[發(fā)明專利]一種基于深度學(xué)習(xí)的致癇灶三維自動定位系統(tǒng)有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201910549416.1 | 申請日: | 2019-06-24 |
| 公開(公告)號: | CN110390351B | 公開(公告)日: | 2020-07-24 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 卓成;張沁茗;張騰;廖懿;王夏婉;馮建華;張宏;田梅 | 申請(專利權(quán))人: | 浙江大學(xué) |
| 主分類號: | G06K9/62 | 分類號: | G06K9/62;G06N3/04;G16H30/40;A61B6/00;A61B6/03 |
| 代理公司: | 杭州求是專利事務(wù)所有限公司 33200 | 代理人: | 劉靜 |
| 地址: | 310058 浙江*** | 國省代碼: | 浙江;33 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 一種 基于 深度 學(xué)習(xí) 致癇灶 三維 自動 定位 系統(tǒng) | ||
1.一種基于深度學(xué)習(xí)的致癇灶三維自動定位系統(tǒng),其特征在于,該系統(tǒng)包括以下模塊:
(1)PET圖像采集和標記模塊,用于圖像采集和致癇灶區(qū)域標記:
1.1)采集圖像:受試者在PET掃描儀上使用3D腦部圖像采集,在相同體位狀態(tài)下獲取PET腦圖像;
1.2)標記樣本:將PET圖像分為正常樣本集和攜帶致癇灶的樣本集,并對攜帶致癇灶的樣本集手動標記致癇灶區(qū)域,其中,致癇灶區(qū)域標記為1,其余區(qū)域標記為0;
(2)PET圖像配準模塊:以互相關(guān)作為原始圖像與配準圖像的相似性度量,運用對稱微分同胚(SyN)算法將所有PET圖像及其標記圖像配準到同一對稱標準空間,實現(xiàn)PET采集圖像、標記圖像與標準對稱腦模版的配準;
(3)采用基于對稱性的深度學(xué)習(xí)系統(tǒng),包含以下模塊:
3.1)數(shù)據(jù)預(yù)處理模塊:
3.1.1)數(shù)據(jù)增強:對配準后的圖像和標簽進徑向畸變和圖像強度增強,得到新生成的圖像和標簽;
3.1.2)圖像塊劃分:對增強后的圖像數(shù)據(jù)進行圖像塊劃分,用三維滑動窗口將PET圖像的左右半腦L和R劃分為圖像塊的鏡像對,將圖像塊的鏡像對數(shù)據(jù)按比例分為訓(xùn)練集和測試集;所述訓(xùn)練集和測試集中均包含有攜帶致癇灶和正常兩種類型的PET圖像塊數(shù)據(jù);
3.2)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建模塊:構(gòu)建深度孿生網(wǎng)絡(luò)SiameseNet,該網(wǎng)絡(luò)包含兩個相同的卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)、一個全連接層以及一個輸出層;SiameseNet將一對圖像塊的鏡像對輸入每層共享權(quán)重參數(shù)θ的兩個卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),以獲取兩個高維圖像的特征L_feature和特征R_feature,計算兩個高維圖像特征的絕對差值d=|L_feature-R_feature|,并將其傳入到全連接層的多層感知機中進行概率回歸,輸出層采用softmax回歸函數(shù)的分類概率,即圖像塊攜帶致癇灶或正常的概率;
3.3)測試圖像檢測模塊:
圖像分類:利用訓(xùn)練好的網(wǎng)絡(luò)計算測試集PET圖像的概率熱圖,采用邏輯回歸算法對每一張PET圖像對應(yīng)的概率熱圖進行分類,獲得分類結(jié)果,即為正常PET圖像或攜帶致癇灶PET圖像;
致癇灶定位:對識別為攜帶致癇灶PET圖像的概率熱圖進行雙線性插值,將概率熱圖改變?yōu)樵紙D像尺寸,將大于概率閾值的區(qū)域預(yù)測為致癇灶區(qū)域。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種基于深度學(xué)習(xí)的致癇灶三維自動定位系統(tǒng),其特征在于,1.1)采集圖像過程中,將獲取的PET腦圖像進行格式轉(zhuǎn)換,即DICOM格式的原始采集圖像轉(zhuǎn)換成NIFTI格式圖像。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種基于深度學(xué)習(xí)的致癇灶三維自動定位系統(tǒng),其特征在于,(2)PET圖像配準模塊中,采用高斯平滑算法減少配準誤差,高斯平滑處理選擇高斯函數(shù)的半峰全寬FWHM為5~15mm,并對平滑后的圖像進行z-score標準化。
4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種基于深度學(xué)習(xí)的致癇灶三維自動定位系統(tǒng),其特征在于,3.1.1)數(shù)據(jù)增強過程中的徑向畸變具體為:徑向畸變是圖像像素點以畸變中心為中心點,沿著徑向的位置產(chǎn)生偏差,徑向畸變的計算過程為:
Pu=Pd+(Pd-Pc)(k1r2+k2r4+k3r6+…)
其中,Pu是原圖像的一個像素點,Pd是畸變后圖像的一個像素點,Pc是畸變中心,ki(i=1,2,3…)是徑向畸變的畸變系數(shù),r是Pd和Pc在矢量空間上的距離。
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G06K9-18 .應(yīng)用具有附加代碼標記或含有代碼標記的打印字符的,例如,由不同形狀的各個筆畫組成的,而且每個筆畫表示不同的代碼值的字符
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