[發明專利]一種與辣椒辣味性狀相關的InDel標記及其應用

有效

• 申請號: 201910336087.2
• 申請日: 2019-04-24
• 公開（公告）號: CN110373487B
• 公開（公告）日: 2022-07-29
• 發明（設計）人: 朱張生;雷建軍;孫彬妹;陳國菊;陳長明;曹必好
• 申請（專利權）人: 華南農業大學
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12N15/11
• 代理公司: 廣州粵高專利商標代理有限公司 44102
• 代理人: 林麗明

本發明公開了一種與辣椒辣味性狀相關的InDel標記及其應用，公開了與辣椒果實辣味性狀相關的插入/缺失片段，其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，所述片段序列位于調控辣椒素生物合成關鍵MYB轉錄因子Cap1基因上游；同時基于此，開發了一種InDel分子標記，通過檢測Cap1基因上游SEQ ID NO:1序列存在與否，可以對辣椒素類物質含量高低進行良好的分型。本發明對于辣椒辣味的遺傳改良，提高育種效率，節約育種成本具有非常重要的指導意義。

技術領域

本發明涉及辣椒育種技術領域，更具體地，涉及一種與辣椒辣味性狀相關的InDel標記及其應用。

背景技術

辣椒素和二氫辣椒素，及其類似物統稱為辣椒素類物質是辣椒屬植物特有的一類次生代謝產物，是辣椒果實品質重要的組成部分，決定果實的辣味。辣椒素類物質在食品、醫藥（止痛、抗癌、減肥、降血壓、殺菌和健腸胃等）、軍事（作催淚彈和防衛武器的原料）、化工等領域具有廣泛用途。目前，世界上對辣椒素的市場需求量每年約7萬噸左右，年需求總值高達175億元，而世界總生產能力每年不足0.5萬噸，需求缺口高達80%以上。辣椒素類物質需要從辣椒果實中提取，生產提取過程中90%以上的成本為原料成本，因此，應用辣椒素含量高，抗病豐產的品種就成為辣椒素類物質提取的技術關鍵。在目前常見的5個辣椒栽培種中C. chinense辣椒素類物質含量顯著高于其他4個種（C. annuum、C. baccatum、C. frutescens、C. pubescens）。然而，C. chinense種普遍存在生育周期長、座果率低、環境適應能力弱等特點。C. annuum種座果率高、品種豐富、環境適應能力強，栽培面積廣（辣椒栽培面積的85%為該種），但該種辣椒素含量低，因此對該種采用種內雜交策略以提高后代辣椒素含量能力非常有限。C. chinense和C. annuum親緣關系很近，通過常規雜交育種方法將控制的C. chinense材料高辣椒素含量的遺傳位點轉移到C. annuum材料獲得高辣、高產、優質、適應性強的種質資源，是選育適合辣椒素加工和提取新品種的重要前提。然而傳統選育方法存在表型鑒定不穩定、耗時、費力、花費高昂等缺點。

而且傳統檢測辣椒素類物質的方法主要是先提取辣椒中的辣椒素物質，再采用液相色譜、質譜等方法進行測定，不僅費時費力，且成本高，效率低。而利用目標性狀共分離的分子標記進行分子輔助育種具有高效、快速、穩定等優點，可以在苗期對目標性狀進行提前鑒定，因此可以在一定程度上克服傳統常規育種周期長，占地大，花費多等諸多限制。插入/缺失多態性（insertion/deletion，InDel）是由于等位基因位點處的DNA序列在不同個體間發生了核苷酸片段的插入/缺失而產生的長度多態性變異。在整個基因組中，InDel標記的多態性頻率僅次于SNP標記，遠高于SSR標記。InDel標記多態性可通過聚合酶鏈式反應（PCR）和瓊脂糖凝膠電泳或非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳等簡單的步驟達到基因分型的目的。專利CN201811285982.8公開了一種辣椒雜交種純度的InDel標記，專利CN201810360454.8與CN201810499212.7均公開了一個用于區分五個辣椒栽培種的InDel標記；然而目前還未見有用于區分辣椒素類物質含量高低的分子標記的相關報道。

發明內容

本發明的目的在于克服現有技術中的上述不足，提供一種與辣椒辣味性狀相關的InDel標記。

本發明的另一目的在于提供檢測所述InDel標記的引物。

本發明的再一目的在于提供一種篩選辣椒素含量高低性狀的方法。

本發明的上述目的是通過以下技術方案給予實現的：