[發明專利]水稻抗褐飛虱主效基因bph3的SNP分子標記及其KASP檢測方法和應用

有效

• 申請號: 201910773234.2
• 申請日: 2019-08-21
• 公開（公告）號: CN110423839B
• 公開（公告）日: 2022-12-02
• 發明（設計）人: 盧東長城;何新柳;玉寧;何發儉;韋嬌君
• 申請（專利權）人: 南寧維爾凱生物科技有限公司
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11
• 代理公司: 廣西南寧公平知識產權代理有限公司 45104
• 代理人: 楊立華

1.水稻抗褐飛虱主效基因bph3的SNP分子標記用于輔助鑒定水稻抗褐飛虱主效基因bph3，其特征在于：所述分子標記的SNP位點包括SNP位點1和SNP位點2，所述SNP位點1位于SEQ ID NO.1所示序列第101位堿基，分子標記多態性為C/T；所述SNP位點2位于SEQ IDNO.2所示序列第86位堿基，分子標記多態性為C/T。

2.水稻抗褐飛虱主效基因bph3的SNP分子標記的檢測引物組，其特征在于包括SNP位點1的引物組和SNP位點2的引物組，SNP位點1的引物組包括引物PrimerX、PrimerY、PrimerC，它們分別為SEQ ID NO.3、SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.5所示的堿基序列；SNP位點2的引物組包括引物PrimerX’、PrimerY’、PrimerC’，它們分別為SEQ ID NO.6、SEQ ID NO.7、SEQ IDNO.8所示的堿基序列。

3.權利要求2所述檢測引物組用于檢測水稻抗褐飛虱主效基因bph3。

4.含有權利要求2所述檢測引物組的試劑盒。

5.權利要求4所述試劑盒在培育具有抗褐飛虱主效基因水稻中的應用。

6.一種水稻抗褐飛虱主效基因bph3的SNP分子標記的KASP檢測方法，其特征在于以水稻基因組DNA為模板，利用特異性檢測引物組進行KASP反應檢測；所述檢測引物組包括SNP位點1的引物組和SNP位點2的引物組，SNP位點1的引物組包括引物PrimerX、PrimerY、PrimerC，它們分別為SEQ ID NO.3、SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.5所示的堿基序列；SNP位點2的引物組包括引物PrimerX’、PrimerY’、PrimerC’，它們分別為SEQ ID NO.6、SEQ ID NO.7、SEQ ID NO.8所示的堿基序列。

7.根據權利要求6所述的分子標記的KASP檢測方法，其特征在于所述KASP反應檢測中Touchdown PCR反應條件為：30℃1min；94℃15min；第一步擴增反應，94℃20sec，61-55℃1min，每個循環退火及延伸溫度降低0.6℃，共10個循環；第二步擴增反應，94℃20sec，55℃1min，共27個循環；30℃1min。