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[發明專利]一種數字病理切片的云存儲方法有效

專利信息
申請號: 201911354310.2 申請日: 2019-12-25
公開(公告)號: CN111222064B 公開(公告)日: 2023-08-01
發明(設計)人: 陳定苗;簡剛;唐武斌 申請(專利權)人: 寧波市科技園區明天醫網科技有限公司
主分類號: G06F16/957 分類號: G06F16/957;G06F16/51
代理公司: 杭州斯可睿專利事務所有限公司 33241 代理人: 唐迅
地址: 315040 浙江省寧波市高新區創苑路80*** 國省代碼: 浙江;33
權利要求書: 查看更多 說明書: 查看更多
摘要:
搜索關鍵詞: 一種 數字 病理 切片 存儲 方法
【說明書】:

發明公開了一種數字病理切片的云存儲方法,包括以下步驟:(1)加載數字病理切片,并解析其包含的層數以及每一層的信息;(2)取出第N層,N從0開始,并以當前層的索引號為名稱創建文件夾Layer?N;解析N層的圖像塊的總行數Rows和總列數Cols;并從第0行第0列開始遍歷該圖像矩陣,根據行列索引取出該層下的每一個圖像;將所在的第i行第j列的圖像保存在Layer?N目錄內,并通過將對應的圖像命名為i_j.jpg;并判斷目前查詢的是否到達最后一層,如果不是,則跳轉到步驟2;如果是,根據信息生成一個Json索引文件,并且命名為SliceInfo.json,保存在Layer文件夾的同級目錄下,將Layer文件夾和Json文件一同上傳到云端進行保存。本發明提高后期瀏覽效率。

技術領域

本發明涉及一種數字病理切片的云存儲方法的技術領域,特別是一種數字病理切片的云存儲方法。

背景技術

目前醫療影像信息化水平快速發展,尤其是遠程醫療、移動醫療的開展,基于數字醫療信息的醫療診治活動已超出局域網環境下的醫院內部范圍,擴展到無線網絡和廣域網應用環境下的醫院間、地區間的區域協同醫療范圍,數字病理圖像顯示系統應用平臺擴展到基于IOS、Android、Windows?Phone等移動操作系統的各種只能移動應用平臺。

對象存儲是面向對象/文件的、海量的互聯網存儲,也可以直接被稱為“云存儲”。它提高了存儲效率,通過虛擬化技術解決了存儲空間的浪費,可以自動重新分配數據,提高了存儲空間的利用率,同時具備負載均衡、故障冗余的功能。

數字病理切片文件一般都比較大,小則幾百兆,大則幾個G。所以將數字病理切片存儲于對象存儲中將會是一個以后主流的存儲方案。

目前的數字病理切片都是采用分層存儲的,即文件中會保存1-N個不同的掃描倍率的圖像,而每一個掃描倍率的圖像作為一層。每一層的圖像都會被拆分成N個256x256大小圖片進行存儲如圖1所示,文件中會記錄每一小塊圖片其掃描倍率,在源圖像上的位置等信息。以此組成一個數字病理切片文件。

如果將病理切片文件存儲于對象存儲上,由于我們無法直接通過對象存儲的文件訪問接口來直接解析文件,導致我們在瀏覽數字病理圖像時,需要先將整個病理切片文件下載到服務器本地磁盤,再使用操作系統提供的文件訪問接口去解析其文件中的內容并返回給前端進行顯示,但是每次需要將整個數字病理切片文件下載到本地的操作,會造成客戶端很長的等待時間,大大降低了用戶使用體驗。

發明內容

本發明的目的是為了解決對象存儲現有技術的不足而提供一種能夠大大提升客戶端瀏覽的速度,且不必下載整個切片文件到本地后再進行解析處理操作的數字病理切片文件的云存儲方法。

為了實現上述目的,本發明所設計的一種數字病理切片的云存儲方法,具體包括以下步驟:

(1)通過加載數字病理切片,并解析其包含的層數以及每一層的信息;

(2)取出第N層,N從0開始,并以當前層的索引號為名稱創建文件夾Layer-N;

(3)然后通過解析步驟2中的文件夾Layer-N對應的N層的圖像塊的總行數Rows和總列數Cols;

(4)然后在步驟3中,從第0行第0列開始遍歷該圖像矩陣,根據行列索引取出該層下的每一個圖像;

(5)然后將每一個圖像按照其所在的第i行第j列的圖像保存在Layer-N目錄內,并通過將對應的圖像命名為i_j.jpg;

(6)并判斷目前查詢的是否到達最后一層,如果不是,則跳轉到步驟2;如果是,則跳轉到步驟7;

(7)根據上述各個步驟的信息生成一個Json索引文件,并且命名為SliceInfo.json,然后保存在Layer文件夾的同級目錄下;

(8)最終將Layer文件夾和Json文件一同上傳到云端進行保存。

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