[發(fā)明專利]HE染色器官病理圖像分割方法、裝置在審
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 201910394095.2 | 申請(qǐng)日: | 2019-05-13 |
| 公開(公告)號(hào): | CN110223303A | 公開(公告)日: | 2019-09-10 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 江瑞;李冉 | 申請(qǐng)(專利權(quán))人: | 清華大學(xué) |
| 主分類號(hào): | G06T7/11 | 分類號(hào): | G06T7/11;G06T7/136 |
| 代理公司: | 北京鴻元知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11327 | 代理人: | 董永輝;李玉琦 |
| 地址: | 100084 北京市海淀區(qū)1*** | 國省代碼: | 北京;11 |
| 權(quán)利要求書: | 查看更多 | 說明書: | 查看更多 |
| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 器官組織 圖像分塊 像素 后續(xù)分析 器官病理 圖像分割 掩膜 預(yù)設(shè) 飽和度 空間復(fù)雜度 時(shí)間復(fù)雜度 背景分離 病理圖像 肺部組織 分割結(jié)果 色調(diào) 分割 轉(zhuǎn)換 覆蓋 記錄 檢查 | ||
1.一種HE染色器官病理圖像分割方法,其特征在于,包括:
步驟S1,獲取包含器官組織的RGB圖像,將所述RGB圖像分割為多個(gè)RGB圖像分塊,并記錄每個(gè)RGB圖像分塊的位置;
步驟S2,將每個(gè)RGB圖像分塊轉(zhuǎn)換為HSV圖像分塊;
步驟S3,檢查每個(gè)HSV圖像分塊的每個(gè)像素的色調(diào)值和飽和度值是否在預(yù)設(shè)的區(qū)間范圍內(nèi),若是則判斷該像素屬于器官組織,當(dāng)HSV圖像分塊中的像素屬于器官組織的比例達(dá)到預(yù)設(shè)的比例閾值,則認(rèn)為該HSV圖像分塊是器官組織;
步驟S4,將所有判斷是器官組織的HSV圖像分塊組合成掩膜,
步驟S6,對(duì)于所有是器官組織的HSV圖像分塊所在的位置,賦值為非0,其他位置賦值為0,將掩膜覆蓋在所述RGB圖像上,獲得分割結(jié)果。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的HE染色器官病理圖像分割方法,其特征在于:
步驟S2中,利用以下公式將RGB圖像分塊轉(zhuǎn)換為HSV圖像分塊:
對(duì)每個(gè)像素點(diǎn)x=(r,g,b),計(jì)算
r'=r/255,g'=g/255,b'=b/255
cmax=max(r',g',b'),cmin=min(r',g',b'),d=cmax-cmin
轉(zhuǎn)換后的x*=(h,s,v)應(yīng)滿足:
其中,r、g、b代表RGB顏色分量的坐標(biāo),r表示紅色,g表示綠色,b表示藍(lán)色;
H表示色調(diào),s表示飽和度,v表示明度;
cmax是r',g',b'中最大值;
cmin r',g',b'中最小值;
d是cmax與cmin的差值;
r'、g'、b'是對(duì)r、g、b歸一化,r'、g'、b'的值是在0到1之間的實(shí)數(shù)。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的HE染色器官病理圖像分割方法,其特征在于:
所述預(yù)設(shè)的區(qū)間范圍包括色調(diào)值的區(qū)間[10,80],飽和度值的區(qū)間≥30。
4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的HE染色器官病理圖像分割方法,其特征在于:
根據(jù)全掃描所述RGB圖像的分辨率,設(shè)置RGB圖像分塊的尺寸。
5.根據(jù)權(quán)利要求1所述的HE染色器官病理圖像分割方法,其特征在于:
RGB圖像分塊的尺寸不大于320*320像素。
6.根據(jù)權(quán)利要求5所述的HE染色器官病理圖像分割方法,其特征在于:
檢查每個(gè)HSV圖像分塊的每個(gè)像素的色調(diào)值和飽和度值是否在預(yù)設(shè)的區(qū)間范圍內(nèi)之前,先利用雙線性插值將每個(gè)HSV圖像分塊壓縮到不大于32*32像素。
7.根據(jù)權(quán)利要求1所述的HE染色器官病理圖像分割方法,其特征在于:
所述比例閾值為0.1。
8.根據(jù)權(quán)利要求5所述的HE染色器官病理圖像分割方法,其特征在于:
還包括步驟S5,對(duì)組合成的掩膜進(jìn)行中值濾波,形成最終的掩膜。
9.一種HE染色器官病理圖像分割裝置,其特征在于,包括:
RGB圖像分塊模塊,用于獲取包含器官組織的RGB圖像,根據(jù)所述RGB圖像的分辨率,將所述RGB圖像分割為多個(gè)RGB圖像分塊,并記錄每個(gè)RGB圖像分塊的位置;
圖像分塊轉(zhuǎn)換模塊,用于將每個(gè)RGB圖像分塊轉(zhuǎn)換為HSV圖像分塊;
判定模塊,用于檢查每個(gè)HSV圖像分塊的每個(gè)像素的色調(diào)值和飽和度值是否在預(yù)設(shè)的區(qū)間范圍內(nèi),若是則判斷該像素屬于器官組織,當(dāng)HSV圖像分塊中的像素屬于器官組織的比例達(dá)到預(yù)設(shè)的比例閾值,則認(rèn)為該HSV圖像分塊是器官組織;
掩膜合成模塊,用于將所有判斷是器官組織的HSV圖像分塊組合成掩膜,對(duì)于所有是器官組織的HSV圖像分塊所在的位置,賦值為非0,其他位置賦值為0,將掩膜覆蓋在所述RGB圖像上,獲得分割結(jié)果。
10.根據(jù)權(quán)利要求9所述的HE染色器官病理圖像分割裝置,其特征在于,
還設(shè)置有圖像壓縮模塊,用于在檢查每個(gè)HSV圖像分塊的每個(gè)像素的色調(diào)值和飽和度值是否在預(yù)設(shè)的區(qū)間范圍內(nèi)之前,先利用雙線性插值將每個(gè)HSV圖像分塊壓縮到不大于32*32像素。
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