[發(fā)明專利]肝癌陰離子標(biāo)志物的篩選方法和應(yīng)用有效
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 201911086160.1 | 申請(qǐng)日: | 2019-11-08 |
| 公開(公告)號(hào): | CN110850072B | 公開(公告)日: | 2023-05-05 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 張水軍;劉旭東;張嘉凱;溫培豪;王智慧;史曉奕;史冀華;方洪波;曹勝利;胡博文 | 申請(qǐng)(專利權(quán))人: | 鄭州大學(xué)第一附屬醫(yī)院 |
| 主分類號(hào): | G01N33/53 | 分類號(hào): | G01N33/53;G01N33/574;G01N30/02;G01N30/36;G01N30/06;G01N30/34;G01N30/72;G01N30/86 |
| 代理公司: | 鄭州豫開專利代理事務(wù)所(普通合伙) 41131 | 代理人: | 朱俊峰 |
| 地址: | 450000 河*** | 國省代碼: | 河南;41 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 肝癌 陰離子 標(biāo)志 篩選 方法 應(yīng)用 | ||
本發(fā)明公開了一種肝癌陰離子標(biāo)志物的篩選方法,包括以下步驟:第一步,提取待檢樣本中的代謝混合物,備用;第二步,將第一步得到的代謝混合物用液相色譜進(jìn)行分離,分離后的樣品用質(zhì)譜儀鑒定分析,采集質(zhì)譜數(shù)據(jù);第三步,確定代謝混合物中的每種代謝物質(zhì);第四步,篩選出肝癌樣本與肝硬化樣本之間的顯著性差異代謝物質(zhì)即為肝癌陰離子標(biāo)志物。本發(fā)明首次建立了一種與肝癌診斷相關(guān)陰離子標(biāo)志物的篩選方法,篩選出酮異己酸陰離子、2,4?硝基苯酚陰離子、4?壬基酚陰離子和異丁酸陰離子四個(gè)顯著性差異小分子,為日后肝癌藥物的研發(fā)提供新的靶點(diǎn)和思路,具有重要意義。
技術(shù)領(lǐng)域
本發(fā)明涉及生化檢測領(lǐng)域,尤其是涉及一種肝癌陰離子標(biāo)志物的篩選方法,還涉及篩選出的肝癌陰離子標(biāo)志物在制備肝癌診斷藥物或診斷試劑盒中的應(yīng)用。
背景技術(shù)
肝細(xì)胞癌(hepatocellular?carcinoma?,即HCC),是一種高死亡率的原發(fā)性肝癌,它是一種全球范圍最常見的惡性腫瘤,尤其是在亞洲、非洲和南部歐洲。全球每年新發(fā)病例數(shù)約65萬,其發(fā)病率占所有惡性腫瘤的第5位,死亡數(shù)約為60萬,為所有惡性腫瘤的第3位。在我國,肝癌的發(fā)生主要與乙型肝炎相關(guān),每年的新發(fā)病例占全世界新發(fā)病例的55%左右。
肝癌早期癥狀不明顯,具有進(jìn)展迅速、易早期轉(zhuǎn)移的特點(diǎn),在臨床上存在早診困難、預(yù)后效果差的問題。目前,臨床上的肝癌篩查方法是B型超聲顯像(即B超)、腫瘤標(biāo)志物甲胎蛋白(α-fetoprotein,即AFP)的血清含量或兩者結(jié)合進(jìn)行篩查。然而,B超很難鑒別小肝癌或肝硬化結(jié)節(jié),而甲胎蛋白血清水平在診斷肝癌時(shí)存在敏感性和特異性較低的缺陷,單獨(dú)用于確診時(shí)的檢出率一般只有50%—75%左右。現(xiàn)有篩查方法的局限性極大地限制了肝細(xì)胞癌的早期有效診斷,預(yù)警作用有限。對(duì)于肝細(xì)胞癌的早期有效診斷有助于顯著提高患者的生存率,因此,開發(fā)具有臨床早診潛力的新方法對(duì)于降低肝細(xì)胞癌的發(fā)病率和死亡率具有非常重要的現(xiàn)實(shí)意義。
近年來,代謝組學(xué)技術(shù)作為一個(gè)新的有力工具,被廣泛運(yùn)用于疾病研究中。將疾病狀態(tài)下異常的或者數(shù)量變化極大的代謝小分子作為標(biāo)志物,以用于診斷疾病的進(jìn)程具有重要意義。質(zhì)譜技術(shù)是代謝組學(xué)的主要研究手段,其檢測小分子代謝物在疾病診斷中的應(yīng)用已有成功的案例,包括基于檢測多種氨基酸的新生兒疾病篩查、檢測肌氨酸的前列腺癌判別等。但目前還未有關(guān)于小分子代謝物陰離子作為由肝癌篩查相關(guān)的標(biāo)志物的報(bào)道。
發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明提供了一種肝癌陰離子標(biāo)志物的篩選方法,還涉及篩選出的肝癌陰離子標(biāo)志物在制備肝癌診斷藥物或診斷試劑盒中的應(yīng)用,對(duì)肝癌的篩查具有重要意義,為日后肝癌的診斷乃至治療藥物的研發(fā)提供了新的靶點(diǎn)和思路。
為實(shí)現(xiàn)上述目的,本發(fā)明采取下述技術(shù)方案:
本發(fā)明提供了一種肝癌陰離子標(biāo)志物的篩選方法,包括以下步驟:
第一步,提取待檢樣本中的代謝混合物,備用;所述待檢樣本包括肝癌樣本和肝硬化樣本;
第二步,將第一步得到的代謝混合物用高效液相色譜進(jìn)行分離,分離后的樣本用質(zhì)譜儀鑒定分析,采集代謝混合物的質(zhì)譜數(shù)據(jù);
第三步,將第二步得到的質(zhì)譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換成.mzXML格式,采用精確質(zhì)量數(shù)匹配25ppm和二級(jí)譜圖匹配的方式確定代謝混合物中的每種代謝物質(zhì);
第四步,以變量權(quán)重值1為篩選標(biāo)準(zhǔn),用OPLS-DA對(duì)第三步確定的每種代謝物質(zhì)進(jìn)行初步篩選,初篩出肝癌樣本與肝硬化樣本之間的差異代謝物質(zhì),差異代謝物質(zhì)的變量權(quán)重值1,且差異倍數(shù)2或0.?5;用單變量統(tǒng)計(jì)對(duì)初篩得到的差異代謝物質(zhì)再次篩選,篩選出肝癌樣本與肝硬化樣本之間的顯著性差異代謝物質(zhì)(P值0.05)即為肝癌陰離子標(biāo)志物,即酮異己酸陰離子、2,4-硝基苯酚陰離子、4-壬基酚陰離子和異丁酸陰離子。
優(yōu)選地,第一步中代謝混合物的具體提取方法為:將樣本組織用4℃的PBS溶液清洗兩次后,加入超純水破碎勻漿,渦旋,加入提取液后再次渦旋,低溫超聲提取,沉淀,離心,冷凍干燥得到代謝混合物,將代謝混合物于-80℃下冷凍凍存,備用。
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