[發明專利]一對用于石榴品種鑒定的專用SSR引物及其應用

有效

• 申請號: 201910631054.0
• 申請日: 2019-07-12
• 公開（公告）號: CN110172528B
• 公開（公告）日: 2022-03-22
• 發明（設計）人: 秦改花;劉春燕;黎積譽;齊永杰;高正輝;潘海發;伊興凱
• 申請（專利權）人: 安徽省農業科學院園藝研究所
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12Q1/686;C12N15/11
• 代理公司: 杭州奧創知識產權代理有限公司 33272
• 代理人: 趙梅

本發明公開了一對用于石榴品種鑒定的專用SSR引物PG080，包括正向引物和反向引物，正向引物核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，反向引物核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。本發明提供的引物對PG080多態性高，利用其對22個石榴品種DNA進行擴增，僅HN12可特異性地擴增出159bp的條帶，僅SXXA18可特異性地擴增出161bp的條帶，僅CY01可特異性地擴增出140bp；還可根據條帶大小對AH15、AHHB12、AH20、HN15、HY04、HY16、HY21、SD02、SD08、SD19品種進行區分。

技術領域

本發明涉及分子標記技術領域，具體涉及一對用于石榴品種鑒定的專用SSR引物及其應用。

背景技術

石榴是古老的保健水果，果實富含花青苷、黃酮、安石榴苷等多酚類物質，特別是安石榴苷等鞣花單寧類物質臨床醫用和保健價值高，具有潛在的抗氧化、抗癌、抗菌等功能，被譽為超級水果，被劃為國家規劃特色經濟林樹種之一。石榴在中國有2000多年的栽培歷史，不同地域間的引種和品種交換頻繁，導致了現有品種間混雜，同物異名或同名異物現象非常普遍。品種混雜，不僅給育種親本選配帶來了困難，對生產中大規模引種也造成了嚴重影響，一定程度上制約了石榴產業的快速健康發展。因此，開發特異性引物進行石榴品種資源的遺傳鑒定對科學合理利用石榴資源有著重要的現實意義。

目前，對石榴品種的鑒定主要是通過表型特征，包括樹勢、葉、花、果實特征等，這些表型特征易受到環境因素影響。分子標記可以直接檢測不同品種或個體在DNA分子水平上的差異，具有較高的多態性和個體特異性，且不受環境和生長階段影響，能鑒定形態標記所難以鑒定的個體。SSR分子標記數量豐富且隨機分布于基因組中，具有等位變異高、檢測方便等特點，已被蘋果、葡萄、水稻等的品種鑒定上。傳統上，SSR標記的開發主要是基于基因組DNA文庫或者富含特異微衛星的文庫，該方法工作量大且得到的標記數量比較有限；本發明是在石榴全基因組中挖掘特異性強、多態性高的SSR用于品種鑒定，結果對石榴資源的科學合理利用具有重要的參考價值。

發明內容

本發明第一方面提供了一對用于石榴品種鑒定的專用SSR引物PG080，包括正向引物和反向引物，正向引物核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，反向引物核苷酸序列如SEQ IDNO.2所示。

本發明第二方面提供了上述引物對PG080在石榴育種中的應用。

本方面第三方面提供了上述引物對PG080在石榴品種鑒定中的應用。

本發明第四方面提供了上述引物對PG080在石榴HN12、SXXA18、CY01、AH15、AHHB12、AH20、HN15、HY04、HY16、HY21、SD02、SD08、SD19品種鑒定中的應用。

本發明的有益效果：

1.本發明提供的引物對PG080特異性強，利用其對22個石榴品種DNA進行擴增，僅HN12可特異性地擴增出159bp的條帶，僅SXXA18可特異性地擴增出161bp的條帶，僅CY01可特異性地擴增出140bp的條帶。

2.本發明提供的引物對PG080多態性高，除了可根據特異性條帶鑒定品種，還可根據條帶大小對AH15、AHHB12、AH20、HN15、HY04、HY16、HY21、SD02、SD08、SD19品種進行區分。

3.利用引物對PG080開展的品種鑒定技術具有取材方便、鑒定技術簡便快速、結果高度準確穩定的特點。本方法中可以取幼苗或成年植株的葉、花、果實、芽等組織或器官的基因組DNA進行檢測，取樣不受季節、地點限制。另外，該技術是利用PCR擴增結果進行毛細管電泳即可判讀結果，技術簡便快捷。檢測結果也高度準確穩定。

具體實施方式

下面結合實施例對本發明做更進一步地解釋。下列實施例僅用于說明本發明，但并不用來限定本發明的實施范圍。

實施例1