[發(fā)明專利]一種三維可折疊芯片鄰近雜交-電化學(xué)發(fā)光基因檢測方法有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201910326207.0 | 申請日: | 2019-04-23 |
| 公開(公告)號: | CN110042149B | 公開(公告)日: | 2022-12-13 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 章春筍;蘇妍 | 申請(專利權(quán))人: | 華南師范大學(xué) |
| 主分類號: | C12Q1/6837 | 分類號: | C12Q1/6837 |
| 代理公司: | 廣州市華學(xué)知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 44245 | 代理人: | 郭煒綿 |
| 地址: | 510631 廣東*** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 一種 三維 可折疊 芯片 鄰近 雜交 電化學(xué) 發(fā)光 基因 檢測 方法 | ||
1.一種基于三維可折疊芯片的非疾病診斷或治療目的的基因檢測方法,其特征在于包括以下步驟:
(1)設(shè)計(jì)探針和輔助DNA序列
針對要檢測的腫瘤特征基因,選取其特征片段作為靶DNA,即T-DNA;
設(shè)計(jì)捕獲發(fā)夾探針DNA,即HP-DNA,以及兩條輔助DNA,即H-DNA1和H-DNA2的序列;
上述4條DNA序列需滿足以下條件:
H-DNA1的5’端與T-DNA的3’端互補(bǔ);
H-DNA1的3’端與HP-DNA的5’端互補(bǔ);
H-DNA1的中間序列與H-DNA2的中間序列互補(bǔ);
H-DNA2的5’端與HP-DNA的3’端互補(bǔ);
H-DNA2的3’端與T-DNA的5’端互補(bǔ);
所述的HP-DNA,其3’端連接氨基;
(2)形成PH復(fù)合物
將H-DNA1、H-DNA2和待測樣品加入緩沖液中,孵育反應(yīng)數(shù)分鐘,若待測樣品含有T-DNA的話,就會形成PH復(fù)合物;
(3)芯片折疊前傳感界面制備和上樣
將多壁碳納米管-殼聚糖(MWCNTs-CS)溶液滴加在可折疊三維芯片的工作電極表面,室溫下放置數(shù)分鐘;
將戊二醛溶液滴加在可折疊三維芯片的工作電極上,室溫下反應(yīng)后用去離子水沖洗;接著將HP-DNA滴加到已修飾GA的工作電極表面上,在恒溫恒濕條件下反應(yīng)數(shù)分鐘,然后采用Tris–HCl緩沖液沖洗、室溫下晾干;最后,牛血清蛋白封閉緩沖液滴加到已修飾HP-DNA工作電極表面上,在室溫下孵育后用PBS緩沖液沖洗,從而制得芯片傳感界面;
將等體積的PH復(fù)合物溶液與三聯(lián)吡啶釕溶液均勻混合后滴加到上述制得的傳感界面上,在恒溫且恒濕下孵育,接著用沖洗緩沖液沖洗,室溫下干燥;
(4)芯片折疊后樣品檢測
沿著折疊線將可折疊三維芯片折疊,使樣品池與輔助池重疊構(gòu)成可進(jìn)行PH-ECL檢測的三電極結(jié)構(gòu);然后,在輔助池滴加三丙胺溶液,待樣品池中工作電極浸透后將芯片放入暗箱中;最后,啟動CCD自動成像功能,并緊接著啟動恒電位儀,若待測樣品中含有要檢測的腫瘤特征基因,則會觸發(fā)PH-ECL反應(yīng)。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基因檢測方法,其特征在于:步驟(1)所述H-DNA1與H-DNA2的互補(bǔ)堿基對數(shù)為8bp。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基因檢測方法,其特征在于:步驟(1)所述的腫瘤特征基因包括K-ras基因和p53基因。
4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基因檢測方法,其特征在于:步驟(3)所述的可折疊三維芯片為布襯底。
5.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基因檢測方法,其特征在于:步驟(3)中,所述多壁碳納米管-殼聚糖溶液中多壁碳納米管(MWCNTs)的濃度為5g/L。
6.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基因檢測方法,其特征在于:步驟(3)中,所述HP-DNA的濃度為0.5μM。
7.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基因檢測方法,其特征在于:步驟(3)中,所述三聯(lián)吡啶釕溶液的濃度為1mM。
8.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基因檢測方法,其特征在于:步驟(3)中,所述的孵育,其時間為40min。
9.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基因檢測方法,其特征在于:步驟(4)中,所述三丙胺溶液的濃度為20mM。
10.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基因檢測方法,其特征在于:步驟(4)中,CCD實(shí)時采集的發(fā)光視頻保存成WMA格式;使用VGIF軟件將視頻變成JPG圖片格式;然后,使用nEO iMAGING4.4.1截取工作電極發(fā)光區(qū)域;最后通過Matlab R2012a測量圖片平均灰度值并使用Origin7.0軟件對成像數(shù)據(jù)作分析處理。
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