[發明專利]一種水稻種子耐貯藏性基因OsGH3-2及其分子標記的應用

有效

• 申請號: 201910554967.7
• 申請日: 2019-06-25
• 公開（公告）號: CN110184281B
• 公開（公告）日: 2020-10-02
• 發明（設計）人: 余四斌;袁志陽;凡凱;田莉;熊銀
• 申請（專利權）人: 華中農業大學
• 主分類號: C12N15/29
• 分類號: C12N15/29;C07K14/415;C12N15/82;A01H5/10;A01H6/46;C12Q1/6895;C12N15/11
• 代理公司: 北京路浩知識產權代理有限公司 11002
• 代理人: 陳征

1.水稻種子耐貯藏性基因OsGH3-2、或其編碼的蛋白、或含有該基因的生物材料在提高水稻種子耐貯藏性能中的應用，

所述水稻種子耐貯藏性基因OsGH3-2的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示；

所述編碼的蛋白的氨基酸序列如SEQ ID No.2所示；

所述生物材料為載體、宿主細胞或表達盒。

2.水稻種子耐貯藏性基因OsGH3-2、或其編碼的蛋白、或含有該基因的生物材料在提高貯藏后水稻種子發芽率中的應用，所述水稻種子耐貯藏性基因OsGH3-2的核苷酸序列如SEQID No.1所示；

所述編碼的蛋白的氨基酸序列如SEQ ID No.2所示；

所述生物材料為載體、宿主細胞或表達盒。

3.水稻種子耐貯藏性基因OsGH3-2、或其編碼的蛋白、或含有該基因的生物材料在延長水稻種子種用時間中的應用，所述水稻種子耐貯藏性基因OsGH3-2的核苷酸序列如SEQ IDNo.1所示；

所述編碼的蛋白的氨基酸序列如SEQ ID No.2所示；

所述生物材料為載體、宿主細胞或表達盒。

4.水稻種子耐貯藏性基因OsGH3-2、或其編碼的蛋白、或含有該基因的生物材料在培育種子耐貯藏性強的轉基因水稻中的應用，所述水稻種子耐貯藏性基因OsGH3-2的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示；

所述編碼的蛋白的氨基酸序列如SEQ ID No.2所示；

所述生物材料為載體、宿主細胞或表達盒。

5.水稻種子耐貯藏性基因OsGH3-2的分子標記，其特征在于，所述分子標記如SEQ IDNo.3所示，在該序列的第155位發生A/G突變，導致水稻種子耐貯藏多態性。

6.一組用于檢測水稻種子耐貯藏能力的引物組合，其特征在于，含有3條引物，其核苷酸序列分別為：

上游引物1：CTTATTAATTTCTCCATCAGATGAGAA(SEQ ID NO.4)

上游引物2：CTTATTAATTTCTCCATCAGATGAGAG(SEQ ID NO.5)

通用引物：CGTCTCCGGATTAATCAACGGC(SEQ ID NO.6)。

7.權利要求5所述的分子標記或權利要求6所述的引物組合的以下任一應用：

(1)篩選耐貯藏能力強的水稻種子；

(2)淘汰耐貯藏能力弱的水稻種子；

(3)檢測水稻種子貯藏過程中，發芽率高的水稻種子或發芽率低的水稻種子；

(4)篩選種用時間長的水稻種子；

(5)培育耐貯藏能力強的水稻品種。

8.檢測水稻種子耐貯藏性強弱的方法，其特征在于，通過下述引物組合擴增待檢水稻基因組DNA，基于KASP反應體系平臺檢測PCR擴增產物：

所述引物組合的核苷酸序列為：

上游引物1：CTTATTAATTTCTCCATCAGATGAGAA(SEQ ID NO.4)

上游引物2：CTTATTAATTTCTCCATCAGATGAGAG(SEQ ID NO.5)

通用引物：CGTCTCCGGATTAATCAACGGC(SEQ ID NO.6)；

如果樣品PCR產物只檢測到上游引物1對應的熒光信號，則待檢測SNP位點為堿基A，含該等位基因材料種子耐貯藏性較差；若只檢測到上游引物2對應的熒光信號，則待檢測SNP位點為堿基G，含該等位基因材料種子耐貯藏性較強；若同時檢測到兩種熒光信號則檢測位點為A:G，則含有雜合的OsGH3-2基因。