[發明專利]人血液中結直腸癌診斷相關的甲基化生物標記物及其應用

有效

• 申請號: 201911119701.6
• 申請日: 2019-11-15
• 公開（公告）號: CN110724743B
• 公開（公告）日: 2021-02-26
• 發明（設計）人: 陳志偉;蔣澤宇;許林浩;范建兵
• 申請（專利權）人: 廣州市基準醫療有限責任公司
• 主分類號: C12Q1/6886
• 分類號: C12Q1/6886
• 代理公司: 廣州廣典知識產權代理事務所(普通合伙) 44365
• 代理人: 萬志香

本發明公開了與結直腸癌相關的甲基化生物標記物及其應用，所述與結直腸癌相關的甲基化生物標記物是cg21644830、cg11407741、cg12619536、cg04156369、cg15248577、cg16903605、cg00397851、cg01922936、cg17849956、cg15717808、cg18323466、cg15177071、cg19918758、cg26337020、cg01333350、cg07344025、cg03786924、cg04380513、和cg12665504的組合。本發明所篩選的19種生物標記物的組合與血液中與結直腸癌診斷高端相關，特別是所選擇的生物標記物的組合，對于早期的結直腸癌樣本的針對性很強，利用這些生物標記物以及相應的檢測技術開展結直腸癌的無創早篩早診意義重大。

技術領域

本發明屬于生物技術領域，具體涉及人血液中結直腸癌診斷相關的甲基化生物標記物及其應用。

背景技術

結直腸癌是常見的惡性腫瘤，占全部惡性腫瘤的10％，其在惡性腫瘤中居第3位，嚴重威脅著人類的健康。在我國，隨著人們生活水平的提高和飲食結構的改變，結直腸癌的發病率日漸增加，死亡率亦大幅增加，尤其在近十年，結直腸癌發病率的增加每年4％，遠超2％的國際水平。機制研究表明，結直腸癌主要是由基因突變和表觀遺傳學改變的逐漸積累和共同作用引起，這是一個發展較為緩慢的過程。在結直腸癌篩查方法中，僅有糞便隱血試驗(fecal occult blood test，FOBT)和乙狀結腸鏡檢查具有高級別的循證醫學證據。FOBT是目前應用最為廣泛的篩查方法，具有無創、價廉的優點，篩查敏感性30％～80％。研究顯示，對參加至少一次篩查的人群而言，FOBT可以降低25％的死亡風險。乙狀結腸鏡主要觀察遠側結腸的病變情況，達到60％～70％結腸鏡的檢查敏感性。乙狀結腸鏡篩查的理論基礎在于多數結腸病變位于鏡身所及的遠端結腸，同時，部分伴有遠端結腸病變的近側腫瘤也可以在隨后的結腸鏡檢查中得以診斷。乙狀結腸鏡的篩查效果受到腸道清潔程度、操作者經驗、病變分布特點和篩檢頻率等因素的影響。此外，作為一種非侵入性的結直腸癌篩查方法，大便基因檢測具有特異性高、敏感性強、無需行腸道準備、易于檢查和接受等優點。目前的大便基因檢測包括大便DNA檢測(stool DNA testing,sDNA)及大便微小RNA檢測(microRNA,miRNA)。

但是現有的結腸鏡檢查具有侵入性，對于結直腸癌患者來說大大降低了篩查的意愿。糞便基因檢測目前主要依靠單一生物標記物或者少數幾個生物標記物作為檢測依據，存在檢測準確率低，靈敏度低的缺點。

相對于血液樣本而言，現有的檢測技術依賴于糞便，而糞便樣本普遍存在其他生物DNA污染問題，樣本保存質量低，保存成本高，檢測噪音高，并且樣本易獲得性及患者提供意愿較血液差。

液體活檢(liquid biopsy，LB)作為精準醫療新技術，因其可定性定量檢測腫瘤直接相關的腫瘤細胞和DNA，并具有非入侵性、取樣便捷、實時監測等特點，逐步在腫瘤診療中發揮越來越重要的作用。

發明內容

基于此，本發明提供了用于診斷、預測人結直腸癌及其預后的差異化甲基化生物標記物。

實現上述目的技術方案如下。

人血液中與結直腸癌診斷相關的甲基化生物標記物，所述甲基化生物標記物是cg21644830、cg11407741、cg12619536、cg04156369、cg15248577、cg16903605、cg00397851、cg01922936、cg17849956、cg15717808、cg18323466、cg15177071、cg19918758、cg26337020、cg01333350、cg07344025、cg03786924、cg04380513、和cg12665504的組合。