[發(fā)明專利]系統(tǒng)性硬化癥診斷的脂肪酸代謝物分析檢測方法在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 201910429110.2 | 申請日: | 2019-05-22 |
| 公開(公告)號: | CN110221011A | 公開(公告)日: | 2019-09-10 |
| 發(fā)明(設計)人: | 王丹丹;孫凌云;馮學兵;張華勇;孫宸 | 申請(專利權)人: | 南京鼓樓醫(yī)院 |
| 主分類號: | G01N30/88 | 分類號: | G01N30/88;G01N30/86 |
| 代理公司: | 南京鐘山專利代理有限公司 32252 | 代理人: | 蔣廈 |
| 地址: | 210008 江*** | 國省代碼: | 江蘇;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 系統(tǒng)性硬化癥 脂肪酸代謝 超高效液相色譜 分析檢測 診斷 氨水 樣品預處理 檢測分析 連續(xù)分析 評價系統(tǒng) 色譜條件 實驗數(shù)據(jù) 梯度洗脫 樣本隊列 質譜分析 靈敏度 進樣量 流動相 乙酸銨 質譜儀 分辨率 乙腈 質控 柱溫 樣本 監(jiān)測 分析 | ||
1.一種系統(tǒng)性硬化癥診斷的脂肪酸代謝物分析檢測方法,其特征在于:樣品預處理后,采用超高效液相色譜UHPLC進行分離,色譜條件為:柱溫25℃;流速0.3mL/min;進樣量2μL;流動相組成A:水+25mM乙酸銨+25mM氨水,B:乙腈;梯度洗脫程序如下:0-1min,95%B;1-14min,B從95%線性變化至65%;14-16min,B從65%線性變化至40%;16-18min,B維持在40%;18-18.1min,B從40%線性變化至95%;18.1-23min,B維持在95%;自動進樣器4℃;為避免儀器檢測信號波動而造成的影響,采用隨機順序進行樣本的連續(xù)分析,樣本隊列中插入質控QC樣品,用于監(jiān)測和評價系統(tǒng)的穩(wěn)定性及實驗數(shù)據(jù)的可靠性;樣品經超高效液相色譜UHPLC分離后用質譜儀Q-TOF進行質譜分析,Q-TOF質譜條件為:分別采用電噴霧電離ESI正離子和負離子模式進行檢測。
2.根據(jù)權利要求1所述的系統(tǒng)性硬化癥診斷的脂肪酸代謝物分析檢測方法,其特征在于:樣品預處理步驟為:-80℃取樣本,在4℃環(huán)境下緩慢解凍后,分別取各組樣本100ul后加入400ul預冷甲醇/乙腈溶液渦旋混合,其中甲醇:乙腈=1:1(v/v),-20℃靜置60min,14000g4℃離心20min,取上清真空干燥。
3.根據(jù)權利要求1所述的系統(tǒng)性硬化癥診斷的脂肪酸代謝物分析檢測方法,其特征在于:所述的色譜柱為Agilent 1290 Infinity LC超高效液相色譜系統(tǒng)HILIC色譜柱;質譜儀為Triple TOF 5600質譜儀。
4.根據(jù)權利要求1所述的系統(tǒng)性硬化癥診斷的脂肪酸代謝物分析檢測方法,其特征在于:質譜分析時,樣品加入100μL乙腈水溶液復溶,其中乙腈:水=1:1(v/v),渦旋,14000g4℃離心15min,取上清液進樣分析。
5.根據(jù)權利要求1所述的系統(tǒng)性硬化癥診斷的脂肪酸代謝物分析檢測方法,其特征在于:每個待測樣本等量混合用于制備質控QC樣本,用于測定進樣前儀器狀態(tài)及平衡色譜-質譜系統(tǒng),并用于評價整個實驗過程中系統(tǒng)穩(wěn)定性,剩余待測樣進行色譜-質譜檢測。
6.根據(jù)權利要求1所述的系統(tǒng)性硬化癥診斷的脂肪酸代謝物分析檢測方法,其特征在于:原始數(shù)據(jù)經ProteoWizard轉換成.mzXML格式,然后采用XCMS程序進行峰對齊、保留時間校正和提取峰面積,代謝物結構鑒定采用精確質量數(shù)匹配<25ppm和二級譜圖匹配的方式,檢索實驗室自建數(shù)據(jù)庫,對XCMS提取得到的數(shù)據(jù),刪除組別總和>2/3的離子峰。
7.根據(jù)權利要求6所述的系統(tǒng)性硬化癥診斷的脂肪酸代謝物分析檢測方法,其特征在于:應用軟件SIMCA-P14.1,Umetrics,Umea,Sweden,進行模式識別,數(shù)據(jù)經Pareto-scaling預處理后,進行多維統(tǒng)計分析。
8.根據(jù)權利要求7所述的系統(tǒng)性硬化癥診斷的脂肪酸代謝物分析檢測方法,其特征在于:所述多維統(tǒng)計分析包括無監(jiān)督主成分分析PCA,有監(jiān)督偏最小二乘法判別分析PLS-DA和正交偏最小二乘法判別分析OPLS-DA,單維統(tǒng)計分析包括Student’s t-test和變異倍數(shù)分析,R軟件繪制火山圖;以VIP>1為篩選標準,初步篩選出各組間的差異物。
9.根據(jù)權利要求8所述的系統(tǒng)性硬化癥診斷的脂肪酸代謝物分析檢測方法,其特征在于:采用單變量統(tǒng)計分析,驗證差異代謝物是否具有顯著性,選擇同時具有多維統(tǒng)計分析VIP>1和單變量統(tǒng)計分析P value<0.05的代謝物,作為具有顯著性差異的代謝物;而VIP>1且0.05<P value<0.1則作為差異代謝物。
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