[發(fā)明專利]一種基于機(jī)器學(xué)習(xí)的光學(xué)相干血管造影成像方法在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 201910513946.0 | 申請日: | 2019-06-14 |
| 公開(公告)號: | CN112085830A | 公開(公告)日: | 2020-12-15 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 劉曦;盧閆曄;任秋實;黃智宇 | 申請(專利權(quán))人: | 北京大學(xué) |
| 主分類號: | G06T17/00 | 分類號: | G06T17/00;G06T7/33;G06N3/04;G06N3/08 |
| 代理公司: | 北京萬象新悅知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11360 | 代理人: | 王巖 |
| 地址: | 100871*** | 國省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 一種 基于 機(jī)器 學(xué)習(xí) 光學(xué) 相干 血管 造影 成像 方法 | ||
1.一種基于機(jī)器學(xué)習(xí)的光學(xué)相干血管造影成像方法,其特征在于,所述光學(xué)相干血管造影成像方法包括以下步驟:
1)生成原始數(shù)據(jù)集:
利用OCTA設(shè)備采集得到的樣品的OCT三維結(jié)構(gòu)圖像,生成網(wǎng)絡(luò)模型訓(xùn)練所需的原始數(shù)據(jù)集,原始數(shù)據(jù)集包括j×k組OCT結(jié)構(gòu)圖像序列,每一組OCT結(jié)構(gòu)圖像序列包括i個二維橫截面(B-Scan)的OCT結(jié)構(gòu)圖像,其中,k為樣品的個數(shù),j為每個樣品的慢軸掃描位置的個數(shù),i為同一樣品的同一個慢軸掃描位置的掃描次數(shù),i為>4的自然數(shù),j為>50的自然數(shù),k>5的自然數(shù);
2)數(shù)據(jù)篩選:
采用剛性配準(zhǔn)算法對同一組OCT結(jié)構(gòu)圖像中的i個B-Scan面OCT結(jié)構(gòu)圖像進(jìn)行配準(zhǔn),配準(zhǔn)后利用相關(guān)性算法計算配準(zhǔn)準(zhǔn)確度,剔除配準(zhǔn)效果較差的整組OCT結(jié)構(gòu)圖像,保留n組篩選后的OCT結(jié)構(gòu)圖像,n為自然數(shù),且
3)生成訓(xùn)練數(shù)據(jù)集:
利用步驟2)得到的n組篩選后的OCT結(jié)構(gòu)圖像,采用OCTA算法進(jìn)行造影成像,每組OCT結(jié)構(gòu)圖像將得到一張B-Scan面的OCTA造影圖像,稱作標(biāo)簽圖像;從與每個標(biāo)簽圖像相對應(yīng)一組OCT結(jié)構(gòu)圖像的i個B-Scan面OCT結(jié)構(gòu)圖像中取出m個B-Scan面OCT結(jié)構(gòu)圖像,稱作輸入數(shù)據(jù),與標(biāo)簽圖像配對,輸入數(shù)據(jù)與標(biāo)簽圖像組成網(wǎng)絡(luò)模型訓(xùn)練所需的訓(xùn)練數(shù)據(jù)集,其中,m=2,3或4;
4)建立機(jī)器學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò)模型:
構(gòu)建機(jī)器學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò)模型,并設(shè)定機(jī)器學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò)模型的超參數(shù);并將訓(xùn)練數(shù)據(jù)集分成n1組訓(xùn)練集和n2組測試集,訓(xùn)練集與測試集互相獨立,n1和n2分別為自然數(shù),且n1+n2=n,
5)訓(xùn)練機(jī)器學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò)模型:
利用步驟4)建立的機(jī)器學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò)模型,以訓(xùn)練數(shù)據(jù)集中的輸入數(shù)據(jù)作為機(jī)器學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò)模型的輸入,其中以n1組訓(xùn)練集用于訓(xùn)練機(jī)器學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò)模型,并以n2組測試集用于檢驗機(jī)器學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò)模型的性能;訓(xùn)練過程中,訓(xùn)練集將分多個批次并重復(fù)輸入機(jī)器學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò)模型訓(xùn)練多輪,同時判斷或計算機(jī)器學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò)模型的輸出圖像與標(biāo)簽圖像之間的差異作為訓(xùn)練誤差以訓(xùn)練機(jī)器學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò)模型,每一批次的訓(xùn)練結(jié)束后,使用測試集對機(jī)器學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò)模型進(jìn)行性能測試,待機(jī)器學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò)模型的性能測試指標(biāo)訓(xùn)練趨于穩(wěn)定后時,則認(rèn)為機(jī)器學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò)模型的訓(xùn)練完成,保存訓(xùn)練完成的機(jī)器學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò)模型;
6)機(jī)器學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò)模型進(jìn)行OCTA造影:
利用訓(xùn)練完成的機(jī)器學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò)模型,將OCTA設(shè)備采集得到的樣品的OCT結(jié)構(gòu)圖像作為輸入,輸出圖像即為OCTA造影圖像。
2.如權(quán)利要求1所述的光學(xué)相干血管造影成像方法,其特征在于,在步驟1)中,OCTA設(shè)備對樣品進(jìn)行采集時,對一個樣品的一個掃描位置的一個慢軸掃描位置掃描一次得到一個B-Scan面的OCT結(jié)構(gòu)圖像,對同一個慢軸掃描位置掃描i次,每個樣品具有j個慢軸掃描位置,共有k個樣品,從而得到i×j×k個B-Scan面的OCT結(jié)構(gòu)圖像,將i×j×k個B-Scan面的OCT結(jié)構(gòu)圖像分成j×k組OCT結(jié)構(gòu)圖像,每一組OCT結(jié)構(gòu)圖像包括i個B-Scan面的OCT結(jié)構(gòu)圖像,即每一個慢軸掃描位置對應(yīng)一組OCT結(jié)構(gòu)圖像,從而得到原始數(shù)據(jù)集。
3.如權(quán)利要求1所述的光學(xué)相干血管造影成像方法,其特征在于,在步驟2)中,對于j×k組配準(zhǔn)后的OCT結(jié)構(gòu)圖像,進(jìn)比較配準(zhǔn)準(zhǔn)確度,配準(zhǔn)準(zhǔn)確度較高的前n組OCT結(jié)構(gòu)圖像保留,其余的認(rèn)為配準(zhǔn)效果較差,剔除這些組OCT結(jié)構(gòu)圖像。
4.如權(quán)利要求1所述的光學(xué)相干血管造影成像方法,其特征在于,在步驟4)中,機(jī)器學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò)模型采用深度卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)CNN、生成式對抗網(wǎng)絡(luò)GAN或者循環(huán)神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)RNN。
5.如權(quán)利要求1所述的光學(xué)相干血管造影成像方法,其特征在于,在步驟4)中,超參數(shù)包括網(wǎng)絡(luò)層數(shù)、卷積核、學(xué)習(xí)率、參數(shù)初始化、訓(xùn)練輪數(shù)和批次規(guī)模。
6.如權(quán)利要求1所述的光學(xué)相干血管造影成像方法,其特征在于,在步驟5)中,以輸出圖像與標(biāo)簽圖像之間的均方誤差、結(jié)構(gòu)相似度或峰值信噪比作為訓(xùn)練誤差,使用隨機(jī)梯度下降、自適應(yīng)矩估計優(yōu)化算法以及動量算法中的一種最小化訓(xùn)練誤差,以訓(xùn)練機(jī)器學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò)模型。
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