙鏈熔解一半時的溫度)也將不同。

基于此原理，熔解曲線常用于分析目標(biāo)基因的非特異性擴(kuò)增情況、突變情況以及拷貝數(shù)變異等。目前，市面上已有能夠進(jìn)行熔解曲線實驗的配套儀器及試劑，但卻很少有能夠分析熔解曲線的方案提供給用戶。

因此，研發(fā)一種能夠自動分析多重熔解曲線的軟件分析方案，仍是市場所急需的。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明的目的在于克服現(xiàn)有技術(shù)的缺陷，提供一種多重熔解曲線的軟件分析方法。

為實現(xiàn)上述目的，本發(fā)明提出如下技術(shù)方案：一種多重熔解曲線的軟件分析方法，包括：

S1，獲取或接收包括多條多重熔解曲線的數(shù)據(jù)集；

S2，對所述數(shù)據(jù)集中的每條多重熔解曲線進(jìn)行校正，獲得歸一化的多重熔解曲線；

S3，根據(jù)歸一化的多重熔解曲線，計算得到目標(biāo)峰；

S4，對歸一化的目標(biāo)峰進(jìn)行聚類分析，確定目標(biāo)基因的類別。

優(yōu)選地，每條所述多重熔解曲線包括熔解前區(qū)域、熔解區(qū)及熔解后區(qū)域，所述熔解區(qū)包括至少一個熔解段，且所述多個熔解段中，其中一個為參考基因的熔解段，其它的均為目標(biāo)基因的熔解段。

優(yōu)選地，每條所述多重熔解曲線包括多個數(shù)據(jù)點，每個所述數(shù)據(jù)點對應(yīng)一對坐標(biāo)值。

優(yōu)選地，所述S2包括：

S21，統(tǒng)計所述數(shù)據(jù)集中的最大降幅，按最大降幅比例的經(jīng)驗值設(shè)定陰陽性閾值，并根據(jù)所述陰陽性閾值去除所述數(shù)據(jù)集中的陰性曲線；

S22，定位去除陰性曲線后的數(shù)據(jù)集的熔解前區(qū)域和熔解后區(qū)域；

S23，根據(jù)所述數(shù)據(jù)集的熔解前區(qū)域與熔解后區(qū)域，去除每條多重熔解曲線的背景曲線，獲得無背景曲線的第一多重熔解曲線；

S24，對所述第一多重熔解曲線進(jìn)行歸一化，獲得歸一化后的第二多重熔解曲線。

優(yōu)選地，所述S22包括：

S221，對每條多重熔解曲線進(jìn)行開窗，得到多個窗區(qū)，依次計算每個窗區(qū)的線性相關(guān)系數(shù)，并根據(jù)所述線性相關(guān)系數(shù)判斷當(dāng)前窗區(qū)是否為目標(biāo)區(qū)域，其中，每個窗區(qū)的開窗長度為n個數(shù)據(jù)點，n為大于等于1的整數(shù)；

S222，統(tǒng)計去除陰性曲線后的數(shù)據(jù)集內(nèi)所有多重熔解曲線的熔解前區(qū)域的最小起始溫度，根據(jù)所述最小起始溫度確定數(shù)據(jù)集的熔解前區(qū)域；統(tǒng)計S1數(shù)據(jù)集內(nèi)所有多重熔解曲線的熔解后區(qū)域的最大結(jié)束溫度，根據(jù)所述最大結(jié)束溫度確定數(shù)據(jù)集的熔解后區(qū)域。

優(yōu)選地，所述n的范圍由多重熔解曲線的x軸的溫度間距決定，其計算公式為：

其中，step為溫度間距。