[發(fā)明專利]一種層級(jí)式病例結(jié)構(gòu)化方法及系統(tǒng)

有效

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 201911056458.8
• 申請(qǐng)日: 2019-10-31
• 公開（公告）號(hào): CN111048167B
• 公開（公告）日: 2023-08-18
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 孟茜;謝秋景;夏天;劉安庭
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 中電藥明數(shù)據(jù)科技（成都）有限公司
• 主分類號(hào): G16H10/60
• 分類號(hào): G16H10/60;G16H15/00;G06F40/211;G06F40/242;G06F40/295;G06F40/30
• 代理公司: 北京慕達(dá)星云知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所(特殊普通合伙) 11465
• 代理人: 曹鵬飛

1.一種層級(jí)式病例結(jié)構(gòu)化方法，其特征在于，包括：

S10、構(gòu)建醫(yī)療術(shù)語(yǔ)層級(jí)體系；所述體系中包括：上下位實(shí)體、上下位實(shí)體對(duì)應(yīng)關(guān)系及上下位實(shí)體所屬類別的定義；下位實(shí)體依存于上位實(shí)體；

S20、根據(jù)所述醫(yī)療術(shù)語(yǔ)層級(jí)體系，通過實(shí)體與關(guān)系抽取模型，抽取病例文本中的醫(yī)療實(shí)體、醫(yī)療實(shí)體關(guān)系及屬性，生成結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)；所述結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)包括醫(yī)療術(shù)語(yǔ)中的上下位實(shí)體、上下位實(shí)體對(duì)應(yīng)關(guān)系及上下位實(shí)體所屬類別；所述步驟S20具體包括：根據(jù)語(yǔ)義對(duì)病例文本進(jìn)行預(yù)處理，分為不同語(yǔ)義單元；

在每一個(gè)所述語(yǔ)義單元內(nèi)，通過預(yù)設(shè)實(shí)體模型識(shí)別出第一信息；所述第一信息包括醫(yī)療術(shù)語(yǔ)中的至少一個(gè)上位實(shí)體及所述上位實(shí)體的所屬類別；

根據(jù)所述層級(jí)體系，確定每一個(gè)所述上位實(shí)體對(duì)應(yīng)的下位實(shí)體及下位實(shí)體所屬類別；

將所述第一信息進(jìn)行融合生成第一向量，將所述第一向量輸入所述預(yù)設(shè)實(shí)體模型，抽取出第二信息；所述第二信息包括醫(yī)療術(shù)語(yǔ)中的下位實(shí)體及所述下位實(shí)體的所屬類別；

根據(jù)自注意力關(guān)系抽取模型，區(qū)分所述語(yǔ)義單元內(nèi)多個(gè)上位實(shí)體分別與多個(gè)下位實(shí)體是否存在依存關(guān)系，完成抽取病例文本中的結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)；

S30、將所述結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)與數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)中預(yù)設(shè)的標(biāo)準(zhǔn)化醫(yī)療術(shù)語(yǔ)數(shù)據(jù)模板進(jìn)行比對(duì)，并通過句法分析算法及知識(shí)圖譜進(jìn)行語(yǔ)義維度數(shù)據(jù)質(zhì)量檢測(cè)，生成與所述結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)對(duì)應(yīng)的質(zhì)量級(jí)別；

S40、將所述結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)及對(duì)應(yīng)的質(zhì)量級(jí)別，存儲(chǔ)入所述數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)。

2.如權(quán)利要求1所述的一種層級(jí)式病例結(jié)構(gòu)化方法，其特征在于，所述步驟S10，包括：根據(jù)醫(yī)學(xué)相關(guān)詞典或醫(yī)療知識(shí)圖譜，結(jié)合預(yù)設(shè)病例的結(jié)構(gòu)化需求，進(jìn)行定義層級(jí)體系的上下位實(shí)體、上下位實(shí)體間的關(guān)系及上下位實(shí)體所屬類別；所述上位實(shí)體表示疾病名稱、藥品名稱、癥狀名稱；所述下位實(shí)體為上位實(shí)體的相關(guān)信息，所述相關(guān)信息包括下述任一項(xiàng)或多項(xiàng)：部位、持續(xù)時(shí)間、次數(shù)、程度和病因。

3.如權(quán)利要求1所述的一種層級(jí)式病例結(jié)構(gòu)化方法，其特征在于，在所述將所述結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)及對(duì)應(yīng)的質(zhì)量級(jí)別，存儲(chǔ)入所述數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)之前，所述方法還包括：

S35、獲取人工校驗(yàn)后的所述結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)及所述結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)對(duì)應(yīng)的質(zhì)量級(jí)別。

4.如權(quán)利要求3所述的一種層級(jí)式病例結(jié)構(gòu)化方法，其特征在于，還包括：當(dāng)所述預(yù)設(shè)實(shí)體模型為神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型時(shí)，將人工校驗(yàn)后的所述結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)，加入所述神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型的訓(xùn)練集。

5.一種層級(jí)式病例結(jié)構(gòu)化系統(tǒng)，其特征在于，包括：

構(gòu)建模塊，用于構(gòu)建醫(yī)療術(shù)語(yǔ)層級(jí)體系；所述體系中包括：上下位實(shí)體、上下位實(shí)體對(duì)應(yīng)關(guān)系及上下位實(shí)體所屬類別的定義；下位實(shí)體依存于上位實(shí)體；

實(shí)體與關(guān)系抽取模塊，用于根據(jù)所述醫(yī)療術(shù)語(yǔ)層級(jí)體系，通過實(shí)體與關(guān)系抽取模型，抽取病例文本中的醫(yī)療實(shí)體、醫(yī)療實(shí)體關(guān)系及屬性，生成結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)；所述結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)包括醫(yī)療術(shù)語(yǔ)中的上下位實(shí)體、上下位實(shí)體對(duì)應(yīng)關(guān)系及上下位實(shí)體所屬類別；所述實(shí)體與關(guān)系抽取模塊具體包括：

預(yù)處理單元，用于根據(jù)語(yǔ)義對(duì)病例文本進(jìn)行預(yù)處理，分為不同語(yǔ)義單元；

識(shí)別單元，用于在每一個(gè)所述語(yǔ)義單元內(nèi)，通過預(yù)設(shè)實(shí)體模型識(shí)別出第一信息；所述第一信息包括醫(yī)療術(shù)語(yǔ)中的至少一個(gè)上位實(shí)體及所述上位實(shí)體的所屬類別；

確定單元，用于根據(jù)所述層級(jí)體系，確定至少一個(gè)所述上位實(shí)體對(duì)應(yīng)的下位實(shí)體及下位實(shí)體所屬類別；

抽取單元，用于將所述第一信息進(jìn)行融合生成第一向量，將所述第一向量輸入所述預(yù)設(shè)實(shí)體模型，抽取出第二信息；所述第二信息包括醫(yī)療術(shù)語(yǔ)中的下位實(shí)體及所述下位實(shí)體的所屬類別；

區(qū)分單元，用于根據(jù)自注意力關(guān)系抽取模型，區(qū)分所述語(yǔ)義單元內(nèi)多個(gè)上位實(shí)體分別與多個(gè)下位實(shí)體是否存在依存關(guān)系，完成抽取病例文本中的結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)；

數(shù)據(jù)質(zhì)量檢測(cè)模塊，用于將所述結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)與數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)中預(yù)設(shè)的標(biāo)準(zhǔn)化醫(yī)療術(shù)語(yǔ)數(shù)據(jù)模板進(jìn)行比對(duì)，并通過句法分析算法及知識(shí)圖譜進(jìn)行語(yǔ)義維度數(shù)據(jù)質(zhì)量檢測(cè)，生成與所述結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)對(duì)應(yīng)的質(zhì)量級(jí)別；

存儲(chǔ)模塊，用于將所述結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)及對(duì)應(yīng)的質(zhì)量級(jí)別，存儲(chǔ)入所述數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)。

6.如權(quán)利要求5所述的一種層級(jí)式病例結(jié)構(gòu)化系統(tǒng)，其特征在于，所述構(gòu)建模塊，具體用于根據(jù)醫(yī)學(xué)相關(guān)詞典或醫(yī)療知識(shí)圖譜，結(jié)合預(yù)設(shè)病例的結(jié)構(gòu)化需求，進(jìn)行定義層級(jí)體系的上下位實(shí)體、上下位實(shí)體間的關(guān)系及上下位實(shí)體所屬類別；所述下位實(shí)體依存于所述上位實(shí)體；所述上位實(shí)體表示疾病名稱、藥品名稱、癥狀名稱；所述下位實(shí)體為上位實(shí)體的相關(guān)信息，所述相關(guān)信息包括下述任一項(xiàng)或多項(xiàng)：部位、持續(xù)時(shí)間、次數(shù)、程度和病因。