[發明專利]一種茶葉紫芽緊密連鎖的InDel分子標記及其應用

有效

• 申請號: 201910384767.1
• 申請日: 2019-05-09
• 公開（公告）號: CN110106275B
• 公開（公告）日: 2023-05-09
• 發明（設計）人: 韋康;龐丹丹;成浩;王麗鴛;阮麗;張亞真
• 申請（專利權）人: 中國農業科學院茶葉研究所
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12N15/11
• 代理公司: 杭州浙科專利事務所(普通合伙) 33213
• 代理人: 沈淵琪

一種茶葉紫芽緊密連鎖的InDel分子標記及其應用，屬于分子生物學技術領域。本發明公開了一段與紫芽性狀緊密相關的插入片段，并提供了鑒定茶樹紫芽性狀的功能標記，解決了目前紫芽基因精確定位和遺傳機理研究在國內外幾乎空白這一現狀，將本發明中的InDel標記應用于分子標記輔助選擇，能快速篩選出紫娟后代中具有紫芽性狀的茶樹材料，提高紫芽茶樹品種的選育效率，為茶樹新品種的選育奠定基礎。

技術領域

本發明屬于分子生物學技術領域，具體涉及一種茶葉紫芽緊密連鎖的InDel分子標記及其應用。

背景技術

富含花青素的紫娟茶是我國培育的重要紫芽茶樹品種。與普通綠芽茶葉相比，紫芽茶有助于人類抗氧化消除自由基，預防心腦血管疾病及癌癥，降低神經退行性疾病的患病風險等。因此研究和開發利用紫芽茶受到人們的密切關注。

近年來，茶葉科學家對于紫芽茶的成色機理開展了大量研究。目前基于遺傳群體的QTL定位已發現CsMYB75位置附近的序列差異可以解釋28.1-40.8%的紫芽性狀遺傳變異。但是有關該位點具體的序列變異是什么目前尚不明確，也未開展相關分子標記的研究。因此，確定影響茶葉紫芽的關鍵序列變異并開發對應的分子標記，可以為紫芽茶的分子標記輔助選擇育種奠定應用基礎。

發明內容

針對現有技術存在的問題，本發明的目的在于設計提供一種茶葉紫芽緊密連鎖的InDel分子標記及其應用的技術方案。

?所述的茶葉紫芽緊密連鎖的InDel分子標記作為紫芽茶篩選標記的應用，所述InDel分子標記為具有長度為182bp的1處特異插入/缺失片段，其序列如SEQ?ID?NO.1所示。

?所述的可識別茶葉紫芽緊密連鎖的InDel分子標記的引物組在紫芽茶篩選中的應用，所述茶葉紫芽緊密連鎖的InDel分子標記序列如SEQ?ID?NO.1所示。

?所述的應用，其特征在于所述引物組包括紫芽F1和紫芽R1，所述紫芽F1的序列如SEQ?ID?NO.3所示，所述紫芽R1的序列如SEQ?ID?NO.4所示。

?所述的一種茶樹紫芽性狀篩選的方法，其特征在于檢測茶樹第8連鎖群上茶葉紫芽緊密連鎖的InDel分子標記的插入/缺失情況，根據茶葉紫芽緊密連鎖的InDel分子標記的插入/缺失情況確定茶樹紫芽性狀，所述茶葉紫芽緊密連鎖的InDel分子標記序列如SEQID?NO.1所示。

?所述的方法，其特征在于采用可識別茶葉紫芽緊密連鎖的InDel分子標記的引物組對茶樹基因組DNA進行PCR擴增，所述引物組包括紫芽F1和紫芽R1，所述紫芽F1的序列如SEQ?ID?NO.3所示，所述紫芽R1的序列如SEQ?ID?NO.4所示。

所述的方法，其特征在于若擴增得到1kb左右的擴增產物，則該植株具有能誘發紫芽的關鍵序列，如果沒有擴增產物，則該植株不具備誘發紫芽的關鍵序列。

?所述的一種培育紫芽茶樹的方法，其特征在于包括在茶樹第8連鎖群上引入茶葉紫芽緊密連鎖的InDel分子標記插入/缺失，所述茶葉紫芽緊密連鎖的InDel分子標記序列如SEQ?ID?NO.1所示。

本發明將控制茶葉紫芽的1個關鍵基因CsMYB75定位于茶樹的第8連鎖群上的較小關聯區域內，并提供了與紫芽關鍵基因CsMYB75緊密連鎖的分子標記InDel紫芽，可直接用于紫芽關鍵基因CsMYB75分子標記輔助育種體系的建立。本發明的分子標記及分子標記擴增引物可以簡便、快速、高通量地應用于紫芽茶選育實踐中，同時為紫芽關鍵基因CsMYB75的功能研究奠定了良好的基礎。

序列表

110?中國農業科學院茶葉研究所

120?一種茶葉紫芽緊密連鎖的InDel分子標記及其應用

160?4

170?SIPOSequenceListing?1.0

210?1

211?182