[發明專利]何首烏所致肝損傷SNP位點以及在疾病預測與診斷中的應用

有效

• 申請號: 201910801261.6
• 申請日: 2019-08-28
• 公開（公告）號: CN110423808B
• 公開（公告）日: 2022-09-20
• 發明（設計）人: 王貴強;侯鳳琴;楊婉娜;逄麗麗
• 申請（專利權）人: 北京大學第一醫院
• 主分類號: C12Q1/6883
• 分類號: C12Q1/6883;C12N15/11
• 代理公司: 北京元本知識產權代理事務所(普通合伙) 11308
• 代理人: 秦力軍

本發明屬于分子生物學領域，具體來說，涉及一種由何首烏導致的肝損傷SNP位點，以及該SNP位點在疾病預測與診斷中的應用。本發明首先提供一種由何首烏所致肝損傷的SNP位點，所述何首烏所致肝損傷SNP位點位于HLA?B基因上自5’端開始的第3009位，所述SNP位點堿基為G，所述位點命名為rs1055348。所述SNP位點主要由堿基T突變為堿基G。

技術領域

本發明屬于分子生物學領域，具體來說，涉及一種由何首烏導致的肝損傷SNP位點，以及該SNP位點在疾病預測與診斷中的應用。

背景技術

何首烏根據炮制方法不同，分為生首烏和制首烏。2015版《中華人民共和國藥典》記載生首烏解毒，消癰，截瘧，潤腸通便，用于瘡癰，瘰疬，風疹瘙癢，久瘧體虛，腸燥便秘；制首烏補肝腎，益精血，烏須發，強筋骨，化濁降脂，用于血虛萎黃，眩暈耳鳴，須發早白，腰膝酸軟，肢體麻木，崩漏帶下，高脂血癥，是一種珍貴的中藥。

然而，近年來關于何首烏所致肝損傷的報告越來越多，英國藥品和健康產品管理局于2006年對何首烏肝損害不良反應發出警告，我國家食品藥品監管總局亦于2014年發文提示關注口服何首烏肝損傷風險。因此，如果可以找到何首烏肝損傷的易感基因，用于預測何首烏肝損傷的發生，則可以大大降低何首烏肝損傷的發病率，有利于何首烏在臨床的進一步應用及全球推廣。

2019年4月份Chaopeng Li等在雜志《Hepatology》發表學術論文，證實HLA-B*35:01是何首烏所致肝損傷的危險因素，并可成為人類何首烏肝損傷的預測因素。但該研究的不足之處在于包含的例數較少，僅有26例何首烏所致肝損傷病例；再者，HLA-B基因型檢測較為繁瑣，檢測費較貴，不利于該項檢測在各大醫院推廣。

相較于檢測HLA-B基因型，作為點突變的單核苷酸多態性(Single nucleotidepolymorphism,SNP)的檢測則更為方便經濟。SNP是指DNA序列上發生的單個核苷酸堿基的變異，已經發現很多基因的SNP位點與疾病有關聯。大多數SNP位于基因的非編碼區，其對個體表現型是無意義的，但對群體而言，這些SNP作為遺傳標記在群體遺傳和生物進化中有很大作用。特定DNA區域的特定SNP在特定群體中的序列驗證和頻率分析以及SNP與特定生理、病理狀態的關系是未來的研究重點。

鑒于此，本發明團隊經過艱苦的研究與探索發現一種與何首烏引起的肝損傷相關的SNP位點，可用于對何首烏易感人群的篩選，及藥物性肝損傷病人的病因診斷，用藥前進行篩查可降低何首烏肝損傷的發病率，有助于中藥何首烏的推廣。本發明的何首烏所致肝損傷的預測及診斷價值為本課題組首先發現，國內外尚無文獻進行報道。

發明內容

有鑒于此，本發明的目的之一在于提供與何首烏所致肝損傷相關聯的SNP位點。

為實現上述目的，本發明的技術方案為：

.何首烏所致肝損傷SNP位點，所述何首烏所致肝損傷SNP位點位于HLA-B基因自5’端開始第3009位，所述SNP位點堿基為G。將所述位點命名為rs1055348。

進一步，主要由堿基T突變為堿基G。

在人群中，攜帶上述突變的人服用何首烏發生肝損傷的比例會顯著高于不攜帶此突變的人群。

進一步，所述HLA-B基因的核苷酸序列如Seq ID No.1所示。

上述何首烏所致肝損傷SNP位點在預測與診斷何首烏引起的肝損傷中的應用。

既往前瞻性隊列研究發現HLA-B*3501基因分型可作為何首烏所致肝損傷的預測因子，但是HLA-B分型的檢測復雜且昂貴，而本發明發現的突變位點rs1055348，其檢測則更為便捷，且所需費用較少，可以大大降低檢測何首烏易感性所需的費用。此外，檢測SNP時只需記錄全或無(+或-)，而無需像檢測微衛星標記那樣對片段長度做出測量，易于實現自動化分析。