[發明專利]檢測NPM1基因突變的引物、試劑盒和方法在審
| 申請號: | 201910892003.3 | 申請日: | 2019-09-20 |
| 公開(公告)號: | CN110564828A | 公開(公告)日: | 2019-12-13 |
| 發明(設計)人: | 林筱劍 | 申請(專利權)人: | 上海艾迪康醫學檢驗所有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/6858 | 分類號: | C12Q1/6858;C12N15/11 |
| 代理公司: | 33246 浙江千克知識產權代理有限公司 | 代理人: | 黎雙華 |
| 地址: | 200237 上海市*** | 國省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 引物 核仁磷酸蛋白 檢測結果 快速檢測 位點突變 預后 可用 擴增 位點 突變 體內 參考 基因 檢測 治療 | ||
1.檢測NPM1基因突變的引物,其特征在于,NPM1基因突變位點是c.863-864位點,所述引物包括:擴增NPM1的c.863-864位點的擴增引物NPM1-F、NPM1-R和測序引物M13F、M13R,其堿基序列為:
NPM1-F:TGTAAAACGACGGCCAGTATTGATGTCTATGAAGTGTTGTGG
NPM1-R:AACAGCTATGACCATGATTTATCAAACACGGTAGGGAA
M13F:TGTAAAACGACGGCCAGT
M13R:AACAGCTATGACCATG。
2.檢測NPM1基因c.863-864位點突變的方法,其特征在于,包括以下步驟:
(1)抽提外周血中的基因組DNA;
(2)利用擴增引物NPM1-F、NPM1-R對步驟(1)中提取的DNA進行擴增,獲得擴增產物;
NPM1-F:TGTAAAACGACGGCCAGTATTGATGTCTATGAAGTGTTGTGG
NPM1-R:AACAGCTATGACCATGATTTATCAAACACGGTAGGGAA
(3)利用測序引物M13F、M13R對步驟(2)中的擴增產物進行測序;
M13F:TGTAAAACGACGGCCAGT
M13R:AACAGCTATGACCATG
(4)對測序結果進行判斷,通過判讀NPM1基因c.863-864位點的測序圖與參考序列是否相符來判斷NPM1基因是否發生突變。
3.檢測NPM1基因c.863-864位點突變情況的試劑盒,所述試劑盒包括檢測體系PCR擴增反應液、測序體系反應液,其特征在于,所述檢測體系PCR擴增反應液包括一對擴增引物NPM1-F、NPM1-R,所述測序體系反應液包括一對測序引物M13F、M13R,其序列為:
NPM1-F:TGTAAAACGACGGCCAGTATTGATGTCTATGAAGTGTTGTGG
NPM1-R:AACAGCTATGACCATGATTTATCAAACACGGTAGGGAA
M13F:TGTAAAACGACGGCCAGT
M13R:AACAGCTATGACCATG。
4.如權利要求3所述的試劑盒,其特征在于,所述檢測體系PCR擴增反應液還包括2×PCR Buffer、dNTPs和KOD FX DNA聚合酶。
5.如權利要求3所述的試劑盒,其特征在于,所述測序體系反應液還包括EDTA、無水乙醇、75%乙醇、HIDI和Bigdye Terminator V3.1。
6.如權利要求3所述的試劑盒,其特征在于,所述測序體系反應液還包括測序純化液,所述測序純化液包括核酸外切酶I和牛小腸堿性磷酸酶。
7.如權利要求3所述的試劑盒,其特征在于,所述試劑盒還包括陽性對照品和陰性對照品。
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