[發明專利]用于預測結直腸癌術后復發與轉移的檢測組合物、檢測裝置、檢測試劑盒及應用

有效

• 申請號: 201910101233.3
• 申請日: 2019-01-31
• 公開（公告）號: CN111500715B
• 公開（公告）日: 2022-03-11
• 發明（設計）人: 陳興;韓夢婷;黃蓉冰
• 申請（專利權）人: 北京大學
• 主分類號: C12Q1/6886
• 分類號: C12Q1/6886;C12N15/11
• 代理公司: 北京康信知識產權代理有限責任公司 11240
• 代理人: 韓建偉

本發明公開了一種用于預測結直腸癌術后復發與轉移的檢測組合物、檢測裝置、檢測試劑盒及應用。該檢測組合物包括用于檢測OGA外顯子11可變剪切發生情況的試劑。本發明的發明人首次發現了OGA的一種新的剪切異構體tOGA，形成tOGA剪切異構體的外顯子11的可變剪切(外顯子跳讀)受到O?GlcNAc修飾的顯著調控。對于術前未進行過化療的結直腸癌患者，該標志物在其腫瘤組織中相對于癌旁組織和正常腸組織中具有明顯差異，而且該標志物與腫瘤的復發與轉移具有相關性，因此，OGA外顯子11可變剪切(外顯子跳讀)的發生情況可以作為預測結直腸癌術后復發與轉移的分子標志物。

技術領域

本發明涉及生物技術領域，具體而言，涉及一種用于預測結直腸癌術后復發與轉移的檢測組合物、檢測裝置、檢測試劑盒及應用。

背景技術

結直腸癌(Colorectal cancer，CRC)是全球第三大常見癌癥，其死亡率居惡性腫瘤死因的第二位。結直腸癌早期癥狀不明顯，隨著癌腫的增大而表現排便習慣改變、便血、腹瀉、腹瀉與便秘交替、局部腹痛等癥狀，晚期則表現貧血、體重減輕等全身癥狀。結直腸癌發病率和病死率在消化系統惡性腫瘤中僅次于胃癌、食管癌和原發性肝癌。結直腸癌治療失敗的主要原因是肝轉移。無肝轉移的結直腸癌患者治療后的5年生存率達70％以上，而發生肝轉移的患者治療后的5年生存率不足40％，而目前并沒有可靠的預測轉移的生物標志物投入臨床應用。

目前，文獻報道的預測結直腸癌術后復發與轉移的分子標志物主要是病人血清和腫瘤組織中的microRNA，如MiR-139-5p(Sci Rep 7,43393(2017))，microRNA-203(Gut 66,654-665 (2017))和microRNA-200c(Gut 62,1315-1326(2013))等。但是，這些分子標記物存在一定的缺點，主要缺點是預測的準確度不夠高，測定結果不穩定，而且具體的作用機制并不清楚，理論基礎尚不完善。

發明內容

本發明旨在提供一種用于預測結直腸癌術后復發與轉移的檢測組合物、檢測裝置、檢測試劑盒及應用，以提高預測結直腸癌術后復發與轉移的準確性。

為了實現上述目的，根據本發明的一個方面，提供了一種用于預測結直腸癌術后復發與轉移的檢測組合物。該檢測組合物包括用于檢測OGA外顯子11可變剪切發生情況的試劑。

進一步地，試劑包括用于檢測OGA外顯子11可變剪切發生情況的引物和/或探針。

進一步地，引物具有如SEQ ID NO：1、SEQ ID NO：2、SEQ ID NO：3和SEQ ID NO： 4所示的核苷酸序列。

根據本發明的另一個方面，提供了一種用于預測結直腸癌術后復發與轉移的檢測裝置。該檢測裝置包括：樣本獲取模塊，用于獲取腫瘤組織、癌旁組織和正常腸組織；檢測模塊，用于檢測腫瘤組織、癌旁組織和正常腸組織內OGA外顯子11可變剪切發生情況；數據分析模塊，用于對比分析腫瘤組織、癌旁組織和正常腸組織內OGA外顯子11可變剪切發生情況；以及輸出模塊，輸出數據分析模塊得到的結果。

進一步地，檢測模塊通過qPCR或RT-PCR進行檢測。

進一步地，檢測模塊中用于qPCR或RT-PCR檢測的引物具有如SEQ ID NO：1、SEQ IDNO：2、SEQ ID NO：3和SEQ ID NO：4所示的核苷酸序列。

進一步地，OGA的一種剪切異構體記作tOGA；檢測模塊中測得的tOGA和OGA的表達量在數據分析模塊中進行相對含量r＝tOGA/OGA計算，腫瘤組織的r記作r(T)，癌旁組織的r記作r(P)，正常腸組織的r記作r(N)，數據分析模塊根據r(T)、r(P)和r(N)預測腫瘤在術后復發和轉移的可能性。

進一步地，當數據分析模塊得出r(T)/r(N)≤0.5且r(T)/r(P)≤0.5且0.7r(P) /r(N)1.4，輸出模塊輸出患者術后復發和轉移的可能性較高。