[發明專利]一種馬口魚DNA條形碼序列及其應用

在審

• 申請號: 201910647588.2
• 申請日: 2019-07-17
• 公開（公告）號: CN110438241A
• 公開（公告）日: 2019-11-12
• 發明（設計）人: 熊飛;曹夢西;王瑩;劉紅艷;文涵宇
• 申請（專利權）人: 江漢大學
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;C12N15/11
• 代理公司: 北京華沛德權律師事務所 11302
• 代理人: 房德權

本發明公開了一種馬口魚DNA條形碼序列及其應用，屬于物種鑒定技術領域。該所述馬口魚DNA條形碼為馬口魚COI基因，該DNA條形碼序列可以作為馬口魚DNA的標準檢測序列，有效的對馬口魚特有種進行鑒定。

技術領域

本發明屬于物種鑒定技術領域，具體涉及一種馬口魚DNA條形碼序列及其應用。

背景技術

物種鑒定一直是分類學乃至幾乎所有生物領域上的研究至關重要的基礎步驟。因此，準確的對物種鑒定和分類就顯得尤其重要。目前，各國研究者已經開展了從湖泊到海洋不同地理區域的魚類DNA條形碼研究計劃，研究表明DNA條形碼在物種鑒定方面具有高效可行性。大量的研究結果顯示以COI基因為標記的DNA條形碼能夠準確的對各類動物進行物種鑒定，可以選用COI基因作為各種動物條形碼數據庫的標準條形碼。

DNA條形碼是指生物體內能夠代表該物種的、有足夠變異的、標準的、易擴增并且相對較短的DNA片段。DNA條形碼技術就像在零售業中運用的商品條形碼一樣，通過對物種的一個或多個基因進行掃描，建立起DNA序列和生物物種之間相互對應的關系，從而可以快速、準確的進行物種鑒定。線粒體DNA的COI基因具有長度適中、進化速率適中和富含系統進行發育信息等特點。在研究中，能夠較好地對物種的COI基因片段進行有效擴增。因此，在動物物種分類和鑒定中，COI基因作為條形碼應用有很大的潛力。

利用傳統形態鑒定方法具有一定的局限性，比如會受到物種性別、發育階段、表型可塑性等因素的影響而導致不正確的鑒定等。在實際操作中，也會遇到標本量較少以及樣本保存不完整等問題，導致不正確的鑒定。采用DNA條形碼結合傳統的分類學方法，對物種高效準確的鑒定和分類起著重要的作用。

馬口魚(Opsariichthys bidens)，隸屬鯉形目(Cypriniformes)，鯉科(Cyprinidae)，亞科(Danioninae)，馬口魚屬(Opsariichthys)。馬口魚多生活于溪流及水庫等清澈水體中，尤其喜在水流較急的淺灘、底質為砂石的小溪和江河支流中集群生活,以小魚、小蝦、水生昆蟲等為食，馬口魚肉質與品味俱佳,深受消費者青睞。近年來,馬口魚自然資源因過度利用及棲息地水環境污染等原因而衰退,因此種質資源的保護引起了重視，有必要對其種質進行準確有效的鑒定。

在現有的技術中，均沒有馬口魚DNA條形碼標準檢測序列以及馬口魚COI基因作為馬口魚DNA條形碼標準檢測序列的記載和報道。

發明內容

本發明目的是提供一種可以作為馬口魚DNA的標準檢測序列，能夠有效的對馬口魚特有種進行鑒定。

本發明所采用的技術方案是：

一種馬口魚DNA條形碼序列，序列為SEQ ID NO.1，具體序列為：

優選地，所述馬口魚DNA條形碼為馬口魚COI(cytochrome c oxidase subunit I，細胞色素c氧化酶亞基I)基因。

該DNA條形碼序列可以作為馬口魚DNA的標準檢測序列，有效的對馬口魚特有種及其樣本進行鑒定。

本發明具有以下優點：

(1)本發明所得到的馬口魚DNA條形碼序列可以作為馬口魚DNA的標準檢測序列，對馬口魚特有種高效和準確的進行和分類，同時利用該DNA條形碼序列對馬口魚樣品進行鑒定，步驟少、方法簡單。

(2)在實際操作中，該馬口魚DNA條形碼便于保存，方便比對。

(3)馬口魚肉質與品味俱佳,深受消費者青睞，但因自然資源因過度利用及棲息地水環境污染等原因馬口魚物種衰退，本發明技術方案可以對馬口魚物種進行有效的保護。

具體實施方式

實施例1