[發明專利]一種合成DNA編碼化合物中的反應監測方法

在審

• 申請號: 201910573027.2
• 申請日: 2019-06-27
• 公開（公告）號: CN110658163A
• 公開（公告）日: 2020-01-07
• 發明（設計）人: 李進;張帥;何竇;萬金橋;劉觀賽
• 申請（專利權）人: 成都先導藥物開發股份有限公司
• 主分類號: G01N21/64
• 分類號: G01N21/64
• 代理公司: 51222 成都高遠知識產權代理事務所(普通合伙)
• 代理人: 李高峽;張娟

1.一種合成DNA編碼化合物中的反應監測方法，其特征在于：它包括如下操作步驟：

(1)標準曲線的繪制：取末端有特定官能團的DNA編碼化合物，配制不同濃度的標準溶液；加入熒光試劑，測定熒光吸收值，繪制濃度-吸收標準曲線；

(2)進行反應監測：取末端轉化為特定官能團的DNA編碼化合物庫混合體系和/或末端有特定官能團的DNA編碼化合物庫進一步反應后的混合體系，加入熒光試劑；測定熒光吸收值，通過標準濃度-吸收曲線，計算反應轉化率。

2.根據權利要求1所述的監測方法，其特征在于：步驟(1)和步驟(2)所述DNA編碼化合物具有相同的骨架結構；

“骨架結構”是指DNA編碼化合物庫中各DNA編碼化合物小分子結構部分中結構一致的結構；

和/或，所述末端有特定官能團的DNA編碼化合物在特定波長下無熒光吸收或激發；所述末端轉化為特定官能團的DNA編碼化合物庫混合體系在特定波長下無熒光吸收或激發；

和/或，所述末端有特定官能團的DNA編碼化合物庫進一步反應后的混合體系在特定波長下無熒光吸收或激發；

和/或，所述的特定官能團可與相對應的熒光試劑反應，生成物在特定波長下具有熒光吸收或激發。

3.根據權利要求1所述的監測方法，其特征在于：步驟(1)和步驟(2)中所述的特定官能團為伯氨基、仲氨基、巰基、羧基、羥基、醛基、羰基、氰基；更進一步的，步驟(1)和步驟(2)中所述的特定官能團為伯氨基。

4.根據權利要求3所述的監測方法，其特征在于：步驟(1)和步驟(2)中所述的特定官能團為氨基，相對應的熒光試劑為4-苯基螺[呋喃-2(3H)，1-二氫異苯并呋喃]-3，3′-二酮、3-(2-呋喃甲酰基)-喹啉-2-羰醛、鄰苯二甲醛、2，3-萘二醛、(4-羧基苯甲酰基)-喹啉-2-羰醛、異硫氰酸酯、四甲基羅丹明異硫氰酸酯、苯異硫氰酸酯、丹磺酰氯、9-芴甲基氯甲酸酯、4-氟-7-硝基-2，1，3-苯并惡二唑、4-氯-7-硝基-2，1，3-苯并惡二唑、6-氨基喹啉-N-羥基琥珀酰亞胺甲酸酯；更進一步的，步驟(1)和步驟(2)中所述的特定官能團為伯氨基，相對應的熒光試劑為4-苯基螺[呋喃-2(3H)，1-二氫異苯并呋喃]-3，3′-二酮。

5.根據權利要求3所述的監測方法，其特征在于：步驟(1)和步驟(2)中所述的特定官能團為羧基，相對應的熒光試劑為1-(2-對甲苯磺酸酯)乙基-2-苯基咪唑(4，5)-9，10-菲、4-N-(4-氨基乙基)哌嗪-7-硝基-2，1，3-苯并惡二唑、9-氨基芘-1，4，6，三磺酸、8-氨基芘-1，3，6-三磺酸三鈉鹽。

6.根據權利要求3所述的監測方法，其特征在于：步驟(1)和步驟(2)中所述的特定官能團為羥基，相對應的熒光試劑為9-芴甲氧基羰酰氯、2-芴磺酰氯、丹磺酰氯、蒽-1-羰基腈、1-乙氧基-4-(二氯-S-三嗪)萘。

7.根據權利要求3所述的監測方法，其特征在于：步驟(1)和步驟(2)中所述的特定官能團為醛基、羰基，相對應的熒光試劑為丹磺酰肼、4-(N，N-二甲氨基磺酰)-7-肼基-2，1，3-苯并惡二唑、4-肼基-7-硝基-2，1，3-苯并惡二唑(NBD-H)、1，3-環己二酮。

8.根據權利要求3所述的監測方法，其特征在于：步驟(1)和步驟(2)中所述的特定官能團為巰基，相對應的熒光試劑為馬來酰亞胺類、碘乙酰胺類、氮丙啶類、鄰苯二醛類熒光試劑。

9.根據權利要求3所述的監測方法，其特征在于：步驟(1)和步驟(2)中所述的特定官能團為氰基，相對應的熒光試劑為硼酸基團類、水楊醛基類、二苯乙二酮類、吖啶橙類熒光試劑。

10.根據權利要求1所述的監測方法，其特征在于：步驟(2)中所述末端轉化為特定官能團的DNA編碼化合物庫混合體系為末端為疊氮基團的DNA編碼化合物庫混合體系。