[發(fā)明專利]一種解析混合物中單體化合物結(jié)構(gòu)的方法在審
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 201910033608.7 | 申請(qǐng)日: | 2019-01-15 |
| 公開(公告)號(hào): | CN109632860A | 公開(公告)日: | 2019-04-16 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 胡凱鋒;李興;羅歡;黃滔;徐莉;施孝活 | 申請(qǐng)(專利權(quán))人: | 中國(guó)科學(xué)院昆明植物研究所 |
| 主分類號(hào): | G01N24/08 | 分類號(hào): | G01N24/08;G01N30/88 |
| 代理公司: | 昆明協(xié)立知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所(普通合伙) 53108 | 代理人: | 馬曉青 |
| 地址: | 650201 *** | 國(guó)省代碼: | 云南;53 |
| 權(quán)利要求書: | 查看更多 | 說(shuō)明書: | 查看更多 |
| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 單體化合物 去卷積 解析 混合物 列表數(shù)據(jù) 前處理 工具箱 負(fù)離子模式 混合物樣品 結(jié)構(gòu)信息 時(shí)間信息 相關(guān)信息 樣品制備 語(yǔ)言腳本 代謝組 批量化 碳原子 重構(gòu)的 腳本 重構(gòu) 統(tǒng)計(jì) 虛擬 采集 融合 保留 分析 開發(fā) | ||
1.一種解析混合物中單體化合物結(jié)構(gòu)的方法,基于同一化合物的NMR和LC-MS信號(hào)隨其在不同混合物中的濃度變化而變化的相關(guān)性,利用統(tǒng)計(jì)相關(guān)方法,可從混合物樣品的NMR和LC-MS圖譜中提取出單個(gè)組分的NMR和LC-MS信號(hào),實(shí)現(xiàn)單個(gè)組分化學(xué)結(jié)構(gòu)的解析。
2.一種解析混合物中單體化合物結(jié)構(gòu)的方法,該方法包括下述步驟:
(1)樣品制備:稱取適量的代謝物標(biāo)準(zhǔn)品(亮氨酸、谷胺酰胺、牛磺酸、肌酐、甜菜堿和煙酰胺),加水溶解,分別制備成一定濃度的儲(chǔ)備液,其中亮氨酸100mM/L、谷胺酰胺200mM/L,其余均為500mM/L;用水稀釋儲(chǔ)備液制備各化合物不同濃度的10個(gè)模式混合物樣品,均分成兩等份,冷凍干燥,一份樣品用PBS重水溶液重溶解,用于采集NMR數(shù)據(jù);另一份用超純水重溶解,再用50%乙腈-水溶液稀釋1000倍,用于采集正、負(fù)離子模式的LC-MS數(shù)據(jù),同時(shí)制備各化合物的單組分溶液,用于采集單體化合物的NMR和LC-MS參照譜圖;
(2)NMR數(shù)據(jù)采集:10個(gè)模式混合物樣品分別采集1D 13C、DEPT90、DEPT135、2D 1H-13CHSQC和TOCSY譜;
(3)LC-MS數(shù)據(jù)采集:采用安捷倫1290超高壓液相色譜儀聯(lián)用配置電噴霧離子源的布魯克micrOTOF QII質(zhì)譜儀進(jìn)行LC-MS數(shù)據(jù)采集,用ZORBAX HILIC色譜柱(2.1×150mm,1.8μm)進(jìn)行色譜分離,以0.1%甲酸的水和0.1%甲酸的乙腈為流動(dòng)相進(jìn)行梯度洗脫。采集正、負(fù)離子模式質(zhì)譜數(shù)據(jù),質(zhì)譜霧化氣壓設(shè)為1.0bar,干燥氣4.5L/min,溫度200℃,質(zhì)量范圍50-500m/z。用ESI-L tuning mix校正液對(duì)質(zhì)譜進(jìn)行校正;
(4)NMR數(shù)據(jù)處理:用TopSpin3.5進(jìn)行補(bǔ)零、傅立葉變換、相位和基線校正,再用Matlab代謝組工具箱進(jìn)行峰識(shí)別或劃框,獲得NMR信號(hào)變量列表;
(5)LC-MS數(shù)據(jù)處理:用XCMS進(jìn)行峰識(shí)別、峰匹配和對(duì)齊;用CAMERA包對(duì)XCMS處理數(shù)據(jù)進(jìn)行注釋,去同位素信號(hào),信號(hào)過(guò)濾,最終獲得LC-MS信號(hào)變量列表;
(6)統(tǒng)計(jì)相關(guān)分析:采用自主開發(fā)的Matlab腳本完成數(shù)據(jù)融合(NMR和LC-MS)及統(tǒng)計(jì)相關(guān)分析;
(7)結(jié)構(gòu)解析:根據(jù)單組分重構(gòu)譜圖所提供的各種結(jié)構(gòu)信息,解析單組分的化學(xué)結(jié)構(gòu);
(8)方法驗(yàn)證:提取單組分信息,重構(gòu)單組分核磁以及質(zhì)譜譜圖,與參照譜圖比較,驗(yàn)證結(jié)構(gòu)解析的可靠性。
3.如權(quán)利要求1或2所述的一種解析混合物中單體化合物結(jié)構(gòu)的方法,其特征在于一系列模式混合物樣品中各組分的濃度獨(dú)立變化且各組分間的濃度相關(guān)系數(shù)絕對(duì)值小于0.2。
4.如權(quán)利要求1或2所述的一種解析混合物中單體化合物結(jié)構(gòu)的方法,其特征在于該方法結(jié)合NMR提供的碳原子化學(xué)位移、氫-碳連接關(guān)系、氫-氫相關(guān)等信息和LC-MS提供的精確分子量、保留時(shí)間等信息,利用NMR和LC-MS信號(hào)的統(tǒng)計(jì)相關(guān)性,可從混合物樣品的NMR和LC-MS圖譜中去卷積提取獲得單個(gè)組分的信號(hào),進(jìn)行單組分的化學(xué)結(jié)構(gòu)解析。
5.如權(quán)利要求1或2所述的一種解析混合物中單體化合物結(jié)構(gòu)的方法,其特征在于該方法不同于傳統(tǒng)天然產(chǎn)物物理分離純化的策略,而是通過(guò)統(tǒng)計(jì)相關(guān)分析策略直接從混合物樣品的NMR和LC-MS數(shù)據(jù)中虛擬分離獲得單個(gè)組分的NMR和LC-MS圖譜。
6.如權(quán)利要求1或2所述的一種解析混合物中單體化合物結(jié)構(gòu)的方法,其特征在于該方法從一系列混合物樣品NMR和LC-MS數(shù)據(jù)中去卷積獲得單個(gè)組分的NMR和MS圖譜,與該組分的實(shí)際NMR和MS圖譜進(jìn)行比對(duì),兩者高度一致,說(shuō)明該方法獲得結(jié)果是可靠的。
7.如權(quán)利要求1或2所述的一種解析混合物中單體化合物結(jié)構(gòu)的方法,其特征在于該方法使用Matlab和R語(yǔ)言腳本,靈活地批量處理數(shù)據(jù)和可視化單個(gè)組分的去卷積NMR和MS圖譜,高效直觀。
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