[發明專利]一種個體化葉酸補充劑量的基因檢測方法

在審

• 申請號: 201910332332.2
• 申請日: 2019-04-17
• 公開（公告）號: CN110241195A
• 公開（公告）日: 2019-09-17
• 發明（設計）人: 魏曉星;吳穹;李長興;王越
• 申請（專利權）人: 青海大學
• 主分類號: C12Q1/6883
• 分類號: C12Q1/6883;C12N15/11
• 代理公司: 暫無信息
• 代理人: 暫無信息

本發明提供了一種用于個體化葉酸補充劑量的基因檢測方法，通過設計用于擴增rs1801133、rs1801131、rs1805087以及rs1801394位點的引物，對個體中與葉酸代謝緊密相關的4個SNP位點進行擴增，進一步分析個體擴增片段的基因型，根據個體基因型的差異給出葉酸需求量的建議。本方法操作簡便，應用性強，適合推廣使用。

技術領域

本發明涉及基因檢測領域，特別涉及一種與葉酸吸收、代謝、后期反應相關基因的基因型別數據庫，葉酸相關基因的基因分型方法，以及判斷葉酸缺乏及過量的檢測方法。

背景技術

B族維生素，全是水溶性維生素，在體內滯留的時間只有數小時，必須每天補充。雖然《中國居民膳食指南2016》(以下簡稱“指南”)給出了每種B族維生素相對于中國人群的推薦補充劑量，但是每個人對于B族維生素的實際需求是不同的，簡單地按照《指南》推薦的劑量補充并不是個體的最優化方案。

造成B族維生素需求個體差異的因素有許多，包括性別、年齡、體重等多個方面，其中最主要的是遺傳因素，包括B族維生素的代謝、轉運以及作用相關基因的遺傳多態性。研究表明，特定的基因位點多態性會影響維生素的吸收、代謝及轉化效率，使B族維生素在不同個體中的需求會偏離《指南》中的推薦量。其中，與維生素B1需求量相關的基因為SLC35F3，相應SNP位點為rs17514104；與維生素B2需求量相關的基因為MTHFR，相應SNP位點為rs1801133和rs1801131；與維生素B3需求量相關的基因為LPL、SIRT1和HERC4，相應SNP位點分別為rs285、rs1467568和rs497849；與葉酸(維生素B9)需求量相關的基因為MTHFR、MTR和MTRR，相應SNP位點為rs1801133、rs1801131、rs1805087和rs1801394；與維生素B12需求量相關的基因為CLYBL、FUT6、MS4A3和FUT2，相應SNP位點分別為rs41281112、rs3760776、rs2298585和rs602662。其詳細的對應關系和原理如下：

SLC35F3編碼硫胺素轉運蛋白，rs17514104位于SLC35F3基因內部，其變異位點與SLC35F3的硫胺素(維生素B1)轉運活性顯著相關。

與維生素B2相關的基因為MTHFR，其編碼產物亞甲基四氫葉酸還原酶(MTHFR)是一個依賴維生素B2作為輔因子的還原酶。SNP位點rs1801133和rs1801131位于MTHFR基因內部，導致MTHFR基因型不同；進而導致其與維生素B2的親和力不同，進一步活性差異很大，最終導致對體內同型半胱氨酸的清除效率高低不同。對這些異常人群，適當補充維生素B2可提高MTHFR的催化活性，消除基因型導致的酶活降低，同時降低相關疾病如神經管畸形等發生的風險。

與維生素B3相關的基因有三個，分別為LPL、SIRT1和HERC4。LPL編碼脂蛋白脂肪酶，是血脂代謝過程的關鍵酶，能夠調節血液中甘油三酯的含量。rs285(C變T)是LPL基因上風險位點，導致LPL活性降低。聯合相關分析表明，該攜帶風險位點(TT)的人群維生素B3攝入不足時，患代謝綜合征的概率升高。SIRT1基因產物與DNA抗氧化相關，其位點rs1467568G位點攜帶者易患糖尿病，每天服用19.8mg VB3降低該風險至正常。HERC4基因毗鄰SIRT1基因，與其共享rs497849位點。