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[發明專利]乳腺癌的新診斷標志物PPEF1及其應用有效

專利信息
申請號: 201911333861.0 申請日: 2019-12-23
公開(公告)號: CN111218509B 公開(公告)日: 2023-07-04
發明(設計)人: 葉婷;劉靳波;李婧媛 申請(專利權)人: 西南醫科大學附屬醫院
主分類號: C12Q1/6886 分類號: C12Q1/6886;G01N33/574;C12N15/11
代理公司: 重慶為信知識產權代理事務所(普通合伙) 50216 代理人: 龍玉洪
地址: 646000*** 國省代碼: 四川;51
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摘要:
搜索關鍵詞: 乳腺癌 診斷 標志 ppef1 及其 應用
【說明書】:

發明涉及腫瘤標志物,具體涉及一種乳腺癌相關的的新生物標志物及其應用,該乳腺癌新腫瘤標志物為蛋白磷酸酶PPEF1。本發明通過生物信息學分析、細胞實驗及臨床驗證,探究證實了PPEF1與乳腺癌具有很好的相關性,可作為乳腺癌診斷及預后的一種標志物,具有重要臨床意義。

技術領域

本發明屬于生物醫學技術以及腫瘤診斷技術領域,具體涉及蛋白磷酸酶PPEF1作為乳腺癌生物標志物及其應用。

背景技術

乳腺癌是女性發病率及死亡率最高的惡性腫瘤,也是全世界癌癥死亡的主要因素。目前為止,乳腺癌的風險因素仍不確定,但已被指出與生殖,激素,肥胖,飲酒和其他許多潛在因素的復雜作用及異質性等相關。近年來,對乳腺癌的研究盡管在早期臨床診斷、手術技術提升、抗癌藥物研發及靶向治療策略等方面取得了進展,但由于腫瘤復發和轉移,乳腺癌患者的長期存活率仍然很差。

腫瘤標志物可提示腫瘤的性質,對腫瘤的診斷、預后以及復發等做出判斷,但現有的乳腺癌腫瘤標志物存在敏感度和特異性無法達到期望值,單一標志物診斷有限等問題。因此,尋找一種特異性高、靈敏度好、可用于乳腺癌診斷和預后判斷的新標志物,具有極大的臨床價值和研究意義。

PPEF1是編碼蛋白質絲氨酸/蘇氨酸蛋白磷酸酶的基因。以往有報道顯示,某些蛋白質絲氨酸/蘇氨酸磷酸酶的表達與細胞的過度增殖有關。現有研究發現,PPEF1在肺癌發展中可抑制癌細胞的死亡,是具有致癌能力的癌基因;在淋巴瘤的診斷中,研究認為PPEF1可能是具有診斷或治療價值的潛在靶標。而PPEF1在乳腺癌發生發展中的作用尚未有報道。

本發明有創意地提出應用一個多學科(腫瘤生物學,生物信息學,基礎醫學和臨床醫學相結合的轉化醫學)交叉的研究手段,從分子、細胞和臨床患者的不同層面,來探討最新發現的PPEF1在乳腺癌發生發展過程中的作用、分子機制及診斷和預后等方面的作用,有望為乳腺癌的診斷和治療提供新的策略。此項研究不僅富有科學創意,還有著近期和長遠的社會經濟意義。

發明內容

針對現有技術的不足,本發明的首要目的在于提供PPEF1作為乳腺癌分子標志物的應用。

PPEF1序列如下:

MGCSSSSTKTRRSDTSLRAALIIQNWYRGYKARLKARQHYALTIFQSIEYADEQGQMQLSTFFSFMLENYTHIHKEELELRNQSLESEQDMRDRWDYVDSIDVPDSYNGPRLQFPLTCTDIDLLLEAFKEQQILHAHYVLEVLFETKKVLKQMPNFTHIQTSPSKEVTICGDLHGKLDDLFLIFYKNGLPSERNPYVFNGDFVDRGKNSIEILMILCVSFLVYPNDLHLNRGNHEDFMMNLRYGFTKEILHKYKLHGKRILQILEEFYAWLPIGTIVDNEILVIHGGISETTDLNLLHRVERNKMKSVLIPPTETNRDHDTDSKHNKVGVTFNAHGRIKTNGSPTEHLTEHEWEQIIDILWSDPRGKNGCFPNTCRGGGCYFGPDVTSKILNKYQLKMLIRSHECKPEGYEICHDGKVVTIFSASNYYEEGSNRGAYIKLCSGTTPRFFQYQVTKATCFQPLRQRVDTMENSAIKILRERVISRKSDLTRAFQLQDHRKSGKLSVSQWAFCMENILGLNLPWRSLSSNLVNIDQNGNVEYMSSFQNIRIEKPVQEAHSTLVETLYRYRSDLEIIFNAIDTDHSGLISVEEFRAMWKLFSSHYNVHIDDSQVNKLANIMDLNKDGSIDFNEFLKAFYVVHRYEDLMKPDVTNLG(SEQ?ID?No.1)。

為了實現上述技術目的,本發明首先利用生物信息學方法對PPEF1在乳腺癌及正常組織中的表達進行研究,發現PPEF1在乳腺癌組織中的表達高于正常組織。

進一步利用KM生存分析及COX回歸分析,發現PPEF1可作為乳腺癌患者的獨立預后因素。

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