[發(fā)明專利]鯉浮腫病毒和錦鯉皰疹病毒雙重實時熒光定量檢測方法有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201910275066.4 | 申請日: | 2019-04-08 |
| 公開(公告)號: | CN109897918B | 公開(公告)日: | 2022-06-07 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 張文;徐立蒲;呂曉楠 | 申請(專利權(quán))人: | 北京市水產(chǎn)技術(shù)推廣站 |
| 主分類號: | C12Q1/70 | 分類號: | C12Q1/70;C12Q1/686;C12N15/11 |
| 代理公司: | 天津合正知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 12229 | 代理人: | 呂琦 |
| 地址: | 102600 北京市大興*** | 國省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 浮腫 病毒 錦鯉 皰疹病毒 雙重 實時 熒光 定量 檢測 方法 | ||
1.一種鯉浮腫病毒和錦鯉皰疹病毒雙重實時熒光定量PCR檢測方法,所述檢測方法為非疾病診斷方法,其特征在于,包括以下步驟:
第一、合成引物與TaqMan探針:
根據(jù)CEV P4a基因序列,對現(xiàn)有引物序列進(jìn)行優(yōu)化,上游引物第1個堿基改為簡并堿基W,下游引物第1個堿基改為簡并堿基R,合成1對特異性引物和1條TaqMan探針;根據(jù)KHVORF7基因保守序列,設(shè)計1對特異性引物和1條TaqMan探針;分別使用FAM和VIC作為探針報告基團,BHQ1作為探針淬滅基團;
所述CEV P4a基因序列對引物序列進(jìn)行優(yōu)化的下游引物為CEV-R,所述優(yōu)化后的CEV-R序列為 RATTCCTCAAGGAGTTDCAGTAAA;
所述CEV P4a基因序列對引物序列進(jìn)行優(yōu)化的上游引物為CEV-F,所述優(yōu)化后的CEV-F序列為WGTTTTGTAKATTGTAGCATTTCC;
所述CEV P4a基因序列探針為CEV-Probe,所述CEV-Probe序列為FAM-AGAGTTTGTTTCTTGCCATACAAACT-BHQ1;
所述KHV ORF7基因保守序列設(shè)計的下游引物為KHV-R,所述KHV-R序列為CACGGATCTTCTATGCTACA;
所述KHV ORF7基因保守序列設(shè)計的上游引物為KHV-F,所述KHV-F序列為TTGTTGTGCGTTGATGTTC;
所述KHV-Probe序列為VIC-CTTGACGGCACTCGTCGAGCCGTAGCCC-BHQ1;
第二、確定反應(yīng)體系及條件:
采用20 μL反應(yīng)體系,2×Probe PCR Master Mix 10μL,上、下游引物和探針終濃度在0.2μmol/L~0.8μmol/L之間,QN ROX 參考染料0.1μL,模板2.5μL,DEPC水補足20μL;反應(yīng)程序為:95 ℃預(yù)變性2 min,1個循環(huán);95 ℃ 5 s,50~60 ℃退火31 s,40個循環(huán)。
2.如權(quán)利要求1所述的鯉浮腫病毒和錦鯉皰疹病毒雙重實時熒光定量PCR檢測方法,其特征在于,反應(yīng)體系確定為:2×Probe PCR Master Mix 10μL,CEV上、下游引物終濃度0.6μmol/L,探針終濃度0.3μmol/L,KHV上、下游引物終濃度0.4 μmol/L,探針終濃度0.2μmol/L,QN ROX 參考染料0.1 μL;模板2.5 μL,DEPC水補足20 μL;反應(yīng)程序為:95 ℃預(yù)變性2min,1個循環(huán);95 ℃ 5 s,56 ℃退火31 s,40個循環(huán)。
3.如權(quán)利要求1所述的鯉浮腫病毒和錦鯉皰疹病毒雙重實時熒光定量PCR檢測方法,其特征在于,所述的鯉浮腫病毒和錦鯉皰疹病毒雙重實時熒光定量PCR檢測方法對CEV和KHV的靈敏度為15 copies/μL。
4.如權(quán)利要求1所述的鯉浮腫病毒和錦鯉皰疹病毒雙重實時熒光定量PCR檢測方法,其特征在于,所述的鯉浮腫病毒和錦鯉皰疹病毒雙重實時熒光定量PCR檢測方法與單重實時熒光定量PCR擴增所獲得的Ct值的變異系數(shù)小于3%。
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