[發(fā)明專利]一種細(xì)胞分層圖像處理方法及系統(tǒng)有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201910584542.0 | 申請日: | 2019-07-01 |
| 公開(公告)號: | CN110363719B | 公開(公告)日: | 2021-07-27 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 劉琴;張鍇;宋志兵 | 申請(專利權(quán))人: | 湖南開啟時代智能科技有限公司 |
| 主分類號: | G06T5/00 | 分類號: | G06T5/00;G06T5/30;G06T7/13;G06T7/136 |
| 代理公司: | 長沙國科天河知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 43225 | 代理人: | 邱軼 |
| 地址: | 410000 湖南省長沙市高新開發(fā)區(qū)*** | 國省代碼: | 湖南;43 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 一種 細(xì)胞 分層 圖像 處理 方法 系統(tǒng) | ||
1.一種細(xì)胞分層圖像處理方法,其特征在于,包括以下步驟:
從采集的細(xì)胞分層圖像中提取感興趣區(qū)域并去噪;
對去噪后圖像的局部信息增強(qiáng)以增大整個圖像對比度;
通過均值漂移算法對增強(qiáng)圖像進(jìn)行圖像平滑處理和圖像分割處理;
通過泛洪填充算法對分割的圖像進(jìn)行填充,獲得粗分界區(qū);
對填充后的圖像進(jìn)行灰度化處理并進(jìn)行邊緣檢測,獲得分割邊界;
將分割邊界所在區(qū)域填充完整并進(jìn)行閉運(yùn)算,獲得完整的邊界;
提取邊界輪廓并在所述輪廓內(nèi)繪制邊界線,獲得細(xì)胞分層圖像;
所述通過均值漂移算法對增強(qiáng)圖像進(jìn)行色彩平滑處理獲得不同色彩區(qū)域的步驟包括:
以增強(qiáng)圖像為原圖進(jìn)行降采樣構(gòu)建圖像金字塔;
從圖像金字塔頂層圖像開始,執(zhí)行均值漂移迭代計(jì)算;
將上層均值漂移迭代計(jì)算的結(jié)果作為下一層金字塔計(jì)算的初值和mask;
根據(jù)上一層得到的初值和mask,得到下一層金字塔圖像,將mask為1的所有像素進(jìn)行均值漂移迭代,把迭代結(jié)果獲得的質(zhì)心位置平均值存儲到mask為1的位置的對應(yīng)像素中;
重復(fù)前述相鄰兩個步驟,直到達(dá)到金字塔塔底,遍歷完成所有金字塔層的均值漂移色彩濾波,最終輸出和原圖一樣分辨率大小的結(jié)果圖;
所述從圖像金字塔頂層圖像開始,執(zhí)行均值漂移迭代計(jì)算的步驟包括:
從金字塔頂層圖像左上角第一個坐標(biāo)像素點(diǎn)開始,以該點(diǎn)為中心點(diǎn),其位置為(x0,y0)及顏色值為(b0,g0,r0),生成預(yù)定大小的二維方形窗口,并計(jì)算窗口中滿足顏色相近條件的所有點(diǎn)的平均位置,作為質(zhì)心(x1,y1),且顏色值為(b1,g1,r1);顏色相近條件采用下式距離計(jì)算:
Distance=(b0-bi)×(b0-bi)+(g0-gi)×(g0-gi)+(r0-ri)×(r0-ri)≤thresh
在上式中,(bi,gi,ri)為該方形窗口中每個像素的BGR值,thresh為閾值;
將窗口中心平移到(i)獲取的質(zhì)心位置(x1,y1),計(jì)算以該質(zhì)心為中心生成預(yù)定大小的新的二維方形窗口中滿足顏色相近條件的所有點(diǎn)的質(zhì)心平均位置及顏色平均值,以更新(x0,y0)和(b0,g0,r0);
重復(fù)迭代執(zhí)行前一更新步驟,直到新位置的質(zhì)心位置和顏色平均值與上一次的中心點(diǎn)的位置差值和顏色差值滿足迭代精度的條件,則將迭代結(jié)束獲取的質(zhì)心值的BGR值賦給對應(yīng)的中心點(diǎn)作為該點(diǎn)的新像素值;
所述提取邊界輪廓并在所述輪廓內(nèi)繪制邊界線,獲得細(xì)胞分層圖像的步驟包括:
提取所有完整的邊界輪廓;
獲取每個輪廓的最小外接矩形;
刪除高度小于或等于閾值的輪廓,保留高度大于閾值的輪廓形成有效邊緣輪廓;
根據(jù)最小外接矩形提取每個有效邊緣輪廓的中心線,獲得圖像分層的邊界線。
2.如權(quán)利要求1所述的細(xì)胞分層圖像處理方法,其特征在于,所述從采集的細(xì)胞分層圖像中提取感興趣區(qū)域并去噪的步驟包括:
提取細(xì)胞分層圖像中各分層覆蓋的區(qū)域作為感興趣區(qū)域;
以感興趣區(qū)域圖像作為提取矩陣通過雙邊濾波算法進(jìn)行去噪。
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