[發明專利]一種用于檢測基因CREB1單核苷酸多態性的PCR-RFLP方法在審
| 申請號: | 201911002140.1 | 申請日: | 2017-04-21 |
| 公開(公告)號: | CN110734969A | 公開(公告)日: | 2020-01-31 |
| 發明(設計)人: | 徐瑤;宋如晦;石偉林;代洋;許娜;廖興華;張同存 | 申請(專利權)人: | 武漢科技大學 |
| 主分類號: | C12Q1/6883 | 分類號: | C12Q1/6883;C12Q1/683 |
| 代理公司: | 42242 武漢藍寶石專利代理事務所(特殊普通合伙) | 代理人: | 王振宇 |
| 地址: | 430000 *** | 國省代碼: | 湖北;42 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 單核苷酸多態性 瓊脂糖凝膠電泳 基因啟動子區 限制性內切酶 基因多態性 轉錄起始點 基因組DNA 待測樣本 多態位點 基因序列 酶切產物 引物對P 一分為二 檢測 緩沖 測序 分型 引物 消化 基因 | ||
1.一種用于檢測基因CREB1單核苷酸多態性的PCR-RFLP方法,其特征在于:以糖尿病患者和正常人的血液基因組DNA為模板,在TaqDNA聚合酶、緩沖環境、Mg++、dNTPs存在的情況下,利用聚合酶鏈式反應引物對P進行PCR擴增,然后利用限制性內切酶對其進行酶切,再通過電泳檢測即可準確鑒定待測樣本的單核苷酸多態性。
2.如權利要求1所述用于檢測基因CREB1單核苷酸多態性的PCR-RFLP方法,其特征在于,所述的聚合酶鏈式反應引物對P為:
上游引物P-F:5’-CCTGGAGTACCAGGAAGGACAGC-3’23nt
下游引物P-R:5’-TTACACGTATGAGCCACC-3’18nt
引物P-F中帶有下劃線的堿基為錯配堿基,目的是引入Hha I的酶切位點;
PCR擴增后,將產物一分為二,一部分PCR產物用限制性內切酶HhaI進行消化,再對酶切后的片段進行瓊脂糖凝膠電泳,根據瓊脂糖凝膠電泳結果鑒定CREB1基因第-1354位的堿基多態性;另一部分PCR產物用限制性內切酶Xsp I進行消化,再對酶切后的片段進行瓊脂糖凝膠電泳,根據瓊脂糖凝膠電泳結果鑒定CREB1基因第-1343位的堿基多態性。
3.一種權利要求1所述用于檢測基因CREB1單核苷酸多態性的PCR-RFLP方法,其特征在于:所述的PCR擴增條件是:20μL反應體系,包括0.625U Taq DNA聚合酶,2×Buffer 10μL(內含Mg++、dNTPs等),0.45μL基因組DNA,10pmol/μL上、下游引物各0.5μL和滅菌超純水8.3μL;
所述的PCR反應程序為:95℃預變性5min;94℃變性30s,54.5℃退火30s,72℃延伸35s,35個循環;72℃延伸10min。
4.根據權利要求1所述的用于檢測基因CREB1單核苷酸多態性的PCR-RFLP方法,其特征在于,所述的瓊脂糖凝膠的濃度都為3.0%。
5.根據權利要求1所述的用于檢測基因CREB1單核苷酸多態性的PCR-RFLP方法,其特征在于,檢測到的人CREB1基因啟動子區多態性為:基因組第-1354位T>G突變;基因組第-1343位T>A突變。
6.根據權利要求1所述的用于檢測基因CREB1單核苷酸多態性的PCR-RFLP方法,其特征在于,通過電泳判定CREB1基因第-1354位的堿基多態性為:TT基因型表現為161bp條帶;TG基因型表現為161、139和22bp條帶;GG基因型表現為139和22bp條帶。
7.根據權利要求1所述的用于檢測基因CREB1單核苷酸多態性的PCR-RFLP方法,其特征在于,通過電泳判定CREB1基因第-1343位的堿基多態性為:AA基因型表現為161bp條帶;AT基因型表現為161、125和36bp條帶;TT基因型表現為125和36bp條帶。
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