[發明專利]一種細胞計數方法、系統、裝置和存儲介質有效
| 申請號: | 201910151420.2 | 申請日: | 2019-02-28 |
| 公開(公告)號: | CN109903282B | 公開(公告)日: | 2023-06-09 |
| 發明(設計)人: | 趙拴平;賈玉堂;徐磊;金海 | 申請(專利權)人: | 安徽省農業科學院畜牧獸醫研究所 |
| 主分類號: | G06T7/00 | 分類號: | G06T7/00;G06V20/69;G06V10/82;G06N3/0464;G06N3/0475;G06N3/094 |
| 代理公司: | 廣州嘉權專利商標事務所有限公司 44205 | 代理人: | 胡輝 |
| 地址: | 230031 安*** | 國省代碼: | 安徽;34 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 細胞 計數 方法 系統 裝置 存儲 介質 | ||
1.一種細胞計數方法,其特征在于,包括以下步驟:
將待計數細胞圖像輸入到深度學習網絡中,返回所述深度學習網絡輸出的細胞計數值;所述細胞計數值用于表示所述待計數細胞圖像中所包含的細胞數量;所述深度學習網絡經過使用訓練數據集進行的訓練;所述訓練數據集包括人工生成的多組標準細胞實體圖像、標準細胞位置圖像、標準細胞密度圖像、標準標記細胞數目以及使用生成式對抗網絡生成的多組細胞實體圖像、細胞位置圖像、細胞密度圖像和標記細胞數目;
所述深度學習網絡包括第一分支、第二分支、卷積層和全連接層,所述第一分支和第二分支均由卷積層組成;所述深度學習網絡用于執行以下操作:
所述第一分支中的卷積層用于執行如下操作:對待計數細胞圖像進行處理,輸出與待計數細胞對應的細胞位置圖像;
所述第二分支中的卷積層用于執行如下操作:對待計數細胞圖像進行處理,輸出與待計數細胞對應的細胞密度圖像;細胞位置圖像與細胞密度圖像進行特征串聯后輸入到卷積層中,經過卷積層與全連接層依次進行的處理,最終輸出細胞計數值;
所述生成式對抗網絡包括判別網絡和生成網絡,所述生成網絡用于生成訓練數據集,所述判別網絡和生成網絡經過多輪包括以下步驟的交替學習:
生成灰度圖像并對灰度圖像進行隨機選點和二值化處理,將經過處理的灰度圖像作為細胞位置圖像進行返回;所述隨機選點用于在所述灰度圖像上隨機選擇像素點,并將被選擇的像素點的數量作為標記細胞數目進行記錄;所述二值化處理用于將被選擇的像素點設為第一灰度值,將未被選擇的像素點設為第二灰度值;
使用生成網絡根據細胞位置圖像生成細胞實體圖像;所述細胞實體圖像中包括多個細胞實體,各所述細胞實體的中心與細胞位置圖像上的具有第一灰度值的像素點一一對應;
將所述細胞位置圖像與細胞實體圖像串聯輸入至判別網絡,從而輸出判別結果。
2.根據權利要求1所述的一種細胞計數方法,其特征在于,所述細胞密度圖像是通過以下步驟生成的:
以所述細胞位置圖像上的具有第一灰度值的各像素點為中心,使用高斯窗口函數對細胞位置圖像進行平滑化處理。
3.根據權利要求2所述的一種細胞計數方法,其特征在于,所述第一灰度值為255,所述第二灰度值為0。
4.根據權利要求2所述的一種細胞計數方法,其特征在于,各所述高斯窗口為圓形。
5.一種細胞計數裝置,其特征在于,包括圖像獲取裝置、存儲器和處理器,所述圖像獲取裝置用于獲取待計數細胞圖像并將所述待計數細胞圖像傳送到處理器,所述存儲器用于存儲至少一個程序,所述處理器用于加載所述至少一個程序以執行權利要求1-4中任一項所述方法。
6.一種存儲介質,其中存儲有處理器可執行的指令,其特征在于,所述處理器可執行的指令在由處理器執行時用于執行如權利要求1-4中任一項所述方法。
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