[發明專利]一種GIV.1型諾如病毒的RT-LAMP法檢測用成套引物、試劑盒及檢測方法有效
| 申請號: | 201910976389.6 | 申請日: | 2019-10-15 |
| 公開(公告)號: | CN110684867B | 公開(公告)日: | 2023-01-20 |
| 發明(設計)人: | 韓一芳;葉福強;張錦海;王太武;張琪;汪春暉;曹猛;王長軍 | 申請(專利權)人: | 中國人民解放軍東部戰區疾病預防控制中心 |
| 主分類號: | C12Q1/70 | 分類號: | C12Q1/70;C12Q1/6844;C12N15/11 |
| 代理公司: | 南京艾普利德知識產權代理事務所(特殊普通合伙) 32297 | 代理人: | 周海斌 |
| 地址: | 210002 江蘇*** | 國省代碼: | 江蘇;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 giv 型諾如 病毒 rt lamp 檢測 成套 引物 試劑盒 方法 | ||
1.一種GIV.1型諾如病毒的RT-LAMP法檢測用成套引物,其特征是,所述成套引物包括外引物對GIV-F3和GIV-B3,內引物對GIV-FIP和GIV-BIP,以及環引物對GIV-LF和GIV-LB;GIV-F3的序列如SEQ ID NO:1所示,GIV-B3的序列如SEQ ID NO:2所示,GIV-FIP的序列如SEQ ID NO:3所示,GIV-BIP的序列如SEQ ID NO:4所示,GIV-LF的序列如SEQ ID NO:5所示;GIV-LB的序列如SEQ ID NO:6所示。
2.一種GIV.1型諾如病毒的RT-LAMP法檢測用試劑盒,其特征是,所述試劑盒包括引物混合液,所述引物混合液含有權利要求1所述的成套引物。
3.根據權利要求2所述試劑盒,其特征是,所述外引物對GIV-F3和GIV-B3、內引物對GIV-FIP和GIV-BIP、及環引物對GIV-LF和GIV-LB的摩爾比為1:8:(2-4)。
4.根據權利要求2所述試劑盒,其特征是,所述試劑盒還包括酶液,2×反應液,顯色液及超純水。
5.根據權利要求4所述的試劑盒,其特征是,所述酶液由濃度為6-10U/μl的BstDNA聚合酶,濃度為8-16U/μl AMV逆轉錄酶、以及水構成;
所述2×反應液由40mmol/L pH8.8的Tris-HCl,20mmol/L的KCl,20mmol/L的(NH4)2SO4,質量濃度為0.2%的Triton X-100,由濃度均為2.8mmol/L的dATP、dTTP、dCTP、dGTP組成的dNTPs,1.6mmol/L的甜菜堿C5H11NO2,16mmol/L的MgSO4,以及水構成;
所述顯色液為濃度4mmol/L的金屬離子指示劑HNB儲存液。
6.根據權利要求2所述試劑盒,其特征是,所述試劑盒還包括GIV.1型諾如病毒陽性對照品,濃度為20-100mg/L。
7.根據權利要求6所述試劑盒,其特征是,所述GIV.1型諾如病毒陽性對照品濃度為50mg/L,且由以下方法獲得:構建含有GIV.1型諾如病毒RdRp基因的質粒,進行體外轉錄反應獲得RdRp基因的RNA片段,純化后即得到GIV.1型諾如病毒陽性對照品;所述RdRp基因的序列如SEQ ID NO:7所示。
8.一種非診斷目的的GIV.1型諾如病毒RT-LAMP檢測方法,其特征是,采用權利要求2至7任一項所述的試劑盒;所述方法包括以下步驟:
第一步、向透明反應管加入試劑盒2×反應液、引物混合液、酶液、顯色液、超純水,然后混合獲得反應液;
第二步、向反應管中加入待測核酸樣品,蓋好反應管后混勻;
第三步、將反應管在恒溫條件下放置進行RT-LAMP擴增,再于反應結束條件下放置以終止反應;
第四步、觀察反應液的顏色,若反應液顏色為天藍色,則待測核酸樣品中含有GIV.1型諾如病毒;若反應液顏色為紫羅蘭色,則待測核酸樣品中不含GIV.1型諾如病毒。
9.根據權利要求8所述的檢測方法,其特征是,所述第二步中,加入待測核酸樣品后,試劑盒2×反應液、引物混合液、酶液、顯色液、超純水及待測核酸樣品的體積比為12.5:2.5:1:0.7:7.3:1,且反應管中反應液的體積為25μl;第三步中,RT-LAMP擴增條件為:62℃恒溫條件下放置60min;所述反應結束的條件為:85℃下放置5min。
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