[發明專利]一種用于結核耐藥診斷的微生物標志物及其應用

在審

• 申請號: 201910735053.0
• 申請日: 2019-08-09
• 公開（公告）號: CN110499353A
• 公開（公告）日: 2019-11-26
• 發明（設計）人: 王威;林東子;曾今誠;林碧華;余曉琳;林炳耀;劉新光;周杰
• 申請（專利權）人: 佛山市第四人民醫院(佛山市結核病防治所);廣東醫科大學
• 主分類號: C12Q1/06
• 分類號: C12Q1/06;C12R1/01
• 代理公司: 44205 廣州嘉權專利商標事務所有限公司
• 代理人: 鄭瑩<國際申請>=<國際公布>=<進入國

本發明公開了一種用于結核耐藥診斷的微生物標志物，所述微生物標志物為痰液微生物標志物，包括纖毛菌屬(Leptotrichia)、顆粒鏈菌屬(Granulicatella)、彎曲菌屬(Campylobacter)、代爾夫特菌(Delftia)、金氏菌屬(Kingella)、羅爾斯通菌屬(Ralstonia)、嗜衣原體屬(Chlamydophila)、博代氏桿菌屬(Bordetella)中的至少一種。本發明提供了一種快速診斷結核耐藥類型的生物標志物。根據不同結核耐藥類型個體的痰液微生態進行分析，從平衡上呼吸道微生物的角度為結核耐藥的治療提供新的思路。

技術領域

本發明涉及微生物醫學領域，特別涉及一種用于結核耐藥診斷的微生物標志物及其應用。

背景技術

世界每年有940萬人受結核(Tuberculosis,TB)感染，超過130萬人死于結核。結核已經成為全球關注的主要健康問題。一項流行病學模型估計在沒有適當治療和預防措施的情況下，1998-2030年間結核將感染2.25億人和導致7900萬人死亡。隨著耐藥結核菌株的流行使得疾病的控制變得更復雜，有研究估計原發耐藥結核是獲得性耐藥結核的3倍。耐藥結核的流行與肺結核發病率和死亡率密切相關，是導致結核病患者死亡的最主要原因。早期發現和及時規范治療是當前耐藥結核防控的關鍵。

目前耐藥結核的診斷主要包括表型檢測和分子基因型檢測。傳統藥物敏感性檢測(drug susceptibility testing,DST)是耐藥結核檢測的金標準，但總體而言，基于結核菌培養的表型檢測技術檢測周期長、操作復雜、不易標準化，不能充分滿足臨床快速診斷的需要。此外，部分標本因結核菌含量低、培養陰性，無法進行耐藥性檢測。分子藥敏檢測技術近年來進展迅速，是WHO重點推薦的結核病快速藥敏檢測方法，與培養法相比，分子基因型檢測迅速，周期短至1-2d，甚至數小時。分子基因型檢測具有檢測迅速、特異性和靈敏度高的特點，但它無法鑒定未知的耐藥突變和部分一二線藥物耐藥突變，且對異質性耐藥標本檢測敏感性低，因此臨床上不能完全取代表型檢測技術。總之，隨著對耐藥結核快速檢測的深入研究，新的診斷技術和產品不斷涌向臨床，但耐藥結核的變異多樣化，各實驗室受到不同條件的限制，均不能充分滿足臨床檢測需求，因此探究新的檢測方法和篩選新的診斷標志物顯得尤為重要。

近年來隨著測序技術的發展，和對人體微生態的不斷深入研究，發現我們人體內定植的微生物在人生理過程中扮演著重要角色，TB可能是復雜的微生物群落相互作用，而不是傳統上認為的單一病原體導致的結果。在健康個體中微生態組成和豐度的動態平衡被打破，將導致菌群紊亂，致病菌的增殖，生物體相關的病理免疫應答和疾病產生。有研究發現結核患者肺部微生態環境可能更容易受到外來微生物定植，結核患者痰液中致病菌存在更高的多樣性和復雜性。因此通過對痰液樣本微生物組成的研究和篩選出與結核耐藥類型相關性高的生物標志物有重要意義。一方面，利用結核病有關的生物標志物可以為結核藥敏診斷提供新的方法，縮短診斷周期。另一方面，對不同耐藥類型結核患者的治療具有一定的臨床指導意義。

發明內容

本發明的目的在于提供一種用于結核耐藥診斷的微生物標志物及其應用。

本發明所采取的技術方案是：

痰液微生物作為結核耐藥診斷標志物的應用，其中，痰液微生物為纖毛菌屬(Leptotrichia)、顆粒鏈菌屬(Granulicatella)、彎曲菌屬(Campylobacter)、代爾夫特菌(Delftia)、金氏菌屬(Kingella)、羅爾斯通菌屬(Ralstonia)、嗜衣原體屬(Chlamydophila)、博代氏桿菌屬(Bordetella)中的至少一種。