[發(fā)明專利]一種小麥產(chǎn)量相關(guān)基因TaNRT2-6D中的分子標(biāo)記及其應(yīng)用

在審

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 201910910784.4
• 申請(qǐng)日: 2019-09-25
• 公開（公告）號(hào): CN110484651A
• 公開（公告）日: 2019-11-22
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 李超男;景蕊蓮;李嘉璐;毛新國;昌小平;王景一
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所
• 主分類號(hào): C12Q1/6895
• 分類號(hào): C12Q1/6895;C12N15/11
• 代理公司: 11245 北京紀(jì)凱知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司
• 代理人: 王灝增<國際申請(qǐng)>=<國際公布>=<進(jìn)入

1.dCAPS-1918和/或dCAPS-2002在鑒定或者輔助鑒定小麥產(chǎn)量性狀中的應(yīng)用，所述dCAPS-1918為小麥基因組的一個(gè)SNP位點(diǎn)，所述dCAPS-1918位于小麥基因組中SEQ ID No.1的第1918位核苷酸，其為T或C；所述dCAPS-2002為小麥基因組的一個(gè)SNP位點(diǎn)，所述dCAPS-2002位于小麥基因組中SEQ ID No.1的第2002位核苷酸，其為C或T。

2.檢測(cè)小麥基因組中dCAPS-1918的多態(tài)性或基因型的物質(zhì)和/或檢測(cè)小麥基因組中dCAPS-2002的多態(tài)性或基因型的物質(zhì)在制備鑒定或輔助鑒定小麥產(chǎn)量性狀產(chǎn)品中的應(yīng)用；所述dCAPS-1918為小麥基因組的一個(gè)SNP位點(diǎn)，所述dCAPS-1918位于小麥基因組中SEQ IDNo.1的第1918位核苷酸，其為T或C；所述dCAPS-2002為小麥基因組的一個(gè)SNP位點(diǎn)，所述dCAPS-2002位于小麥基因組中SEQ ID No.1的第2002位核苷酸，其為C或T。

3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的應(yīng)用，其特征在于：所述檢測(cè)小麥基因組中dCAPS-1918的多態(tài)性或基因型的物質(zhì)為擴(kuò)增包括dCAPS-1918在內(nèi)的小麥基因組DNA片段的引物對(duì)；所述檢測(cè)小麥基因組中dCAPS-2002的多態(tài)性或基因型的物質(zhì)為擴(kuò)增包括dCAPS-2002在內(nèi)的小麥基因組DNA片段的引物對(duì)。

4.鑒定或輔助鑒定小麥產(chǎn)量性狀的方法，為I或II：

I、包括步驟P1)和P2)：

P1)檢測(cè)待測(cè)小麥的單倍型，所述單倍型為Hap-6D-1、Hap-6D-2和Hap-6D-3，所述單倍型為Hap-6D-1的小麥中權(quán)利要求1中所述dCAPS-1918的基因型為T和權(quán)利要求1中所述dCAPS-2002的基因型為C；所述單倍型為Hap-6D-2的小麥中權(quán)利要求1中所述dCAPS-1918的基因型為T和權(quán)利要求1中所述dCAPS-2002的基因型為T；所述單倍型為Hap-6D-3的小麥中權(quán)利要求1中所述dCAPS-1918的基因型為C和權(quán)利要求1中所述dCAPS-2002的基因型為C；

P2)根據(jù)待測(cè)小麥的單倍型確定待測(cè)小麥的產(chǎn)量性狀：Hap-6D-1和Hap-6D-2單倍型小麥的產(chǎn)量高于或候選高于Hap-6D-3單倍型小麥，Hap-6D-1單倍型小麥的產(chǎn)量與Hap-6D-2單倍型小麥的產(chǎn)量差異不顯著；

II、包括步驟Q1)和Q2)：

Q1)檢測(cè)待測(cè)小麥的中權(quán)利要求1所述的dCAPS-1918的基因型；

Q2)根據(jù)待測(cè)小麥的dCAPS-1918的基因型確定待測(cè)小麥的產(chǎn)量性狀：所述dCAPS-1918為T時(shí)的小麥的產(chǎn)量高于或候選高于所述dCAPS-1918為C的小麥的產(chǎn)量。

5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的方法，其特征在于：所述步驟P1)中檢測(cè)待測(cè)小麥的單倍型具體包括：利用引物對(duì)TaNRT2-6D-Primer對(duì)所述待測(cè)小麥的基因組DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增，得到PCR產(chǎn)物；對(duì)所述PCR產(chǎn)物進(jìn)行測(cè)序獲得所述待測(cè)小麥基因組DNA中對(duì)應(yīng)于序列表中SEQ IDNo.1的第1918和2002位的核苷酸確定所述待測(cè)小麥的單倍型；

所述PCR產(chǎn)物對(duì)應(yīng)于序列表中SEQ ID No.1的第1918和2002位的核苷酸分別為T和C的待測(cè)小麥為Hap-6D-1單倍型小麥；所述PCR產(chǎn)物對(duì)應(yīng)于序列表中SEQ ID No.1的第1918和2002位的核苷酸分別為T和T的待測(cè)小麥為Hap-6D-2單倍型小麥；所述PCR產(chǎn)物對(duì)應(yīng)于序列表中SEQ ID No.1的第1918和2002位的核苷酸分別為C和C的待測(cè)小麥為Hap-6D-3單倍型小麥；

所述引物對(duì)TaNRT2-6D-Primer由名稱分別為TaNRT2-6D-Primer-F和TaNRT2-6D-Primer-R的單鏈DNA組成：

所述TaNRT2-6D-Primer-F為序列表中SEQ ID No.6所示的單鏈DNA；

所述TaNRT2-6D-Primer-R為序列表中SEQ ID No.7所示的單鏈DNA。