[發(fā)明專利]一種鑒定豬的肌纖維密度大小的方法及其所用引物對有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201910495260.3 | 申請日: | 2019-06-06 |
| 公開(公告)號: | CN110117667B | 公開(公告)日: | 2022-04-26 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 張龍超;王立賢;王立剛;劉欣 | 申請(專利權(quán))人: | 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京畜牧獸醫(yī)研究所 |
| 主分類號: | C12Q1/6888 | 分類號: | C12Q1/6888;C12N15/11 |
| 代理公司: | 北京紀(jì)凱知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11245 | 代理人: | 關(guān)暢 |
| 地址: | 100193 *** | 國省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 一種 鑒定 肌纖維 密度 大小 方法 及其 所用 引物 | ||
本發(fā)明公開一種鑒定豬的肌纖維密度大小的方法及其所用引物對。一種擴增含有SSC14 g.85531863C>T多態(tài)性位點的DNA片段的引物對;所述SSC14 g.85531863C>T多態(tài)性位點為豬參考基因組Sscrofa11.1的14號染色體上自5′末端起第85531863位核苷酸;所述豬參考基因組Sscrofa11.1為GenBank中更新日為2017年2月的豬參考基因組序列。本發(fā)明可對待選豬進行早期篩選,有效地緩解實際生產(chǎn)中的選取優(yōu)良種豬時間長的問題,降低了育種花費,有效降低或提高的豬肌纖維密度,該方法準(zhǔn)確度高,檢測費用低,并可實現(xiàn)自動化檢測,在豬的育種方面具有很高的實踐應(yīng)用價值。
技術(shù)領(lǐng)域
本發(fā)明屬于生物技術(shù)領(lǐng)域,具體涉及一種鑒定豬的肌纖維密度大小的方法及其所用引物對。
背景技術(shù)
豬肉質(zhì)品質(zhì)是豬的重要經(jīng)濟性狀,它與人們的肉食營養(yǎng)、肉食品加工和養(yǎng)豬業(yè)經(jīng)濟效益都密切相關(guān)。因此,豬肉質(zhì)品質(zhì)研究已成為肉食品加工和豬遺傳育種領(lǐng)域的一個重要組成部分,作為影響豬肉質(zhì)主要因素的肌纖維密度也愈來愈受到研究者和育種者們的關(guān)注,成為豬育種計劃的一部分。
然而,肌纖維密度只有屠宰后才能進行測定,育種工作困難。分子育種可以通過篩選與性狀關(guān)聯(lián)分子標(biāo)記進行育種工作,避免屠宰。因此,獲得一種能鑒定豬的肌纖維密度大小的分子標(biāo)記顯得非常重要。
發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明的目的是提供一種鑒定豬的肌纖維密度大小的方法及其所用引物對。
為達到以上目的,本發(fā)明提供了一種擴增含有SSC14g.85531863C>T多態(tài)性位點的DNA片段的引物對;
所述SSC14g.85531863C>T多態(tài)性位點為豬參考基因組Sscrofa11.1的14號染色體上自5′末端起第85531863位核苷酸;
所述豬參考基因組Sscrofa11.1為GenBank中更新日為2017年2月的豬參考基因組序列。
上述引物對由序列1所示的DNA分子和序列2所示的DNA分子組成。
一種鑒定或輔助鑒定豬的肌纖維密度大小的試劑盒,該試劑盒包含上述引物對。
所述試劑盒還包含使用說明書,說明書中記載內(nèi)容如下:
以待測豬的基因組DNA為模板,利用上述引物的進行PCR擴增,得到PCR產(chǎn)物,該PCR擴增產(chǎn)物含有豬參考基因組Sscrofa11.1的14號染色體上自5′末端起第85531863位核苷酸,如果該處核苷酸均為C,則所述豬的基因型為純合CC基因型,如果該處核苷酸為C和T,則所述豬的基因型為雜合CT基因型,如果該處核苷酸均為T,則所述豬的基因型為純合TT基因型;純合CC基因型與雜合CT基因型豬的肌纖維密度大于純合TT基因型豬的肌纖維密度,純合CC基因型與雜合CT基因型的豬的肌纖維密度差異不顯著。
上述試劑盒中,所述豬為北京黑豬。
一種鑒定或輔助鑒定豬的肌纖維密度大小的方法也屬于本發(fā)明的保護范圍,該方法為:純合CC基因型與雜合CT基因型的豬的肌纖維密度大于或候選大于純合TT基因型的豬的肌纖維密度,純合CC基因型與雜合CT基因型的豬的肌纖維密度差異不顯著;
所述純合CC基因型的豬為SSC14g.85531863C>T多態(tài)性位點均為C的豬;
所述雜合CT基因型的豬為SSC14g.85531863C>T多態(tài)性位點為C和T的豬;
所述純合TT基因型的豬為SSC14g.85531863C>T多態(tài)性位點均為T的豬;
所述SSC14g.85531863C>T多態(tài)性位點為豬參考基因組Sscrofa11.1的14號染色體上自5′末端起第85531863位核苷酸;
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