[發明專利]用于樣品處理的組合物和方法

在審

• 申請號: 201910621839.X
• 申請日: 2014-06-26
• 公開（公告）號: CN110592182A
• 公開（公告）日: 2019-12-20
• 發明（設計）人: 本杰明·辛德森;克里斯多佛·辛德森;邁克爾·史諾-萊文;凱文·奈斯;米爾娜·雅羅什;唐納德·馬斯克利耶;瑟奇·薩克森諾夫;蘭登·梅里爾;安德魯·普萊斯;保羅·哈登伯爾;媛·李
• 申請（專利權）人: 10X基因組學有限公司
• 主分類號: C12Q1/6806
• 分類號: C12Q1/6806;C12Q1/6813;C12Q1/6869;C40B50/06
• 代理公司: 11262 北京安信方達知識產權代理有限公司
• 代理人: 賀淑東

1.一種對樣品材料進行條形碼化的方法，其包括：

提供第一分區，其包含與之關聯的多個核酸條形碼分子，所述多個核酸條形碼分子包含相同的核酸條形碼序列；

將第一分區與樣品材料的組分共同分配至第二分區；

將所述條形碼分子從所述第一分區釋放至所述第二分區內；以及

將所述條形碼分子附接至所述第二分區內的樣品材料的一種或多種組分或其片段。

2.一種對樣品材料進行條形碼化的方法，其包括：

提供包含多個不同核酸條形碼序列的多個第一分區，其中所述多個第一分區中的每一個均包含多個核酸條形碼分子，該核酸條形碼分子具有與之關聯的相同核酸條形碼序列；

將所述多個第一分區與樣品材料的組分共同分配至多個第二分區；

將所述條形碼分子從所述多個第一分區釋放至所述多個第二分區內；以及

使所述條形碼分子附接至所述多個第二分區內的樣品材料的組分。

3.一種對樣品材料進行條形碼化的方法，其包括：

提供可激活的核酸條形碼序列；

將所述可激活的核酸條形碼序列與樣品材料的一種或多種組分一起分配至第一分區；

激活所述可激活的核酸條形碼序列，以在所述第一分區中產生活性核酸條形碼序列；以及

將所述活性核酸條形碼序列附接至所述樣品材料的一種或多種組分。

4.一種組合物，其包含：

第一分區，其包含一種或多種樣品組分；以及

包含在所述第一分區內的第二分區，所述第二分區具有可釋放地與之關聯的多個寡核苷酸，所述多個寡核苷酸包含共同的條形碼序列。

5.一種方法，其包括：

使核酸的樣品與條形碼化珠子的文庫組合，以形成混合物；

將該混合物分配至多個分區，其中所述分區的至少一個子集包含至多一個條形碼化珠子；以及

在所述分區內，將條形碼從所述條形碼化珠子釋放。

6.一種組合物，其包含與包含相同條形碼序列和可變結構域的多個寡核苷酸共價連接的珠子。

7.一種組合物，其包含珠子，其中：

所述珠子包含多個多于1,000,000個寡核苷酸，其中所述多個寡核苷酸中的每一個均包含恒定區和可變區；并且

所述珠子能夠基本上被還原劑溶解。

8.一種組合物，其包含：

多個珠子；

其中所述多個珠子中的每一個均包含可釋放地偶聯至其上的多個寡核苷酸；

其中與來自所述多個珠子的單獨珠子關聯的所述多個寡核苷酸包含共同的條形碼結構域和可變結構域；并且

其中所述共同的條形碼結構域在所述多個珠子中的兩個或更多個珠子之間是不同的。

9.一種生成功能化珠子的方法，其包括：

a.使多個聚合物或單體與一個或多個寡核苷酸混合；

b.交聯所述多個聚合物或單體，使得在所述多個聚合物或單體之間形成二硫鍵，從而形成硬化的珠子；以及

c.導致在所述一個或多個寡核苷酸與所述多個聚合物或單體之間形成共價聯接。

10.一種制備條形碼文庫的方法，其包括：

提供多個單獨的第一珠子群體；

將包含第一條形碼序列段的第一寡核苷酸附接至所述單獨的第一珠子群體，其中每一個單獨的第一珠子群體均包含附接至其上的不同的第一條形碼序列段；

合并所述單獨的珠子群體以提供第一合并的珠子群體；

將所述第一合并的珠子群體分離成多個第二珠子群體；

將包含第二條形碼序列段的第二寡核苷酸附接至已經附接至所述第二珠子群體的第一寡核苷酸，其中所述多個第二珠子群體中的每一個均包含不同的第二條形碼序列段；以及

合并所述多個第二珠子群體以提供包含條形碼文庫的第二合并的珠子群體。