[發(fā)明專利]一種宮頸液基細(xì)胞切片質(zhì)量檢測系統(tǒng)有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201910808104.8 | 申請日: | 2019-08-29 |
| 公開(公告)號: | CN110376198B | 公開(公告)日: | 2021-08-10 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 鮮雨宏;尚濱;彭鈴淦 | 申請(專利權(quán))人: | 廣州錕元方青醫(yī)療科技有限公司 |
| 主分類號: | G01N21/85 | 分類號: | G01N21/85 |
| 代理公司: | 暫無信息 | 代理人: | 暫無信息 |
| 地址: | 510080 廣東省廣州市*** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 一種 宮頸 細(xì)胞 切片 質(zhì)量 檢測 系統(tǒng) | ||
1.一種宮頸液基細(xì)胞切片質(zhì)量檢測系統(tǒng),其特征在于:包括切片數(shù)據(jù)處理模塊(1)、鱗狀細(xì)胞數(shù)量評估模塊(2)、模糊檢測模塊(3)、異常檢測模塊(4)和綜合模塊(5),所述切片數(shù)據(jù)處理模塊(1)輸出端與鱗狀細(xì)胞數(shù)量評估模塊(2)輸入端連接,所述鱗狀細(xì)胞數(shù)量評估模塊(2)輸出端與模糊檢測模塊(3)輸入端連接,所述模糊檢測模塊(3)輸出端與異常檢測模塊(4)輸入端連接,所述異常檢測模塊(4)輸出端與綜合模塊(5)輸入端連接;
所述切片數(shù)據(jù)處理模塊(1)用于針對不同掃描儀掃描圖像切片格式不同造成的數(shù)據(jù)較大且較為復(fù)雜的情況進(jìn)行處理,對整張切片圖像進(jìn)行抽樣采集,反應(yīng)整體的信息;
所述切片數(shù)據(jù)處理模塊(1)處理的格式包括tif、kfb、TMAP,針對每一格式的數(shù)據(jù),都分為兩個階段:1)數(shù)據(jù)讀入階段;2)數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化階段;
數(shù)據(jù)讀入階段對每一種格式的切片開發(fā)一個獨立的接口,用于數(shù)據(jù)讀入內(nèi)存;
數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化階段將讀入內(nèi)存的數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)一的處理,該階段主要包含三個標(biāo)準(zhǔn)化操作:
1)通道順序標(biāo)準(zhǔn)化,通道順序按照R、G、B排列;
2)金字塔層級標(biāo)準(zhǔn)化,掃描得到的切片圖像一般為金字塔狀的多層級存儲形式,且采用40x的圖像;
3)數(shù)據(jù)采集標(biāo)準(zhǔn)化,采用以下方法對其進(jìn)行采樣:
a.去掉圖像空白范圍或細(xì)胞零散的邊緣;
b.在圖像1中找到均勻間隔的16個點,16個點呈4行4列分布,
c.以這些點為所切圖像的右上角,按照一定的長寬采集patch圖像;
所述鱗狀細(xì)胞數(shù)量評估模塊(2)利用二值形態(tài)學(xué)的圖像處理技術(shù)對鱗狀細(xì)胞數(shù)量進(jìn)行評估,計算鱗狀細(xì)胞的數(shù)目;
所述鱗狀細(xì)胞數(shù)量評估模塊(2)包括圖像預(yù)處理和細(xì)胞數(shù)量預(yù)估兩部分;
a)圖像預(yù)處理用于根據(jù)圖像的深淺加強(qiáng)對比度,判斷圖像深淺的依據(jù)有:1.平均灰度值;2.灰度值大于220的占比;公式如下:
其中Iavg為平均灰度值,Ii,j為各處的灰度值;SI>220為灰度值大于220的占比,NI>220為灰度值大于220的像素點數(shù)目,w、h為圖像寬和長;
根據(jù)以上兩個指標(biāo)就能夠初步判斷圖像的顏色深淺;若Iavg>220且SI>220>0.8則說明圖像顏色較淺,需要進(jìn)行直方圖均衡化,加強(qiáng)對比度;
b)細(xì)胞數(shù)量預(yù)估,通過上述方法對圖像進(jìn)行預(yù)處理后,就能預(yù)估大部分圖像的鱗狀細(xì)胞數(shù)量;將數(shù)學(xué)形態(tài)學(xué)的2個基本運算即腐蝕和膨脹相結(jié)合,采用先腐蝕后膨脹的開運算得到圖像中的鱗狀細(xì)胞,腐蝕公式如下:
AΘB={x,y|Bxy∈A}
該式表示用結(jié)構(gòu)B腐蝕A,由于細(xì)胞近似橢圓形,所以B選用的是橢圓形結(jié)構(gòu);
膨脹公式如下:
該式表示用結(jié)構(gòu)B膨脹A,將與目標(biāo)區(qū)域接觸的背景點合并到該目標(biāo)物中,使目標(biāo)邊界向外擴(kuò)張,B仍然選用橢圓形結(jié)構(gòu);使用開運算得到了只有鱗狀細(xì)胞的二值圖像,通過尋找該圖像的四鄰域連通區(qū)域,計算鱗狀細(xì)胞的數(shù)目;
所述模糊檢測模塊(3)基于圖像內(nèi)容,結(jié)合二次模糊的方法來評價圖像的模糊程度,用于對圖像進(jìn)行清晰度評估;
所述異常檢測模塊(4)采用卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)自動提取特征,通過網(wǎng)絡(luò)訓(xùn)練區(qū)分經(jīng)血液污染、膠水覆蓋以及氣泡覆蓋的異常圖像;
所述綜合模塊(5)用于通過細(xì)胞數(shù)量判斷、圖像模糊判斷以及異物檢測判斷評價整個切片圖像的質(zhì)量。
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- 專利分類
G01N 借助于測定材料的化學(xué)或物理性質(zhì)來測試或分析材料
G01N21-00 利用光學(xué)手段,即利用紅外光、可見光或紫外光來測試或分析材料
G01N21-01 .便于進(jìn)行光學(xué)測試的裝置或儀器
G01N21-17 .入射光根據(jù)所測試的材料性質(zhì)而改變的系統(tǒng)
G01N21-62 .所測試的材料在其中被激發(fā),因之引起材料發(fā)光或入射光的波長發(fā)生變化的系統(tǒng)
G01N21-75 .材料在其中經(jīng)受化學(xué)反應(yīng)的系統(tǒng),測試反應(yīng)的進(jìn)行或結(jié)果
G01N21-84 .專用于特殊應(yīng)用的系統(tǒng)
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