[發(fā)明專利]一種肺癌早期預(yù)警模型的創(chuàng)建方法在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 201910458857.0 | 申請日: | 2019-05-29 |
| 公開(公告)號: | CN110033864A | 公開(公告)日: | 2019-07-19 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 曹卓;葉再挺;潘炯偉 | 申請(專利權(quán))人: | 曹卓 |
| 主分類號: | G16H50/20 | 分類號: | G16H50/20;G16B40/20 |
| 代理公司: | 暫無信息 | 代理人: | 暫無信息 |
| 地址: | 323000 浙*** | 國省代碼: | 浙江;33 |
| 權(quán)利要求書: | 查看更多 | 說明書: | 查看更多 |
| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 肺癌 早期預(yù)警 外周血 代謝酶基因 創(chuàng)建 基因啟動子區(qū) 人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò) 基因多態(tài)性 甲基化水平 統(tǒng)計學(xué)分析 分子標志 全基因組 數(shù)據(jù)模型 研究對象 有效建立 指標組成 決策樹 危險度 端粒 基因 健康 | ||
1.一種肺癌早期預(yù)警模型的創(chuàng)建方法,采用C5.0決策樹和人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)進行數(shù)據(jù)模型的創(chuàng)建模型,通過SPSS Clementine軟件統(tǒng)計學(xué)分析處理,其特征在于,以500例1期肺癌患者和500例健康人為研究對象,采用以下步驟:
步驟一:對肺癌患者與健康人分別進行外周血Ⅰ相代謝酶基因CYP1A1、Ⅱ相代謝酶基因GSTM1、GSTTl和mEH及DNA修復(fù)酶基因XRCCl的基因多態(tài)性與DNA甲基化水平的檢測,并分別采用Fisher判別分析、決策樹和ANN方法聯(lián)合這些基因多態(tài)性建立肺癌分類模型,分別得到肺癌患者與健康人的外周血Ⅰ相代謝酶基因CYP1A1、Ⅱ相代謝酶基因GSTM1、GSTTl和mEH及DNA修復(fù)酶基因XRCCl的基因多態(tài)性與DNA甲基化水平對比模型,對比外周血Ⅰ相代謝酶基因CYP1A1、Ⅱ相代謝酶基因GSTM1、GSTTl和mEH及DNA修復(fù)酶基因XRCCl的基因多態(tài)性與DNA甲基化水平與肺癌的關(guān)系;
步驟二:對肺癌患者與健康人分別進行外周血pl6基因和RASSFIA基因啟動子區(qū)甲基化水平及外周血全基因組端粒長度的檢測,同時,分別采用Fisher判別分析、決策樹和ANN技術(shù)聯(lián)合上述端粒分子標志建立肺癌判別模型,分別得到肺癌患者與健康人的外周血pl6基因和RASSFIA基因啟動子區(qū)甲基化水平及外周血全基因組端粒長度對比模型,分析對比外周血pl6基因和RASSFIA基因啟動子區(qū)甲基化水平及外周血全基因組端粒長度的改變與肺癌的關(guān)聯(lián);
步驟三:應(yīng)用SPSS Clementine軟件統(tǒng)計分析軟件,采用x2檢驗、秩和檢驗、Logistic回歸分析等方法對基因多態(tài)、DNA甲基化水平和端粒相對長度的結(jié)果進行一般統(tǒng)計學(xué)分析處理,得出基因多態(tài)性、DNA甲基化及端粒相對長度變化與肺癌發(fā)生的關(guān)系,篩選可能用于肺癌早期判別模型的有效指標;
步驟四:分別將肺癌患者與健康人的得到肺癌患者與健康人的外周血Ⅰ相代謝酶基因CYP1A1、Ⅱ相代謝酶基因GSTM1、GSTTl和mEH及DNA修復(fù)酶基因XRCCl的基因多態(tài)性與DNA甲基化水平與外周血pl6基因和RASSFIA基因啟動子區(qū)甲基化水平及外周血全基因組端粒長度的整合對比作為構(gòu)建肺癌早期預(yù)警模型的生物標志,得到外周血Ⅰ相代謝酶基因CYP1A1、Ⅱ相代謝酶基因GSTM1、GSTTl和mEH及DNA修復(fù)酶基因XRCCl的基因多態(tài)性與DNA甲基化水平與外周血pl6基因和RASSFIA基因啟動子區(qū)甲基化水平及外周血全基因組端粒長度的共同變化與肺癌的關(guān)聯(lián);
步驟五:將所創(chuàng)建的模型進行盲法預(yù)測,驗證判別模型的優(yōu)劣,最終建立可靠的肺癌早期智能化預(yù)警模型。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種肺癌早期預(yù)警模型的創(chuàng)建方法,其特征在于,所述步驟四中,將肺癌患者與健康人中的抽煙人事進行篩選,將肺癌患者與健康人中的外周血Ⅰ相代謝酶基因CYP1A1、Ⅱ相代謝酶基因GSTM1、GSTTl和mEH及DNA修復(fù)酶基因XRCCl的基因多態(tài)性與DNA甲基化水平與外周血pl6基因和RASSFIA基因啟動子區(qū)甲基化水平及外周血全基因組端粒長度進行另外建立模型,對比肺癌患者與健康人中抽煙對肺癌的影響。
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